MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA1366.1 AT1G76880
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 480 E= 0
 0.608333  0.081250  0.231250  0.079167
 0.210417  0.468750  0.081250  0.239583
 0.310417  0.062500  0.608333  0.018750
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.866667  0.000000  0.029167  0.104167
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.935417  0.006250  0.016667  0.041667
 0.791667  0.006250  0.000000  0.202083
 0.658333  0.064583  0.066667  0.210417
 0.397917  0.147917  0.152083  0.302083
 0.310417  0.085417  0.293750  0.310417
 0.341667  0.095833  0.195833  0.366667
 0.431250  0.097917  0.208333  0.262500
 0.516667  0.085417  0.110417  0.287500
 0.470833  0.106250  0.114583  0.308333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1366.1

MOTIF MA1260.1 AT1G77640
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 541 E= 0
 0.186691  0.147874  0.438078  0.227357
 0.251386  0.158965  0.353050  0.236599
 0.256932  0.238447  0.216266  0.288355
 0.208872  0.142329  0.471349  0.177449
 0.231054  0.146026  0.386322  0.236599
 0.236599  0.264325  0.170055  0.329020
 0.225508  0.085028  0.499076  0.190388
 0.251386  0.157116  0.358595  0.232902
 0.271719  0.282810  0.105360  0.340111
 0.260628  0.097967  0.373383  0.268022
 0.236599  0.072089  0.430684  0.260628
 0.109057  0.151571  0.018484  0.720887
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.205176  0.009242  0.245841  0.539741
 0.000000  0.998152  0.000000  0.001848
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.007394  0.020333  0.000000  0.972274
 0.005545  0.000000  0.994455  0.000000
 0.192237  0.083179  0.648799  0.075786
 0.365989  0.236599  0.110906  0.286506
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1260.1

MOTIF MA1380.1 AT2G20110
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 597 E= 0
 0.395310  0.000000  0.055276  0.549414
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.142379  0.857621
 0.000000  0.137353  0.000000  0.862647
 0.675042  0.000000  0.324958  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.152429  0.026801  0.000000  0.820771
 0.254606  0.160804  0.021776  0.562814
 0.013400  0.050251  0.000000  0.936348
 0.085427  0.030151  0.108878  0.775544
 0.232831  0.075377  0.082077  0.609715
 0.388610  0.026801  0.187605  0.396985
 0.711893  0.013400  0.033501  0.241206
 0.685092  0.031826  0.020101  0.262982
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1380.1

MOTIF MA1272.1 AT2G28810
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 600 E= 0
 0.173333  0.186667  0.116667  0.523333
 0.175000  0.215000  0.101667  0.508333
 0.198333  0.290000  0.083333  0.428333
 0.145000  0.213333  0.058333  0.583333
 0.161667  0.188333  0.065000  0.585000
 0.166667  0.171667  0.065000  0.596667
 0.193333  0.206667  0.120000  0.480000
 0.188333  0.183333  0.100000  0.528333
 0.141667  0.211667  0.071667  0.575000
 0.183333  0.110000  0.096667  0.610000
 0.138333  0.110000  0.103333  0.648333
 0.050000  0.220000  0.031667  0.698333
 0.320000  0.158333  0.070000  0.451667
 0.450000  0.183333  0.213333  0.153333
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.216667  0.025000  0.000000  0.758333
 0.098333  0.075000  0.110000  0.716667
 0.148333  0.261667  0.251667  0.338333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1272.1

MOTIF MA1245.1 AT2G33710
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 583 E= 0
 0.135506  0.528302  0.130360  0.205832
 0.185249  0.564322  0.060034  0.190395
 0.301887  0.084048  0.305317  0.308748
 0.101201  0.586621  0.080617  0.231561
 0.108062  0.814751  0.022298  0.054889
 0.111492  0.013722  0.600343  0.274443
 0.005146  0.782161  0.192110  0.020583
 0.012007  0.982847  0.005146  0.000000
 0.042882  0.000000  0.945111  0.012007
 0.000000  0.981132  0.018868  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.053173  0.000000  0.945111  0.001715
 0.013722  0.638079  0.018868  0.329331
 0.255575  0.600343  0.029160  0.114923
 0.502573  0.018868  0.267581  0.210978
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1245.1

MOTIF MA1245.2 AT2G33710
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2495 E= 0
 0.256914  0.121042  0.358717  0.263327
 0.086974  0.604008  0.144689  0.164329
 0.067335  0.900200  0.013226  0.019238
 0.101403  0.008016  0.870942  0.019639
 0.000401  0.983567  0.014830  0.001202
 0.015230  0.981563  0.000401  0.002806
 0.087776  0.001202  0.896192  0.014830
 0.002806  0.980361  0.005611  0.011222
 0.015230  0.964329  0.001202  0.019238
 0.333066  0.029259  0.506613  0.131062
 0.121844  0.466934  0.097395  0.313828
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1245.2

MOTIF MA1385.1 AT2G40260
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0
 0.231667  0.215000  0.045000  0.508333
 0.270000  0.201667  0.090000  0.438333
 0.416667  0.120000  0.111667  0.351667
 0.416667  0.110000  0.190000  0.283333
 0.638333  0.058333  0.013333  0.290000
 0.768333  0.000000  0.003333  0.228333
 0.246667  0.251667  0.058333  0.443333
 0.998333  0.000000  0.000000  0.001667
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.001667  0.000000  0.000000  0.998333
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.323333  0.015000  0.661667
 0.223333  0.253333  0.048333  0.475000
 0.126667  0.138333  0.033333  0.701667
 0.216667  0.145000  0.130000  0.508333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1385.1

MOTIF MA1229.1 AT2G44940
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 560 E= 0
 0.314286  0.275000  0.117857  0.292857
 0.342857  0.098214  0.239286  0.319643
 0.162500  0.158929  0.328571  0.350000
 0.044643  0.151786  0.003571  0.800000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.032143  0.000000  0.025000  0.942857
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.203571  0.000000  0.796429
 0.132143  0.033929  0.775000  0.058929
 0.275000  0.126786  0.512500  0.085714
 0.317857  0.267857  0.126786  0.287500
 0.258929  0.112500  0.387500  0.241071
 0.269643  0.139286  0.292857  0.298214
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1229.1

MOTIF MA1662.1 AT3G10030
letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1010 E= 0
 0.331683  0.251485  0.120792  0.296040
 0.293069  0.115842  0.312871  0.278218
 0.065347  0.059406  0.054455  0.820792
 0.029703  0.011881  0.003960  0.954455
 0.955446  0.011881  0.021782  0.010891
 0.962376  0.010891  0.015842  0.010891
 0.021782  0.948515  0.007921  0.021782
 0.757426  0.019802  0.197030  0.025743
 0.015842  0.007921  0.952475  0.023762
 0.864356  0.052475  0.008911  0.074257
 0.374257  0.180198  0.231683  0.213861
 0.297030  0.186139  0.222772  0.294059
 0.271287  0.209901  0.122772  0.396040
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1662.1

MOTIF MA1191.1 AT3G10113
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 599 E= 0
 0.282137  0.238731  0.158598  0.320534
 0.390651  0.215359  0.155259  0.238731
 0.345576  0.245409  0.155259  0.253756
 0.377295  0.200334  0.245409  0.176962
 0.557596  0.090150  0.085142  0.267112
 0.901503  0.001669  0.008347  0.088481
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.994992  0.000000  0.005008  0.000000
 0.000000  0.000000  0.005008  0.994992
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.180301  0.130217  0.025042  0.664441
 0.332220  0.171953  0.131886  0.363940
 0.479132  0.171953  0.151920  0.196995
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1191.1

