MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0594.1 Hoxa9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 172 E= 0 0.197674 0.308140 0.470930 0.023256 0.069767 0.639535 0.029070 0.261628 0.220930 0.680233 0.000000 0.098837 0.936047 0.017442 0.046512 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.587209 0.337209 0.046512 0.029070 0.912791 0.034884 0.000000 0.052326 0.994186 0.005814 0.000000 0.000000 0.029070 0.000000 0.005814 0.965116 0.040698 0.895349 0.000000 0.063953 0.761628 0.063953 0.000000 0.174419 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0594.1