MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1425.1 HYH letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 999 E= 0 0.201201 0.201201 0.396396 0.201201 0.373119 0.152457 0.321966 0.152457 0.283567 0.072144 0.072144 0.572144 0.023046 0.350701 0.524048 0.102204 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.048144 0.154463 0.749248 0.048144 0.203407 0.097194 0.392786 0.306613 0.177533 0.467402 0.177533 0.177533 0.321321 0.226226 0.226226 0.226226 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1425.1 MOTIF MA0092.1 Hand1::Tcf3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 29 E= 0 0.137931 0.275862 0.344828 0.241379 0.344828 0.000000 0.517241 0.137931 0.068966 0.068966 0.034483 0.827586 0.000000 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.103448 0.862069 0.034483 0.310345 0.482759 0.034483 0.172414 0.551724 0.000000 0.103448 0.344828 0.172414 0.137931 0.137931 0.551724 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0092.1 MOTIF PB0028.1 Hbp1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.346535 0.178218 0.158416 0.316832 0.240000 0.300000 0.230000 0.230000 0.300000 0.180000 0.190000 0.330000 0.414141 0.141414 0.101010 0.343434 0.030303 0.020202 0.000000 0.949495 0.020000 0.330000 0.640000 0.010000 0.970000 0.000000 0.010000 0.020000 0.979798 0.000000 0.000000 0.020202 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.010000 0.020000 0.930000 0.040000 0.760000 0.000000 0.230000 0.010000 0.870000 0.040000 0.070000 0.020000 0.111111 0.111111 0.040404 0.737374 0.190000 0.150000 0.440000 0.220000 0.370000 0.150000 0.260000 0.220000 0.220000 0.260000 0.240000 0.280000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0028.1 MOTIF PB0132.1 Hbp1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.150000 0.200000 0.340000 0.262626 0.151515 0.333333 0.252525 0.180000 0.140000 0.290000 0.390000 0.050000 0.360000 0.180000 0.410000 0.090909 0.727273 0.090909 0.090909 0.101010 0.727273 0.040404 0.131313 0.059406 0.782178 0.029703 0.128713 0.900000 0.020000 0.020000 0.060000 0.040404 0.040404 0.020202 0.898990 0.040404 0.010101 0.010101 0.939394 0.100000 0.030000 0.710000 0.160000 0.059406 0.049505 0.138614 0.752475 0.300000 0.280000 0.320000 0.100000 0.260000 0.260000 0.200000 0.280000 0.565657 0.121212 0.191919 0.121212 0.100000 0.360000 0.310000 0.230000 0.270000 0.230000 0.200000 0.300000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0132.1 MOTIF PH0037.1 Hdx letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.313131 0.202020 0.212121 0.272727 0.340000 0.180000 0.260000 0.220000 0.049505 0.089109 0.514851 0.346535 0.200000 0.120000 0.350000 0.330000 0.297030 0.306931 0.158416 0.237624 0.212121 0.020202 0.727273 0.040404 0.700000 0.230000 0.050000 0.020000 0.830000 0.010000 0.060000 0.100000 0.910891 0.009901 0.029703 0.049505 0.020000 0.020000 0.030000 0.930000 0.030000 0.900000 0.040000 0.030000 0.868687 0.040404 0.010101 0.080808 0.178218 0.217822 0.158416 0.445545 0.230000 0.330000 0.200000 0.240000 0.138614 0.297030 0.306931 0.257426 0.336634 0.346535 0.059406 0.257426 0.400000 0.230000 0.190000 0.180000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0037.1 MOTIF MA1099.1 Hes1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.187000 0.258000 0.377000 0.178000 0.209000 0.299000 0.396000 0.096000 0.040000 0.875000 0.014000 0.071000 0.743744 0.033033 0.141141 0.082082 0.029000 0.833000 0.056000 0.082000 0.164835 0.040959 0.768232 0.025974 0.115884 0.469530 0.066933 0.347652 0.058000 0.113000 0.661000 0.168000 0.226000 0.302000 0.151000 0.321000 0.217217 0.384384 0.198198 0.200200 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1099.1 MOTIF MA0616.1 Hes2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 999 E= 0 0.214214 0.214214 0.214214 0.357357 0.341341 0.197197 0.197197 0.264264 0.341341 0.197197 0.197197 0.264264 0.245000 0.333000 0.245000 0.177000 0.083000 0.152000 0.682000 0.083000 0.603000 0.000000 0.397000 0.000000 0.282000 0.718000 0.000000 0.000000 0.930000 0.000000 0.070000 0.000000 0.174000 0.754000 0.036000 0.036000 0.123000 0.053000 0.771000 0.053000 0.053000 0.053000 0.053000 0.841000 0.143000 0.073000 0.711000 0.073000 0.238000 0.428000 0.167000 0.167000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0616.1 MOTIF MA0739.1 Hic1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 12392 E= 0 0.511378 0.058021 0.376856 0.053744 0.005361 0.036493 0.006313 0.951833 0.074639 0.046197 0.864786 0.014378 0.004473 0.984702 0.010825 0.000000 0.007861 0.983295 0.002769 0.006075 0.795268 0.176481 0.000265 0.027986 0.557827 0.180431 0.205960 0.055783 0.079510 0.717349 0.106165 0.096976 0.146257 0.438045 0.171148 0.244549 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0739.1 MOTIF PB0029.1 Hic1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.210000 0.250000 0.260000 0.138614 0.326733 0.217822 0.316832 0.150000 0.240000 0.270000 0.340000 0.653465 0.009901 0.316832 0.019802 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.040000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 0.979798 0.020202 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.920000 0.070000 0.000000 0.010000 0.580000 0.210000 0.120000 0.090000 0.009901 0.920792 0.029703 0.039604 0.030000 0.800000 0.050000 0.120000 0.200000 0.190000 0.170000 0.440000 0.404040 0.151515 0.292929 0.151515 0.200000 0.410000 0.150000 0.240000 0.242424 0.333333 0.141414 0.282828 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0029.1 MOTIF PB0133.1 Hic1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.202020 0.151515 0.363636 0.282828 0.110000 0.240000 0.440000 0.210000 0.210000 0.180000 0.380000 0.230000 0.240000 0.150000 0.300000 0.310000 0.310000 0.030000 0.590000 0.070000 0.009901 0.009901 0.009901 0.970297 0.128713 0.009901 0.851485 0.009901 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.019802 0.960396 0.009901 0.009901 0.560000 0.170000 0.110000 0.160000 0.590000 0.040000 0.070000 0.300000 0.303030 0.191919 0.222222 0.282828 0.300000 0.250000 0.210000 0.240000 0.280000 0.160000 0.310000 0.250000 0.267327 0.267327 0.297030 0.168317 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0133.1