MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1147.1 NR4A2::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1001 E= 0 0.287712 0.211788 0.370629 0.129870 0.498498 0.124124 0.348348 0.029029 0.019980 0.010989 0.923077 0.045954 0.050949 0.006993 0.803197 0.138861 0.046046 0.134134 0.128128 0.691692 0.007000 0.824000 0.031000 0.138000 0.592000 0.038000 0.343000 0.027000 0.248248 0.060060 0.087087 0.604605 0.002000 0.069000 0.005000 0.924000 0.070000 0.082000 0.836000 0.012000 0.926000 0.054000 0.017000 0.003000 0.157000 0.830000 0.002000 0.011000 0.039960 0.936064 0.003996 0.019980 0.005000 0.535000 0.023000 0.437000 0.103896 0.472527 0.179820 0.243756 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1147.1 MOTIF MA1540.1 NR5A1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4119 E= 0 0.186210 0.240592 0.307842 0.265356 0.152886 0.285184 0.152211 0.409720 0.016624 0.814961 0.141698 0.026717 0.933999 0.000000 0.065094 0.000907 0.909854 0.028281 0.030270 0.031595 0.000000 0.000000 0.979543 0.020457 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.127292 0.270513 0.050997 0.551198 0.013842 0.814317 0.043109 0.128732 0.650450 0.038225 0.265993 0.045332 0.206168 0.321272 0.199126 0.273434 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1540.1 MOTIF MA1541.1 NR6A1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 897 E= 0 0.190635 0.219621 0.348941 0.240803 0.129310 0.239858 0.176471 0.454361 0.082999 0.599732 0.228916 0.088353 0.938220 0.004188 0.046073 0.011518 0.807207 0.081982 0.064865 0.045946 0.013265 0.009184 0.914286 0.063265 0.020496 0.012945 0.477886 0.488673 0.001003 0.074223 0.026078 0.898696 0.007202 0.921811 0.029835 0.041152 0.982456 0.000000 0.002193 0.015351 0.820513 0.087912 0.032051 0.059524 0.021127 0.015091 0.901408 0.062374 0.030950 0.011740 0.559232 0.398079 0.059594 0.121153 0.232482 0.586771 0.030046 0.690293 0.083975 0.195686 0.680851 0.015198 0.272796 0.031155 0.314732 0.197545 0.231027 0.256696 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1541.1 MOTIF MA0506.1 NRF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4624 E= 0 0.130190 0.081099 0.788711 0.000000 0.134732 0.865268 0.000000 0.000000 0.042388 0.040874 0.916739 0.000000 0.000000 0.868512 0.101211 0.030277 0.327422 0.402682 0.202206 0.067690 0.000000 0.087154 0.114187 0.798659 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.938149 0.000000 0.061851 0.000000 0.075476 0.924524 0.000000 0.016003 0.983997 0.000000 0.000000 0.485510 0.173875 0.340614 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0506.1 MOTIF MA0347.1 NRG1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 999 E= 0 0.181181 0.404404 0.143143 0.271271 0.243243 0.225225 0.199199 0.332332 0.293587 0.250501 0.278557 0.177355 0.259519 0.239479 0.262525 0.238477 0.419840 0.112224 0.269539 0.198397 0.213213 0.255255 0.092092 0.439439 0.455912 0.488978 0.009018 0.046092 0.960961 0.003003 0.036036 0.000000 0.002004 0.001002 0.992986 0.004008 0.002004 0.001002 0.994990 0.002004 0.011022 0.000000 0.987976 0.001002 0.071071 0.011011 0.002002 0.915916 0.004012 0.930792 0.002006 0.063190 0.003003 0.820821 0.003003 0.173173 0.504008 0.087174 0.039078 0.369739 0.245737 0.202608 0.239719 0.311936 0.124248 0.303607 0.269539 0.302605 0.224449 0.067134 0.549098 0.159319 0.206620 0.401204 0.228686 0.163490 0.325651 0.171343 0.233467 0.269539 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0347.1 MOTIF MA0842.1 NRL letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5786 E= 0 0.389043 0.133426 0.212236 0.265296 0.439088 0.105063 0.151201 0.304648 0.344971 0.153992 0.102834 0.398203 0.241576 0.238120 0.213582 0.306722 0.090677 0.199953 0.036736 0.672634 0.008534 0.003926 0.987541 0.000000 0.136911 0.839159 0.000000 0.023930 0.068134 0.041275 0.012595 0.877997 0.051302 0.013023 0.761115 0.174559 0.868638 0.048191 0.022219 0.060952 0.047010 0.571206 0.158140 0.223643 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0842.1 MOTIF MA0842.2 NRL letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 27228 E= 0 0.529161 0.113927 0.205230 0.151682 0.667349 0.026393 0.116059 0.190199 0.619793 0.011319 0.022532 0.346356 0.477914 0.044750 0.027994 0.449341 0.251028 0.208205 0.293191 0.247576 0.018959 0.090325 0.002219 0.888497 0.000037 0.000000 0.999963 0.000000 0.035654 0.963073 0.000778 0.000495 0.000000 0.000294 0.000000 0.999706 0.002576 0.000000 0.960864 0.036560 0.999853 0.000000 0.000147 0.000000 0.001555 0.900754 0.018493 0.079198 0.220398 0.061297 0.533568 0.184736 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0842.2 MOTIF MA0421.1 NSI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1905 E= 0 0.091339 0.000000 0.143832 0.764829 0.000000 0.000000 0.021540 0.978460 0.000000 0.054584 0.000000 0.945416 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.063543 0.936457 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.026732 0.000000 0.973268 0.000000 0.384122 0.414694 0.057692 0.143491 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0421.1 MOTIF MA1678.1 NTL8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 24 nsites= 919 E= 0 0.262242 0.155604 0.334059 0.248096 0.258977 0.170838 0.365615 0.204570 0.071817 0.022851 0.029380 0.875952 0.147987 0.007617 0.044614 0.799782 0.454842 0.130577 0.145811 0.268770 0.004353 0.993471 0.001088 0.001088 0.002176 0.041349 0.015234 0.941240 0.003264 0.003264 0.001088 0.992383 0.118607 0.572361 0.227421 0.081610 0.544070 0.142546 0.125136 0.188248 0.247008 0.292709 0.202394 0.257889 0.237214 0.267682 0.258977 0.236126 0.244831 0.206746 0.305767 0.242655 0.180631 0.120783 0.131665 0.566921 0.076170 0.220892 0.574538 0.128400 0.986942 0.003264 0.003264 0.006529 0.932535 0.018498 0.046790 0.002176 0.000000 0.001088 0.993471 0.005441 0.304679 0.158868 0.106638 0.429815 0.861806 0.026115 0.002176 0.109902 0.914037 0.020675 0.016322 0.048966 0.113166 0.637650 0.108814 0.140370 0.261153 0.332971 0.122960 0.282916 0.250272 0.140370 0.167573 0.441785 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1678.1 MOTIF MA1046.1 NTL9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1001 E= 0 0.009990 0.009990 0.009990 0.970030 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.985000 0.005000 0.005000 0.005000 0.009990 0.009990 0.009990 0.970030 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1046.1