MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1107.1 KLF9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 5754 E= 0 0.306917 0.203163 0.328815 0.161105 0.165450 0.251825 0.494786 0.087939 0.215676 0.675356 0.061522 0.047445 0.004171 0.983490 0.006778 0.005561 0.937261 0.042579 0.012513 0.007647 0.004171 0.977233 0.013730 0.004866 0.801877 0.020507 0.157108 0.020507 0.007125 0.961244 0.021550 0.010080 0.079944 0.887904 0.016858 0.015294 0.009559 0.960028 0.009211 0.021203 0.612096 0.238443 0.058220 0.091241 0.082030 0.571081 0.171011 0.175878 0.210115 0.382343 0.150156 0.257386 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1107.1 MOTIF MA1107.2 KLF9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 25579 E= 0 0.209508 0.407053 0.203292 0.180148 0.313343 0.199695 0.304117 0.182845 0.111889 0.169749 0.658822 0.059541 0.182337 0.697408 0.064897 0.055358 0.011220 0.965988 0.011377 0.011416 0.856132 0.100043 0.027679 0.016146 0.008640 0.972008 0.013800 0.005551 0.750108 0.041831 0.169670 0.038391 0.008757 0.952539 0.028735 0.009969 0.094922 0.864655 0.023652 0.016772 0.005708 0.964932 0.008014 0.021346 0.736424 0.169631 0.033309 0.060636 0.030963 0.807068 0.069510 0.092459 0.271629 0.343915 0.128582 0.255874 0.160679 0.411275 0.172915 0.255131 0.229681 0.372141 0.222096 0.176082 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1107.2 MOTIF PF0116.1 KMCATNNWGGA letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 376 E= 0 0.000000 0.000000 0.656915 0.343085 0.151596 0.848404 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.093085 0.356383 0.242021 0.308511 0.074468 0.172872 0.151596 0.601064 0.303191 0.000000 0.000000 0.696809 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0116.1 MOTIF PF0120.1 KRCTCNNNNMANAGC letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 536 E= 0 0.000000 0.000000 0.970149 0.029851 0.014925 0.000000 0.985075 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.016791 0.027985 0.000000 0.955224 0.046642 0.007463 0.386194 0.559701 0.492537 0.022388 0.013060 0.472015 0.483209 0.000000 0.050373 0.466418 0.611940 0.388060 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.018657 0.042910 0.936567 0.001866 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0120.1 MOTIF PF0112.1 KTGGYRSGAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 308 E= 0 0.000000 0.000000 0.474026 0.525974 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.798701 0.000000 0.201299 0.168831 0.000000 0.831169 0.000000 0.000000 0.217532 0.782468 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0112.1 MOTIF MA1398.1 KUA1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 599 E= 0 0.375626 0.198664 0.086811 0.338898 0.317195 0.203673 0.111853 0.367279 0.462437 0.121870 0.105175 0.310518 0.484140 0.075125 0.153589 0.287145 0.126878 0.475793 0.080134 0.317195 0.227045 0.500835 0.095159 0.176962 0.018364 0.073456 0.000000 0.908180 0.018364 0.010017 0.025042 0.946578 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.879800 0.000000 0.120200 0.736227 0.006678 0.123539 0.133556 0.357262 0.210351 0.046745 0.385643 0.509182 0.026711 0.015025 0.449082 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1398.1 MOTIF MA1398.2 KUA1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1817 E= 0 0.480462 0.106769 0.150248 0.262521 0.180517 0.330215 0.116125 0.373143 0.037975 0.862411 0.061640 0.037975 0.069895 0.033572 0.009906 0.886626 0.058888 0.022014 0.022565 0.896533 0.963676 0.015960 0.006054 0.014309 0.007705 0.007705 0.004953 0.979637 0.008255 0.974684 0.009356 0.007705 0.019263 0.826637 0.014860 0.139241 0.518987 0.056136 0.184370 0.240506 0.348376 0.207485 0.095762 0.348376 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1398.2 MOTIF MA0493.1 Klf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 526 E= 0 0.285171 0.144487 0.384030 0.186312 0.317490 0.076046 0.579848 0.026616 0.127376 0.752852 0.060837 0.058935 0.024715 0.876426 0.000000 0.098859 0.768061 0.224335 0.000000 0.007605 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.760456 0.000000 0.184411 0.055133 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.965779 0.000000 0.034221 0.532319 0.066540 0.000000 0.401141 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0493.1 MOTIF MA0742.1 Klf12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1585 E= 0 0.105363 0.022082 0.730599 0.141956 0.505023 0.010046 0.484932 0.000000 0.026989 0.948864 0.011364 0.012784 0.007246 0.971014 0.017391 0.004348 0.967120 0.030612 0.002268 0.000000 0.013081 0.981105 0.000000 0.005814 0.136076 0.000633 0.853165 0.010127 0.000000 0.994211 0.000000 0.005789 0.000000 0.969780 0.012363 0.017857 0.000000 0.982143 0.000000 0.017857 0.404738 0.118460 0.000000 0.476802 0.248175 0.228363 0.103233 0.420229 0.334419 0.259501 0.091205 0.314875 0.245361 0.191753 0.120619 0.442268 0.284664 0.220588 0.148109 0.346639 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0742.1 MOTIF MA0039.1 Klf4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 49 E= 0 0.367347 0.183673 0.040816 0.408163 0.673469 0.000000 0.265306 0.061224 0.612245 0.061224 0.306122 0.020408 0.469388 0.020408 0.387755 0.122449 0.265306 0.122449 0.591837 0.020408 0.408163 0.081633 0.469388 0.040816 0.734694 0.081633 0.102041 0.081633 0.653061 0.040816 0.265306 0.040816 0.265306 0.020408 0.673469 0.040816 0.040816 0.020408 0.938776 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0039.1