MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0358.1 PUT3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 99 E= 0 0.090909 0.727273 0.090909 0.090909 0.020000 0.900000 0.020000 0.060000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.514851 0.148515 0.188119 0.148515 0.455446 0.128713 0.168317 0.247525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0358.1 MOTIF MA0067.1 Pax2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 31 E= 0 0.322581 0.225806 0.161290 0.290323 0.225806 0.032258 0.677419 0.064516 0.096774 0.064516 0.000000 0.838710 0.000000 0.903226 0.032258 0.064516 0.838710 0.032258 0.096774 0.032258 0.064516 0.548387 0.032258 0.354839 0.064516 0.000000 0.612903 0.322581 0.032258 0.354839 0.354839 0.258065 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0067.1 MOTIF MA0068.1 Pax4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 30 nsites= 21 E= 0 0.333333 0.095238 0.523810 0.047619 0.952381 0.000000 0.047619 0.000000 0.761905 0.095238 0.047619 0.095238 0.523810 0.047619 0.047619 0.380952 0.619048 0.047619 0.142857 0.190476 0.523810 0.142857 0.047619 0.285714 0.285714 0.047619 0.095238 0.571429 0.428571 0.047619 0.047619 0.476190 0.238095 0.142857 0.285714 0.333333 0.238095 0.523810 0.047619 0.190476 0.285714 0.523810 0.190476 0.000000 0.333333 0.333333 0.238095 0.095238 0.380952 0.333333 0.095238 0.190476 0.285714 0.238095 0.047619 0.428571 0.476190 0.238095 0.190476 0.095238 0.190476 0.380952 0.190476 0.238095 0.142857 0.285714 0.190476 0.380952 0.333333 0.380952 0.142857 0.142857 0.190476 0.428571 0.142857 0.238095 0.428571 0.285714 0.095238 0.190476 0.238095 0.333333 0.238095 0.190476 0.238095 0.285714 0.095238 0.380952 0.333333 0.523810 0.000000 0.142857 0.285714 0.428571 0.047619 0.238095 0.142857 0.571429 0.095238 0.190476 0.333333 0.428571 0.095238 0.142857 0.142857 0.571429 0.095238 0.190476 0.047619 0.523810 0.142857 0.285714 0.285714 0.523810 0.047619 0.142857 0.142857 0.619048 0.095238 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0068.1 MOTIF PH0131.1 Pax4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.420000 0.080000 0.070000 0.430000 0.230000 0.310000 0.330000 0.130000 0.404040 0.181818 0.242424 0.171717 0.370000 0.140000 0.190000 0.300000 0.019802 0.594059 0.019802 0.366337 0.030000 0.010000 0.040000 0.920000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.920000 0.040000 0.010000 0.030000 0.366337 0.019802 0.594059 0.019802 0.110000 0.520000 0.080000 0.290000 0.140000 0.370000 0.230000 0.260000 0.180000 0.440000 0.320000 0.060000 0.340000 0.100000 0.310000 0.250000 0.280000 0.350000 0.180000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0131.1 MOTIF MA0014.1 Pax5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 12 E= 0 0.333333 0.083333 0.333333 0.250000 0.333333 0.000000 0.666667 0.000000 0.333333 0.250000 0.250000 0.166667 0.083333 0.166667 0.416667 0.333333 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.583333 0.166667 0.083333 0.166667 0.166667 0.416667 0.250000 0.166667 0.000000 0.250000 0.166667 0.583333 0.083333 0.166667 0.666667 0.083333 0.500000 0.083333 0.250000 0.166667 0.500000 0.000000 0.166667 0.333333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.666667 0.083333 0.083333 0.250000 0.000000 0.750000 0.000000 0.083333 0.000000 0.333333 0.583333 0.500000 0.083333 0.416667 0.000000 0.416667 0.083333 0.416667 0.083333 0.166667 0.833333 0.000000 0.000000 0.166667 0.416667 0.416667 0.000000 0.416667 0.000000 0.500000 0.083333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0014.1 MOTIF PH0132.1 Pax6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.060000 0.150000 0.110000 0.680000 0.260000 0.130000 0.430000 0.180000 0.620000 0.210000 0.100000 0.070000 0.080808 0.404040 0.040404 0.474747 0.120000 0.070000 0.010000 0.800000 0.949495 0.020202 0.020202 0.010101 0.969697 0.010101 0.000000 0.020202 0.020202 0.000000 0.010101 0.969697 0.010101 0.020202 0.020202 0.949495 0.800000 0.010000 0.070000 0.120000 0.514851 0.049505 0.277228 0.158416 0.070000 0.100000 0.210000 0.620000 0.070707 0.080808 0.282828 0.565657 0.257426 0.277228 0.306931 0.158416 0.390000 0.190000 0.200000 0.220000 0.230000 0.410000 0.170000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0132.1 MOTIF PH0133.1 Pax7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.360000 0.140000 0.180000 0.200000 0.230000 0.400000 0.170000 0.414141 0.212121 0.080808 0.292929 0.290000 0.290000 0.210000 0.210000 0.110000 0.440000 0.020000 0.430000 0.060606 0.202020 0.010101 0.727273 0.910000 0.010000 0.080000 0.000000 0.950000 0.000000 0.020000 0.030000 0.030000 0.020000 0.000000 0.950000 0.000000 0.080000 0.010000 0.910000 0.727273 0.010101 0.202020 0.060606 0.430000 0.020000 0.440000 0.110000 0.120000 0.200000 0.290000 0.390000 0.404040 0.212121 0.131313 0.252525 0.310000 0.330000 0.210000 0.150000 0.257426 0.148515 0.267327 0.326733 0.370000 0.190000 0.230000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0133.1 MOTIF PH0134.1 Pbx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.210000 0.280000 0.150000 0.360000 0.060606 0.494949 0.151515 0.292929 0.595960 0.030303 0.141414 0.232323 0.120000 0.400000 0.090000 0.390000 0.370000 0.390000 0.110000 0.130000 0.110000 0.730000 0.090000 0.070000 0.860000 0.020000 0.070000 0.050000 0.030000 0.010000 0.010000 0.950000 0.030000 0.950000 0.010000 0.010000 0.930000 0.030000 0.020000 0.020000 0.740000 0.060000 0.030000 0.170000 0.310000 0.050000 0.060000 0.580000 0.320000 0.320000 0.150000 0.210000 0.390000 0.140000 0.090000 0.380000 0.356436 0.138614 0.148515 0.356436 0.260000 0.290000 0.240000 0.210000 0.370000 0.350000 0.210000 0.070000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0134.1 MOTIF MA1702.1 Pdp1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 4816 E= 0 0.304817 0.157600 0.236919 0.300664 0.383721 0.158846 0.282807 0.174626 0.026163 0.009551 0.013289 0.950997 0.022841 0.010174 0.024709 0.942276 0.927741 0.007267 0.045266 0.019726 0.022633 0.070598 0.015365 0.891404 0.068729 0.015781 0.876453 0.039037 0.031977 0.681478 0.016404 0.270141 0.954734 0.018272 0.014743 0.012251 0.956395 0.012458 0.014120 0.017027 0.189784 0.262251 0.144103 0.403862 0.292151 0.245640 0.166528 0.295681 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1702.1 MOTIF MA0132.1 Pdx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 31 E= 0 0.032258 0.612903 0.161290 0.193548 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.032258 0.967742 0.032258 0.032258 0.322581 0.612903 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0132.1