MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0107.1 Msx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.277228 0.257426 0.306931 0.158416 0.380000 0.280000 0.180000 0.160000 0.440000 0.120000 0.240000 0.200000 0.140000 0.230000 0.540000 0.090000 0.700000 0.080000 0.130000 0.090000 0.020000 0.800000 0.110000 0.070000 0.010000 0.560000 0.000000 0.430000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.950495 0.000000 0.039604 0.009901 0.150000 0.050000 0.560000 0.240000 0.110000 0.420000 0.080000 0.390000 0.160000 0.100000 0.470000 0.270000 0.250000 0.360000 0.110000 0.280000 0.090909 0.212121 0.111111 0.585859 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0107.1 MOTIF PH0108.1 Msx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.350000 0.230000 0.100000 0.606061 0.131313 0.161616 0.101010 0.400000 0.290000 0.100000 0.210000 0.757576 0.050505 0.131313 0.060606 0.770000 0.090000 0.090000 0.050000 0.040000 0.670000 0.190000 0.100000 0.000000 0.525253 0.000000 0.474747 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.980198 0.000000 0.009901 0.009901 0.700000 0.030000 0.150000 0.120000 0.181818 0.181818 0.303030 0.333333 0.222222 0.222222 0.181818 0.373737 0.310000 0.210000 0.100000 0.380000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0108.1 MOTIF MA0709.1 Msx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 8380 E= 0 0.164797 0.387470 0.297852 0.149881 0.035776 0.664832 0.003325 0.296067 0.944651 0.018036 0.026716 0.010596 0.984492 0.010456 0.004464 0.000587 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.013717 0.024374 0.011903 0.950006 0.958810 0.006751 0.010069 0.024371 0.320845 0.207255 0.309629 0.162272 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0709.1 MOTIF PB0044.1 Mtf1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.220000 0.100000 0.420000 0.260000 0.151515 0.212121 0.424242 0.212121 0.230000 0.160000 0.410000 0.200000 0.170000 0.400000 0.090000 0.340000 0.030000 0.930000 0.020000 0.020000 0.010000 0.000000 0.980000 0.010000 0.040404 0.020202 0.040404 0.898990 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.260000 0.000000 0.730000 0.010000 0.000000 0.980000 0.010000 0.020000 0.960000 0.010000 0.010000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.500000 0.230000 0.140000 0.130000 0.545455 0.292929 0.040404 0.121212 0.320000 0.170000 0.260000 0.250000 0.270000 0.260000 0.200000 0.270000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0044.1 MOTIF PB0148.1 Mtf1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.490000 0.180000 0.150000 0.180000 0.370000 0.200000 0.210000 0.220000 0.510000 0.160000 0.110000 0.220000 0.121212 0.111111 0.151515 0.616162 0.584158 0.128713 0.069307 0.217822 0.400000 0.150000 0.140000 0.310000 0.188119 0.148515 0.465347 0.198020 0.680000 0.140000 0.080000 0.100000 0.720000 0.080000 0.050000 0.150000 0.656566 0.101010 0.080808 0.161616 0.420000 0.190000 0.140000 0.250000 0.585859 0.181818 0.121212 0.111111 0.350000 0.180000 0.220000 0.250000 0.313131 0.343434 0.282828 0.060606 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0148.1 MOTIF MA0100.1 Myb letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 51 E= 0 0.156863 0.078431 0.666667 0.098039 0.431373 0.019608 0.490196 0.058824 0.039216 0.941176 0.019608 0.000000 0.313725 0.333333 0.313725 0.039216 0.019608 0.000000 0.980392 0.000000 0.039216 0.019608 0.000000 0.941176 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.117647 0.000000 0.862745 0.019608 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0100.1 MOTIF MA0100.2 Myb letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 979 E= 0 0.090909 0.382022 0.194076 0.332993 0.231869 0.461696 0.000000 0.306435 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.929520 0.000000 0.070480 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.054137 0.000000 0.000000 0.945863 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.153218 0.424923 0.009193 0.412666 0.030644 0.969356 0.000000 0.000000 0.740552 0.008172 0.000000 0.251277 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0100.2 MOTIF PB0045.1 Myb_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.326733 0.217822 0.178218 0.277228 0.210000 0.100000 0.200000 0.490000 0.220000 0.150000 0.350000 0.280000 0.260000 0.150000 0.320000 0.270000 0.380000 0.260000 0.140000 0.220000 0.760000 0.010000 0.150000 0.080000 0.821782 0.009901 0.089109 0.079208 0.030000 0.960000 0.000000 0.010000 0.009901 0.821782 0.158416 0.009901 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.009901 0.009901 0.009901 0.970297 0.010000 0.230000 0.000000 0.760000 0.686869 0.020202 0.181818 0.111111 0.310000 0.190000 0.110000 0.390000 0.333333 0.232323 0.080808 0.353535 0.290000 0.300000 0.080000 0.330000 0.240000 0.210000 0.220000 0.330000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0045.1 MOTIF PB0149.1 Myb_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.207921 0.277228 0.257426 0.257426 0.200000 0.190000 0.390000 0.220000 0.515152 0.191919 0.121212 0.171717 0.060000 0.630000 0.090000 0.220000 0.130000 0.620000 0.010000 0.240000 0.980198 0.000000 0.009901 0.009901 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.020000 0.140000 0.020000 0.820000 0.020000 0.010000 0.970000 0.000000 0.150000 0.640000 0.020000 0.190000 0.030000 0.910000 0.010000 0.050000 0.495050 0.059406 0.326733 0.118812 0.200000 0.280000 0.220000 0.300000 0.190000 0.250000 0.340000 0.220000 0.220000 0.310000 0.220000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0149.1 MOTIF PB0046.1 Mybl1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.220000 0.240000 0.200000 0.340000 0.242424 0.090909 0.232323 0.434343 0.237624 0.158416 0.366337 0.237624 0.370000 0.190000 0.220000 0.220000 0.390000 0.210000 0.100000 0.300000 0.780000 0.010000 0.160000 0.050000 0.840000 0.010000 0.080000 0.070000 0.029703 0.960396 0.000000 0.009901 0.010000 0.830000 0.150000 0.010000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.010000 0.980000 0.010000 0.170000 0.000000 0.820000 0.710000 0.010000 0.200000 0.080000 0.320000 0.240000 0.140000 0.300000 0.250000 0.240000 0.090000 0.420000 0.290000 0.310000 0.070000 0.330000 0.260000 0.210000 0.220000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0046.1