MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0949.1 ARR2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 999 E= 0
 0.174174  0.257257  0.394394  0.174174
 0.338000  0.572000  0.045000  0.045000
 0.214000  0.000000  0.786000  0.000000
 0.476476  0.000000  0.214214  0.309309
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.161838  0.075924  0.075924  0.686314
 0.204795  0.204795  0.204795  0.385614
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0949.1

MOTIF MA1100.1 ASCL1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 7052 E= 0
 0.214691  0.257374  0.369682  0.158253
 0.186614  0.398185  0.287720  0.127482
 0.619257  0.098128  0.178673  0.103942
 0.030062  0.024674  0.941435  0.003829
 0.003971  0.981282  0.011061  0.003687
 0.967102  0.008650  0.010635  0.013613
 0.002978  0.039705  0.950510  0.006807
 0.023398  0.899461  0.074163  0.002978
 0.007799  0.009784  0.010210  0.972206
 0.002552  0.003403  0.990783  0.003261
 0.047362  0.310976  0.499575  0.142087
 0.209444  0.306863  0.243619  0.240074
 0.217385  0.251276  0.351390  0.179949
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1100.1

MOTIF MA1100.2 ASCL1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 4414 E= 0
 0.287041  0.209787  0.338695  0.164477
 0.252269  0.098525  0.582262  0.066944
 0.000000  0.996838  0.000000  0.003162
 0.910272  0.032384  0.012376  0.044967
 0.016633  0.200218  0.685994  0.097155
 0.112465  0.680808  0.203641  0.003085
 0.025235  0.005133  0.025877  0.943755
 0.011571  0.000000  0.981976  0.006453
 0.032747  0.567068  0.150601  0.249584
 0.191027  0.336959  0.201450  0.270564
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1100.2

MOTIF MA1631.1 ASCL1(var.2)
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 34356 E= 0
 0.198888  0.343608  0.243655  0.213849
 0.260566  0.232798  0.250349  0.256287
 0.169868  0.193678  0.540692  0.095762
 0.005356  0.976889  0.009343  0.008412
 0.940593  0.016387  0.025032  0.017988
 0.004744  0.878129  0.093404  0.023722
 0.005705  0.972232  0.017668  0.004395
 0.010711  0.021539  0.014321  0.953429
 0.007306  0.012953  0.972494  0.007248
 0.011614  0.839562  0.079142  0.069682
 0.130690  0.520520  0.086331  0.262458
 0.206165  0.307224  0.260187  0.226423
 0.173827  0.349168  0.243218  0.233787
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1631.1

MOTIF MA0275.1 ASG1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 100 E= 0
 0.000000  0.760000  0.000000  0.240000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.727273  0.111111  0.161616  0.000000
 0.530000  0.000000  0.000000  0.470000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0275.1

MOTIF MA0276.1 ASH1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 263 E= 0
 0.000000  0.836502  0.030418  0.133080
 0.000000  0.989796  0.000000  0.010204
 0.271111  0.093333  0.591111  0.044444
 0.257778  0.240000  0.448889  0.053333
 0.706522  0.000000  0.293478  0.000000
 0.000000  0.066265  0.048193  0.885542
 0.146018  0.663717  0.035398  0.154867
 0.404040  0.000000  0.464646  0.131313
 0.000000  0.028986  0.902174  0.068841
 0.000000  0.000000  0.934307  0.065693
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0276.1

MOTIF UN0352.1 ASIL2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1399 E= 0
 0.343102  0.120086  0.200858  0.335954
 0.212294  0.150107  0.150107  0.487491
 0.023588  0.778413  0.023588  0.174410
 0.052895  0.007148  0.105075  0.834882
 0.008578  0.977127  0.010007  0.004289
 0.004289  0.994282  0.000000  0.001430
 0.010007  0.001430  0.987848  0.000715
 0.045032  0.043603  0.889207  0.022159
 0.017870  0.881344  0.005004  0.095783
 0.059328  0.042173  0.869907  0.028592
 0.609721  0.102931  0.162974  0.124375
 0.280915  0.299500  0.180129  0.239457
 0.280915  0.134382  0.320944  0.263760
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0352.1

MOTIF MA1661.1 AT-GTL1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1073 E= 0
 0.458527  0.088537  0.189189  0.263747
 0.292637  0.235788  0.118360  0.353215
 0.022367  0.006524  0.953402  0.017707
 0.039143  0.004660  0.950606  0.005592
 0.044734  0.002796  0.086673  0.865797
 0.279590  0.015843  0.068966  0.635601
 0.967381  0.004660  0.011184  0.016775
 0.962721  0.012116  0.009320  0.015843
 0.928239  0.010252  0.012116  0.049394
 0.889096  0.016775  0.021435  0.072693
 0.381174  0.117428  0.128611  0.372787
 0.331780  0.115564  0.179870  0.372787
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1661.1

MOTIF MA1259.1 AT1G01250
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 572 E= 0
 0.281469  0.131119  0.388112  0.199301
 0.298951  0.157343  0.293706  0.250000
 0.340909  0.202797  0.110140  0.346154
 0.356643  0.082168  0.216783  0.344406
 0.180070  0.127622  0.321678  0.370629
 0.020979  0.111888  0.012238  0.854895
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.069930  0.001748  0.045455  0.882867
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.001748  0.080420  0.000000  0.917832
 0.029720  0.012238  0.944056  0.013986
 0.283217  0.117133  0.538462  0.061189
 0.288462  0.260490  0.122378  0.328671
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1259.1

MOTIF MA1387.1 AT1G13300
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 596 E= 0
 0.392617  0.142617  0.216443  0.248322
 0.211409  0.110738  0.486577  0.191275
 0.436242  0.117450  0.154362  0.291946
 0.657718  0.080537  0.075503  0.186242
 0.169463  0.119128  0.057047  0.654362
 0.221477  0.506711  0.162752  0.109060
 0.241611  0.169463  0.419463  0.169463
 0.709732  0.053691  0.102349  0.134228
 0.919463  0.000000  0.033557  0.046980
 0.000000  0.000000  0.679530  0.320470
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.041946  0.036913  0.006711  0.914430
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.072148  0.419463  0.046980  0.461409
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1387.1

