>MA0873.1	HOXD12
A  [   629    485      1      3    207      1   1367   1367   1367   1367    538 ]
C  [   155    387     49   1367      2     10      0      0      0    185    482 ]
G  [   525   1367      8      5   1367      0      2      3      6     48     77 ]
T  [    58     12   1367      0      0   1367    222      0     44    317    271 ]
>MA0909.1	HOXD13
A  [    50     12    688    688      0    688    688    688    688    243 ]
C  [   688    403    347      0      1      0      3      1     75    207 ]
G  [   294      4      0     27      0      0      0      0     34     73 ]
T  [    55    285     94     29    688    110      4      0     56    165 ]
>MA0909.2	HOXD13
A  [    45     65      0    368    368      6    368    368    368    368     60 ]
C  [   182    368    368    140      0      0      0      0     73    249    303 ]
G  [   129    329      0      0      5      0      0     12      0     13      3 ]
T  [    12      0      0      0      0    368      0      0      0      0      2 ]
>MA0912.2	HOXD3
A  [   276      0  14562  14562      0      0  14562    714 ]
C  [ 11615     94    742      0      0      0      0   8987 ]
G  [   827      0      0      0      0   4453   2198   3187 ]
T  [  2947  14562      0      0  14562  14562      0   1674 ]
>MA1507.1	HOXD4
A  [  1186      0   1542   3405      0      0   3405   1102 ]
C  [   705   1184   1862      0      0      0      0    525 ]
G  [  1155      0      0    176      0      0    194   1147 ]
T  [   359   3405      0      0   3405   3405      0    631 ]
>MA0910.2	HOXD8
A  [   537      0   3629   3629      0    178   3629    943 ]
C  [   405   2150   3006      0      0      0      0   1683 ]
G  [  2287      0     47      0      0    507      0    551 ]
T  [   399   1480      0      0   3629   3629      0    452 ]
>MA0913.2	HOXD9
A  [  1300      0  16363  16363    215  16363  16363  16363  16363   4149 ]
C  [   872   9773   8643    226      0      8      0      0   2202   5804 ]
G  [ 16363     42    675    439      0      0      0      0   1216   2169 ]
T  [   655   6590    927      4  16363   5445    123      0   2194   4241 ]
>MA0319.1	HSF1
A  [    69      2     19      0    100    100      6     48 ]
C  [    13      2      0      0      0      0     56     11 ]
G  [    13      2     81    100      0      0     19     23 ]
T  [     6     95      0      0      0      0     19     17 ]
>MA0486.1	HSF1
A  [    25      8      3      1      4    128      0    187    186     44     39     13      8      0      6 ]
C  [    82     26     11    222     71      7      0     24      6     63     62     16      5    218     88 ]
G  [    56     12      8      2      6     89    225      3     15     73     67      9      4      2     18 ]
T  [    62    179    203      0    144      1      0     11     18     45     57    187    208      5    113 ]
>MA0486.2	HSF1
A  [    64     11      9      4   1455      0   1455   1455     70    490     25      6      3 ]
C  [    18      4   1455    361    424      0      8      4    713    190      5      2   1455 ]
G  [    25     17      9    238    384   1455      2      4    159    592      0      4      3 ]
T  [  1455   1455      5   1455      3      0      7     27    515    183   1455   1455      4 ]