MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1354.1 AT4G12670 letter-probability matrix: alength= 4 w= 29 nsites= 42 E= 0 0.000000 0.833333 0.000000 0.166667 0.071429 0.071429 0.000000 0.857143 0.976190 0.000000 0.000000 0.023810 0.976190 0.000000 0.000000 0.023810 0.928571 0.023810 0.023810 0.023810 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.095238 0.833333 0.023810 0.047619 0.000000 0.976190 0.000000 0.023810 0.023810 0.000000 0.023810 0.952381 0.904762 0.000000 0.023810 0.071429 0.952381 0.000000 0.047619 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 0.000000 0.023810 0.857143 0.000000 0.119048 0.000000 0.928571 0.047619 0.023810 0.142857 0.761905 0.023810 0.071429 0.023810 0.023810 0.000000 0.952381 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.809524 0.047619 0.023810 0.119048 0.857143 0.023810 0.047619 0.071429 0.047619 0.833333 0.047619 0.071429 0.166667 0.666667 0.000000 0.166667 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 0.190476 0.000000 0.000000 0.809524 0.904762 0.071429 0.000000 0.023810 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 0.952381 0.000000 0.023810 0.023810 0.119048 0.833333 0.000000 0.047619 0.000000 0.928571 0.023810 0.047619 0.000000 0.761905 0.095238 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1354.1 MOTIF MA1237.1 AT4G16750 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0 0.203333 0.461667 0.120000 0.215000 0.310000 0.161667 0.276667 0.251667 0.188333 0.376667 0.151667 0.283333 0.170000 0.543333 0.068333 0.218333 0.268333 0.105000 0.320000 0.306667 0.110000 0.501667 0.078333 0.310000 0.050000 0.823333 0.033333 0.093333 0.610000 0.000000 0.378333 0.011667 0.000000 0.988333 0.006667 0.005000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.016667 0.000000 0.983333 0.000000 0.675000 0.183333 0.001667 0.140000 0.000000 0.998333 0.000000 0.001667 0.641667 0.023333 0.266667 0.068333 0.295000 0.350000 0.131667 0.223333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1237.1 MOTIF MA1228.1 AT4G18450 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 537 E= 0 0.348231 0.096834 0.489758 0.065177 0.145251 0.538175 0.000000 0.316574 0.000000 0.000000 0.994413 0.005587 0.063315 0.000000 0.936685 0.000000 0.000000 0.979516 0.000000 0.020484 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.024209 0.940410 0.000000 0.035382 0.011173 0.013035 0.878957 0.096834 0.158287 0.128492 0.703911 0.009311 0.333333 0.381750 0.059590 0.225326 0.169460 0.046555 0.627561 0.156425 0.238361 0.089385 0.536313 0.135940 0.230912 0.411546 0.134078 0.223464 0.193669 0.093110 0.556797 0.156425 0.188082 0.126629 0.540037 0.145251 0.236499 0.338920 0.154562 0.270019 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1228.1 MOTIF MA1232.1 AT4G28140 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 567 E= 0 0.019400 0.005291 0.962963 0.012346 0.269841 0.037037 0.350970 0.342152 0.001764 0.994709 0.000000 0.003527 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.003527 0.996473 0.000000 0.000000 0.375661 0.000000 0.624339 0.040564 0.021164 0.853616 0.084656 0.135802 0.169312 0.659612 0.035273 0.375661 0.335097 0.070547 0.218695 0.174603 0.052910 0.582011 0.190476 0.315697 0.109347 0.416226 0.158730 0.250441 0.313933 0.149912 0.285714 0.190476 0.125220 0.485009 0.199295 0.232804 0.144621 0.465608 0.156966 0.202822 0.278660 0.164021 0.354497 0.220459 0.146384 0.497354 0.135802 0.213404 0.162257 0.440917 0.183422 0.202822 0.269841 0.194004 0.333333 0.213404 0.171076 0.432099 0.183422 0.253968 0.149912 0.407407 0.188713 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1232.1 MOTIF MA1241.1 AT4G32800 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 591 E= 0 0.294416 0.311337 0.138748 0.255499 0.285956 0.137056 0.258883 0.318105 0.049069 0.595601 0.140440 0.214890 0.030457 0.908629 0.023689 0.037225 0.913706 0.000000 0.086294 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.994924 0.000000 0.000000 0.005076 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.959391 0.000000 0.038917 0.001692 0.363790 0.341794 0.137056 0.157360 0.375635 0.164129 0.064298 0.395939 0.333333 0.145516 0.164129 0.357022 0.272420 0.233503 0.162437 0.331641 0.231810 0.323181 0.123519 0.321489 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1241.1 MOTIF MA1281.1 AT5G02460 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 515 E= 0 0.421359 0.166990 0.225243 0.186408 0.689320 0.048544 0.174757 0.087379 0.800000 0.007767 0.025243 0.166990 0.994175 0.000000 0.001942 0.003883 0.980583 0.000000 0.000000 0.019417 0.900971 0.003883 0.095146 0.000000 0.003883 0.000000 0.992233 0.003883 0.291262 0.180583 0.159223 0.368932 0.594175 0.031068 0.137864 0.236893 0.716505 0.000000 0.201942 0.081553 0.687379 0.147573 0.112621 0.052427 0.621359 0.075728 0.192233 0.110680 0.636893 0.038835 0.155340 0.168932 0.436893 0.071845 0.289320 0.201942 0.506796 0.118447 0.186408 0.188350 0.638835 0.031068 0.200000 0.130097 0.677670 0.000000 0.141748 0.180583 0.669903 0.087379 0.201942 0.040777 0.504854 0.052427 0.213592 0.229126 0.533981 0.114563 0.271845 0.079612 0.510680 0.075728 0.231068 0.182524 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1281.1 MOTIF UN0356.1 AT5G05550 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 2298 E= 0 0.367711 0.121845 0.201480 0.308964 0.209748 0.169713 0.142298 0.478242 0.017842 0.810705 0.018712 0.152742 0.069626 0.005657 0.142733 0.781984 0.010444 0.976501 0.006527 0.006527 0.003046 0.993473 0.000000 0.003481 0.005657 0.000000 0.992602 0.001741 0.045692 0.051784 0.877720 0.024804 0.025674 0.886858 0.004352 0.083116 0.055701 0.029591 0.886423 0.028285 0.593124 0.090513 0.186249 0.130113 0.259791 0.278938 0.164056 0.297215 0.307659 0.125762 0.346388 0.220191 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0356.1 MOTIF MA1226.1 AT5G18450 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 587 E= 0 0.161840 0.069847 0.608177 0.160136 0.149915 0.091993 0.632027 0.126065 0.233390 0.304940 0.098807 0.362862 0.143101 0.083475 0.531516 0.241908 0.166951 0.071550 0.657581 0.103918 0.517888 0.226576 0.020443 0.235094 0.315162 0.000000 0.672913 0.011925 0.057922 0.000000 0.904600 0.037479 0.035775 0.867121 0.000000 0.097104 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.042589 0.265758 0.000000 0.691652 0.000000 0.000000 0.994889 0.005111 0.091993 0.064736 0.836457 0.006814 0.403748 0.265758 0.085179 0.245315 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1226.1 MOTIF UN0357.1 AT5G23930 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2074 E= 0 0.109932 0.498071 0.141273 0.250723 0.257956 0.637898 0.043877 0.060270 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.289296 0.020733 0.547252 0.142719 0.092093 0.499518 0.120058 0.288332 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0357.1 MOTIF MA1365.2 AT5G47660 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5429 E= 0 0.450912 0.099466 0.201879 0.247744 0.270031 0.211641 0.148830 0.369497 0.101124 0.013999 0.854485 0.030392 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.002579 0.000000 0.997421 0.976607 0.005526 0.006999 0.010868 0.964450 0.001474 0.009210 0.024866 0.906244 0.004237 0.019156 0.070363 0.882299 0.000184 0.006263 0.111254 0.411310 0.116228 0.126174 0.346288 0.370971 0.151409 0.125069 0.352551 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1365.2