MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1409.1 OsRR22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100000 E= 0 0.512570 0.113810 0.117710 0.255910 0.868700 0.030420 0.060410 0.040470 0.004860 0.005220 0.976700 0.013220 0.979070 0.002870 0.007780 0.010280 0.004950 0.004840 0.005100 0.985110 0.723957 0.077241 0.004640 0.194162 0.004440 0.916480 0.006110 0.072970 0.016900 0.028380 0.926339 0.028380 0.139260 0.331450 0.467560 0.061730 0.204678 0.113559 0.055109 0.626654 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1409.1 MOTIF PB0050.1 Osr1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.262626 0.252525 0.222222 0.262626 0.240000 0.230000 0.190000 0.340000 0.260000 0.190000 0.240000 0.310000 0.320000 0.170000 0.160000 0.350000 0.820000 0.120000 0.030000 0.030000 0.010000 0.970000 0.000000 0.020000 0.660000 0.000000 0.340000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.010000 0.940000 0.979798 0.000000 0.020202 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.920000 0.010000 0.070000 0.450000 0.160000 0.110000 0.280000 0.390000 0.300000 0.190000 0.120000 0.360000 0.210000 0.180000 0.250000 0.420000 0.110000 0.290000 0.180000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0050.1 MOTIF PB0154.1 Osr1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.450000 0.090000 0.310000 0.150000 0.180000 0.350000 0.150000 0.320000 0.400000 0.220000 0.150000 0.230000 0.210000 0.250000 0.160000 0.380000 0.140000 0.080000 0.740000 0.040000 0.030000 0.910000 0.020000 0.040000 0.030000 0.080000 0.030000 0.860000 0.790000 0.050000 0.050000 0.110000 0.070707 0.888889 0.020202 0.020202 0.029703 0.544554 0.009901 0.415842 0.320000 0.100000 0.030000 0.550000 0.455446 0.108911 0.425743 0.009901 0.434343 0.313131 0.090909 0.161616 0.260000 0.180000 0.200000 0.360000 0.280000 0.260000 0.210000 0.250000 0.272727 0.292929 0.232323 0.202020 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0154.1 MOTIF PB0051.1 Osr2_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.297030 0.227723 0.178218 0.297030 0.287129 0.188119 0.188119 0.336634 0.287129 0.237624 0.326733 0.148515 0.262626 0.191919 0.080808 0.464646 0.840000 0.120000 0.020000 0.020000 0.010000 0.980000 0.000000 0.010000 0.660000 0.000000 0.340000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.040000 0.000000 0.010000 0.950000 0.980000 0.000000 0.020000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.010000 0.040000 0.343434 0.232323 0.131313 0.292929 0.340000 0.320000 0.170000 0.170000 0.360000 0.180000 0.150000 0.310000 0.267327 0.138614 0.435644 0.158416 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0051.1 MOTIF PB0155.1 Osr2_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.500000 0.060000 0.250000 0.190000 0.250000 0.300000 0.170000 0.280000 0.227723 0.247525 0.158416 0.366337 0.202020 0.212121 0.121212 0.464646 0.090909 0.090909 0.757576 0.060606 0.029703 0.891089 0.039604 0.039604 0.039604 0.089109 0.029703 0.841584 0.828283 0.040404 0.030303 0.101010 0.150000 0.810000 0.020000 0.020000 0.029703 0.485149 0.019802 0.465347 0.260000 0.100000 0.040000 0.600000 0.470000 0.080000 0.440000 0.010000 0.343434 0.414141 0.060606 0.181818 0.420000 0.110000 0.110000 0.360000 0.220000 0.280000 0.220000 0.280000 0.280000 0.350000 0.210000 0.160000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0155.1 MOTIF PH0128.1 Otp letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.230000 0.380000 0.210000 0.180000 0.306931 0.198020 0.336634 0.158416 0.148515 0.356436 0.118812 0.376238 0.410000 0.180000 0.180000 0.230000 0.470000 0.100000 0.390000 0.040000 0.009901 0.118812 0.000000 0.871287 0.009901 0.039604 0.000000 0.950495 0.980000 0.010000 0.010000 0.000000 0.989899 0.000000 0.010101 0.000000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.000000 0.010000 0.010000 0.980000 0.950495 0.000000 0.039604 0.009901 0.871287 0.000000 0.118812 0.009901 0.060000 0.420000 0.090000 0.430000 0.232323 0.101010 0.282828 0.383838 0.220000 0.180000 0.350000 0.250000 0.121212 0.121212 0.606061 0.151515 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0128.1 MOTIF PH0129.1 Otx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.300000 0.150000 0.300000 0.250000 0.190000 0.100000 0.490000 0.220000 0.370000 0.110000 0.160000 0.360000 0.430000 0.050000 0.470000 0.050000 0.178218 0.198020 0.603960 0.019802 0.080000 0.000000 0.920000 0.000000 0.009901 0.000000 0.980198 0.009901 0.959596 0.040404 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.940000 0.000000 0.000000 0.060000 0.690000 0.030000 0.140000 0.140000 0.118812 0.128713 0.099010 0.653465 0.290000 0.130000 0.090000 0.490000 0.240000 0.240000 0.200000 0.320000 0.320000 0.220000 0.160000 0.300000 0.190000 0.260000 0.240000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0129.1 MOTIF PH0130.1 Otx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.230000 0.210000 0.270000 0.290000 0.290000 0.070000 0.380000 0.260000 0.290000 0.150000 0.220000 0.340000 0.484848 0.151515 0.313131 0.050505 0.202020 0.111111 0.676768 0.010101 0.080000 0.010000 0.910000 0.000000 0.010101 0.000000 0.979798 0.010101 0.940594 0.049505 0.000000 0.009901 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.929293 0.000000 0.000000 0.070707 0.750000 0.020000 0.120000 0.110000 0.110000 0.150000 0.120000 0.620000 0.200000 0.340000 0.080000 0.380000 0.297030 0.128713 0.316832 0.257426 0.190000 0.170000 0.210000 0.430000 0.207921 0.445545 0.138614 0.207921 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0130.1 MOTIF MA1030.1 P0510F09.23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.416000 0.113000 0.060000 0.411000 0.535000 0.024000 0.369000 0.072000 0.416000 0.562000 0.007000 0.015000 0.026000 0.962000 0.001000 0.011000 0.041000 0.928000 0.027000 0.004000 0.010000 0.001000 0.000000 0.989000 0.831169 0.031968 0.082917 0.053946 0.373000 0.132000 0.389000 0.106000 0.266000 0.258000 0.226000 0.250000 0.241000 0.256000 0.220000 0.283000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1030.1 MOTIF MA0779.1 PAX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 5221 E= 0 0.060142 0.604673 0.272553 0.062632 0.000561 0.000000 0.984667 0.014772 0.049682 0.016985 0.000000 0.933333 0.000604 0.903602 0.000201 0.095593 0.943257 0.056215 0.000528 0.000000 0.000389 0.873007 0.000000 0.126604 0.000565 0.000377 0.998494 0.000565 0.000000 0.812396 0.187604 0.000000 0.572647 0.020941 0.011117 0.395295 0.002327 0.089890 0.000423 0.907360 0.000154 0.273162 0.718345 0.008338 0.857040 0.000479 0.142481 0.000000 0.186131 0.367969 0.277841 0.168060 0.015093 0.124822 0.006527 0.853559 0.140819 0.001825 0.711395 0.145961 0.281535 0.496222 0.222244 0.000000 0.385896 0.311870 0.113885 0.188349 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0779.1