MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1110.1 NR1H4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 505 E= 0 0.150495 0.164356 0.231683 0.453465 0.134653 0.475248 0.172277 0.217822 0.912871 0.019802 0.023762 0.043564 0.817822 0.055446 0.071287 0.055446 0.005941 0.029703 0.011881 0.952475 0.047525 0.013861 0.914851 0.023762 0.900990 0.043564 0.027723 0.027723 0.051485 0.926733 0.000000 0.021782 0.023762 0.942574 0.011881 0.021782 0.142574 0.267327 0.160396 0.429703 0.267327 0.259406 0.207921 0.265347 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1110.1 MOTIF MA1146.1 NR1H4::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1000 E= 0 0.223000 0.172000 0.451000 0.154000 0.653654 0.055055 0.280280 0.011011 0.029000 0.015000 0.937000 0.019000 0.021978 0.008991 0.645355 0.323676 0.024000 0.049000 0.101000 0.826000 0.011011 0.875876 0.013013 0.100100 0.720721 0.013013 0.249249 0.017017 0.144000 0.121000 0.075000 0.660000 0.022977 0.091908 0.047952 0.837163 0.108000 0.102000 0.753000 0.037000 0.762238 0.111888 0.077922 0.047952 0.134134 0.773774 0.009009 0.083083 0.113000 0.798000 0.038000 0.051000 0.025000 0.383000 0.071000 0.521000 0.095000 0.313000 0.212000 0.380000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1146.1 MOTIF MA1533.1 NR1I2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 164 E= 0 0.353659 0.109756 0.335366 0.201220 0.022727 0.340909 0.051136 0.585227 0.051429 0.000000 0.937143 0.011429 0.680498 0.165975 0.099585 0.053942 0.728889 0.271111 0.000000 0.000000 0.017857 0.976190 0.005952 0.000000 0.040230 0.287356 0.017241 0.655172 0.054878 0.524390 0.310976 0.109756 0.310976 0.182927 0.341463 0.164634 0.400000 0.139394 0.242424 0.218182 0.000000 0.282209 0.000000 0.717791 0.107143 0.010204 0.836735 0.045918 0.738739 0.184685 0.054054 0.022523 0.755760 0.235023 0.009217 0.000000 0.000000 0.982036 0.000000 0.017964 0.005917 0.319527 0.029586 0.644970 0.067073 0.506098 0.201220 0.225610 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1533.1 MOTIF MA1534.1 NR1I3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 48424 E= 0 0.487093 0.094127 0.269556 0.149224 0.002711 0.186900 0.000000 0.810389 0.120145 0.001813 0.878042 0.000000 0.928196 0.050086 0.006555 0.015162 0.942174 0.057826 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.037181 0.000000 0.962819 0.210043 0.230032 0.048664 0.511261 0.181066 0.133675 0.073347 0.611912 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1534.1 MOTIF MA1535.1 NR2C1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 9622 E= 0 0.265226 0.295988 0.207545 0.231241 0.331744 0.100715 0.459344 0.108197 0.491317 0.022920 0.480210 0.005553 0.000000 0.000000 0.970057 0.029943 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.027393 0.972607 0.000000 0.967716 0.032284 0.000000 0.848651 0.000000 0.151349 0.000000 0.238828 0.289545 0.211910 0.259717 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1535.1 MOTIF MA0504.1 NR2C2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 395 E= 0 0.326582 0.318987 0.227848 0.126582 0.207595 0.177215 0.559494 0.055696 0.488608 0.015190 0.493671 0.002532 0.000000 0.020253 0.926582 0.053165 0.025316 0.007595 0.898734 0.068354 0.007595 0.000000 0.200000 0.792405 0.015190 0.782278 0.136709 0.065823 0.868354 0.000000 0.121519 0.010127 0.473418 0.000000 0.526582 0.000000 0.820253 0.000000 0.179747 0.000000 0.025316 0.000000 0.974684 0.000000 0.027848 0.000000 0.850633 0.121519 0.000000 0.068354 0.225316 0.706329 0.022785 0.797468 0.088608 0.091139 0.734177 0.000000 0.232911 0.032911 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0504.1 MOTIF MA1536.1 NR2C2(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 18628 E= 0 0.334765 0.167007 0.344642 0.153586 0.528895 0.037165 0.433940 0.000000 0.000000 0.011680 0.921950 0.066370 0.000000 0.000000 0.795456 0.204544 0.000000 0.000000 0.078552 0.921448 0.000000 0.754873 0.066580 0.178547 0.737246 0.000000 0.262754 0.000000 0.271903 0.255368 0.197767 0.274962 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1536.1 MOTIF MA0017.1 NR2F1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 13 E= 0 0.000000 0.000000 0.153846 0.846154 0.076923 0.000000 0.923077 0.000000 0.923077 0.000000 0.076923 0.000000 0.461538 0.538462 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.230769 0.000000 0.769231 0.000000 0.153846 0.000000 0.846154 0.076923 0.000000 0.000000 0.923077 0.153846 0.000000 0.846154 0.000000 0.461538 0.307692 0.230769 0.000000 0.461538 0.384615 0.076923 0.076923 0.076923 0.769231 0.076923 0.076923 0.230769 0.461538 0.000000 0.307692 0.000000 0.230769 0.230769 0.538462 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0017.1 MOTIF MA0017.2 NR2F1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 23504 E= 0 0.204306 0.486981 0.139381 0.169333 0.602538 0.140310 0.095613 0.161539 0.525211 0.032095 0.403798 0.038895 0.691463 0.000000 0.308537 0.000000 0.000000 0.002482 0.997518 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.992510 0.000000 0.007490 0.000000 0.424247 0.253338 0.134174 0.188241 0.267767 0.245957 0.364458 0.121818 0.271664 0.204826 0.322249 0.201260 0.116124 0.059523 0.753506 0.070847 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0017.2 MOTIF MA1537.1 NR2F1(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 33955 E= 0 0.358239 0.135208 0.394876 0.111677 0.590159 0.012575 0.389190 0.008076 0.009015 0.003470 0.965702 0.021813 0.013292 0.001193 0.964385 0.021130 0.000224 0.013000 0.037463 0.949314 0.000271 0.921565 0.017397 0.060766 0.981756 0.000173 0.017521 0.000549 0.843502 0.005664 0.083491 0.067344 0.928089 0.001312 0.069478 0.001121 0.000382 0.000000 0.997884 0.001734 0.006976 0.000000 0.978785 0.014240 0.000574 0.020529 0.050681 0.928216 0.000932 0.855660 0.038882 0.104526 0.824335 0.006773 0.151413 0.017479 0.268502 0.279105 0.215933 0.236460 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1537.1