MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA1194.1 AT3G10580
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 140 E= 0
 0.457143  0.100000  0.235714  0.207143
 0.435714  0.014286  0.221429  0.328571
 0.435714  0.028571  0.014286  0.521429
 0.307143  0.100000  0.214286  0.378571
 0.464286  0.085714  0.078571  0.371429
 0.342857  0.035714  0.542857  0.078571
 0.000000  0.000000  0.942857  0.057143
 0.992857  0.007143  0.000000  0.000000
 0.028571  0.000000  0.000000  0.971429
 0.978571  0.000000  0.000000  0.021429
 0.985714  0.000000  0.007143  0.007143
 0.121429  0.042857  0.692857  0.142857
 0.292857  0.264286  0.378571  0.064286
 0.450000  0.000000  0.000000  0.550000
 0.085714  0.157143  0.085714  0.671429
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1194.1

MOTIF UN0353.1 AT3G11100
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 2496 E= 0
 0.191907  0.409054  0.120192  0.278846
 0.246394  0.132212  0.401442  0.219952
 0.573718  0.261218  0.101763  0.063301
 0.006410  0.966747  0.002404  0.024439
 0.009615  0.005208  0.979567  0.005609
 0.022837  0.010417  0.959135  0.007612
 0.040865  0.920673  0.004808  0.033654
 0.029247  0.022035  0.925881  0.022837
 0.852163  0.023237  0.079327  0.045272
 0.142228  0.261619  0.354968  0.241186
 0.304487  0.115785  0.350561  0.229167
 0.324519  0.158654  0.279647  0.237179
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0353.1

MOTIF MA1253.1 AT3G16280
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 561 E= 0
 0.290553  0.190731  0.165775  0.352941
 0.360071  0.114082  0.203209  0.322638
 0.206774  0.139037  0.303030  0.351159
 0.067736  0.098039  0.058824  0.775401
 0.044563  0.057041  0.853832  0.044563
 0.000000  0.000000  0.008913  0.991087
 0.000000  0.996435  0.000000  0.003565
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.010695  0.000000  0.989305  0.000000
 0.048128  0.098039  0.028520  0.825312
 0.089127  0.035651  0.791444  0.083779
 0.251337  0.144385  0.477718  0.126560
 0.304813  0.294118  0.121212  0.279857
 0.292335  0.128342  0.333333  0.245989
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1253.1

MOTIF MA1388.1 AT3G24120
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 600 E= 0
 0.423333  0.241667  0.335000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.953333  0.036667  0.000000  0.010000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.395000  0.605000  0.000000  0.000000
 0.206667  0.011667  0.016667  0.765000
 0.290000  0.090000  0.340000  0.280000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1388.1

MOTIF UN0354.1 AT3G42860
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1287 E= 0
 0.486402  0.153846  0.154623  0.205128
 0.624709  0.077700  0.132090  0.165501
 0.832945  0.020202  0.128982  0.017871
 0.006993  0.004662  0.985237  0.003108
 0.000000  0.001554  0.001554  0.996892
 0.007770  0.987568  0.000777  0.003885
 0.992230  0.003885  0.001554  0.002331
 0.993784  0.000777  0.002331  0.003108
 0.051282  0.882673  0.004662  0.061383
 0.094794  0.088578  0.676768  0.139860
 0.263403  0.236985  0.233877  0.265734
 0.259518  0.277389  0.128205  0.334887
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0354.1

MOTIF MA1270.1 AT3G45610
letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 600 E= 0
 0.168333  0.130000  0.238333  0.463333
 0.125000  0.251667  0.085000  0.538333
 0.295000  0.185000  0.045000  0.475000
 0.531667  0.230000  0.141667  0.096667
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.001667  0.998333
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.225000  0.000000  0.000000  0.775000
 0.065000  0.091667  0.016667  0.826667
 0.215000  0.291667  0.293333  0.200000
 0.215000  0.351667  0.178333  0.255000
 0.145000  0.315000  0.095000  0.445000
 0.138333  0.163333  0.093333  0.605000
 0.148333  0.091667  0.098333  0.661667
 0.173333  0.200000  0.080000  0.546667
 0.210000  0.153333  0.091667  0.545000
 0.220000  0.153333  0.146667  0.480000
 0.128333  0.223333  0.191667  0.456667
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1270.1

MOTIF MA1381.1 AT3G46070
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 202 E= 0
 0.222772  0.262376  0.069307  0.445545
 0.133663  0.450495  0.074257  0.341584
 0.386139  0.232673  0.039604  0.341584
 0.311881  0.272277  0.079208  0.336634
 0.089109  0.391089  0.069307  0.450495
 0.237624  0.316832  0.094059  0.351485
 0.044554  0.000000  0.000000  0.955446
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.990099  0.000000  0.000000  0.009901
 0.009901  0.990099  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.069307  0.648515  0.108911  0.173267
 0.207921  0.217822  0.049505  0.524752
 0.292079  0.386139  0.064356  0.257426
 0.311881  0.321782  0.079208  0.287129
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1381.1

MOTIF UN0355.1 AT3G49930
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1124 E= 0
 0.197509  0.258007  0.129893  0.414591
 0.261566  0.254448  0.116548  0.367438
 0.039146  0.080071  0.034698  0.846085
 0.950178  0.008897  0.015125  0.025801
 0.031139  0.901246  0.037367  0.030249
 0.020463  0.959075  0.009786  0.010676
 0.035587  0.004448  0.026690  0.933274
 0.958185  0.006228  0.012456  0.023132
 0.789146  0.123665  0.016904  0.070285
 0.208185  0.322064  0.065836  0.403915
 0.289146  0.182384  0.105872  0.422598
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0355.1

MOTIF MA1276.1 AT3G52440
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0
 0.178631  0.343907  0.312187  0.165275
 0.779633  0.006678  0.171953  0.041736
 0.580968  0.000000  0.000000  0.419032
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.003339  0.010017  0.365609  0.621035
 0.282137  0.051753  0.330551  0.335559
 0.580968  0.080134  0.227045  0.111853
 0.460768  0.218698  0.111853  0.208681
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1276.1

MOTIF MA1242.1 AT3G57600
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 478 E= 0
 0.081590  0.646444  0.081590  0.190377
 0.100418  0.725941  0.033473  0.140167
 0.246862  0.023013  0.453975  0.276151
 0.000000  0.958159  0.012552  0.029289
 0.002092  0.997908  0.000000  0.000000
 0.725941  0.000000  0.274059  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.993724  0.000000  0.006276
 0.052301  0.000000  0.947699  0.000000
 0.043933  0.916318  0.000000  0.039749
 0.041841  0.723849  0.004184  0.230126
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1242.1

