MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0901.1 HOXB13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 3737 E= 0 0.074124 0.744180 0.138614 0.043083 0.032204 0.772071 0.003887 0.191838 0.644645 0.231803 0.002782 0.120770 0.944312 0.007470 0.012903 0.035314 0.000000 0.002511 0.000000 0.997489 0.887648 0.007022 0.008299 0.097032 0.993924 0.000000 0.000000 0.006076 0.966632 0.026764 0.000348 0.006257 0.723465 0.143080 0.043704 0.089750 0.355268 0.364617 0.069040 0.211075 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0901.1 MOTIF MA0901.2 HOXB13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 78714 E= 0 0.398366 0.137955 0.165993 0.297685 0.345644 0.168649 0.193180 0.292527 0.151129 0.605661 0.115558 0.127652 0.053510 0.829738 0.007394 0.109358 0.843675 0.058579 0.004459 0.093287 0.927967 0.009223 0.024303 0.038506 0.005348 0.006987 0.007445 0.980220 0.935183 0.006644 0.013759 0.044414 0.965483 0.007610 0.006225 0.020682 0.966499 0.009655 0.007940 0.015906 0.892217 0.031316 0.023909 0.052557 0.291791 0.157723 0.093706 0.456780 0.332292 0.167086 0.149389 0.351234 0.319778 0.170122 0.154547 0.355553 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0901.2 MOTIF MA0902.1 HOXB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 6678 E= 0 0.282570 0.225367 0.267296 0.224768 0.214254 0.286570 0.326995 0.172181 0.129120 0.249475 0.046414 0.574991 0.575861 0.302261 0.095057 0.026821 0.912058 0.025536 0.051482 0.010924 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.058104 0.093522 0.006554 0.841820 0.919972 0.024518 0.004683 0.050826 0.324599 0.195987 0.313071 0.166342 0.239707 0.321306 0.236712 0.202276 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0902.1 MOTIF MA0902.2 HOXB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 6826 E= 0 0.118224 0.298564 0.428509 0.154703 0.007415 0.412038 0.000000 0.580547 0.662687 0.317997 0.019317 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.215558 0.784442 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.186493 0.297539 0.429681 0.086288 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0902.2 MOTIF MA0903.1 HOXB3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 12899 E= 0 0.348864 0.195829 0.244283 0.211024 0.198015 0.321368 0.310513 0.170104 0.114383 0.326556 0.039614 0.519446 0.539906 0.353748 0.058057 0.048289 0.900391 0.038043 0.044674 0.016892 0.000000 0.011495 0.000000 0.988505 0.031102 0.059172 0.000000 0.909726 0.949014 0.008755 0.000000 0.042231 0.352120 0.164276 0.366850 0.116753 0.248004 0.309714 0.231103 0.211179 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0903.1 MOTIF MA1499.1 HOXB4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 11478 E= 0 0.407998 0.119969 0.383081 0.088953 0.000000 0.188053 0.000000 0.811947 0.398789 0.601211 0.000000 0.000000 0.971643 0.000000 0.028357 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.028981 0.971019 0.993979 0.000000 0.006021 0.000000 0.370211 0.118633 0.394291 0.116865 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1499.1 MOTIF MA0904.2 HOXB5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3068 E= 0 0.124185 0.365059 0.414928 0.095828 0.000000 0.149001 0.000000 0.850999 0.748414 0.251586 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.001442 0.006250 0.255048 0.737260 0.844671 0.000000 0.155329 0.000000 0.082464 0.397327 0.373533 0.146675 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0904.2 MOTIF MA1500.1 HOXB6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 9944 E= 0 0.136464 0.248190 0.240849 0.374497 0.000000 0.102869 0.000000 0.897131 0.836418 0.087397 0.000000 0.076185 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.059279 0.098844 0.841876 0.034563 0.079417 0.354974 0.531046 0.505168 0.000000 0.494832 0.000000 0.087701 0.617845 0.126412 0.168042 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1500.1 MOTIF MA1501.1 HOXB7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 828 E= 0 0.227053 0.173913 0.458937 0.140097 0.000000 0.000000 0.904918 0.095082 0.000000 0.289984 0.041195 0.668821 0.788571 0.211429 0.000000 0.000000 0.966161 0.033839 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.036088 0.963912 0.086813 0.003297 0.000000 0.909890 0.845761 0.000000 0.154239 0.000000 0.391304 0.199275 0.323671 0.085749 0.159420 0.427536 0.301932 0.111111 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1501.1 MOTIF MA1502.1 HOXB8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 4474 E= 0 0.116674 0.119803 0.621144 0.142378 0.000000 0.572195 0.000000 0.427805 0.563689 0.425098 0.011213 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.053585 0.000000 0.102264 0.844151 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.262405 0.380867 0.185516 0.171211 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1502.1