MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0140.1 Pknox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.435644 0.089109 0.168317 0.306931 0.434343 0.060606 0.363636 0.141414 0.323232 0.282828 0.212121 0.181818 0.050000 0.290000 0.520000 0.140000 0.929293 0.010101 0.040404 0.020202 0.040000 0.580000 0.340000 0.040000 0.020000 0.970000 0.010000 0.000000 0.000000 0.030000 0.000000 0.970000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.020000 0.010000 0.000000 0.970000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.673267 0.079208 0.039604 0.207921 0.330000 0.110000 0.070000 0.490000 0.287129 0.415842 0.188119 0.108911 0.202020 0.474747 0.171717 0.151515 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0140.1 MOTIF PH0141.1 Pknox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.430000 0.200000 0.160000 0.210000 0.600000 0.100000 0.170000 0.130000 0.260000 0.200000 0.420000 0.120000 0.030000 0.440000 0.350000 0.180000 0.610000 0.030000 0.350000 0.010000 0.030000 0.550000 0.410000 0.010000 0.020000 0.970000 0.000000 0.010000 0.000000 0.040000 0.000000 0.960000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.980000 0.000000 0.020000 0.000000 0.590000 0.200000 0.050000 0.160000 0.210000 0.160000 0.050000 0.580000 0.300000 0.260000 0.180000 0.260000 0.158416 0.267327 0.217822 0.356436 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0141.1 MOTIF MA1615.1 Plagl1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 14153 E= 0 0.196425 0.319014 0.300996 0.183565 0.204056 0.310959 0.284745 0.200240 0.151063 0.516428 0.213806 0.118703 0.135590 0.103936 0.094538 0.665937 0.013919 0.017170 0.960574 0.008337 0.085706 0.025154 0.866318 0.022822 0.013213 0.018795 0.955063 0.012930 0.012718 0.023741 0.953508 0.010033 0.055253 0.899951 0.022115 0.022681 0.012789 0.929273 0.029817 0.028121 0.852399 0.048470 0.072917 0.026214 0.147884 0.326291 0.342825 0.183000 0.241221 0.255352 0.322688 0.180739 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1615.1 MOTIF PB0052.1 Plagl1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.120000 0.240000 0.300000 0.340000 0.240000 0.280000 0.190000 0.290000 0.200000 0.150000 0.470000 0.180000 0.191919 0.111111 0.515152 0.181818 0.050000 0.040000 0.840000 0.070000 0.130000 0.000000 0.850000 0.020000 0.000000 0.010000 0.960000 0.030000 0.000000 0.656566 0.343434 0.000000 0.000000 0.343434 0.656566 0.000000 0.030000 0.960000 0.010000 0.000000 0.020000 0.850000 0.000000 0.130000 0.070000 0.840000 0.040000 0.050000 0.191919 0.545455 0.060606 0.202020 0.210000 0.230000 0.260000 0.300000 0.380000 0.190000 0.260000 0.170000 0.230000 0.260000 0.300000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0052.1 MOTIF PB0156.1 Plagl1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.290000 0.170000 0.330000 0.210000 0.210000 0.350000 0.220000 0.220000 0.198020 0.158416 0.148515 0.495050 0.190000 0.050000 0.600000 0.160000 0.090000 0.010000 0.810000 0.090000 0.009901 0.009901 0.970297 0.009901 0.030303 0.000000 0.969697 0.000000 0.000000 0.010000 0.980000 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010101 0.010101 0.010101 0.969697 0.880000 0.010000 0.080000 0.030000 0.050000 0.890000 0.010000 0.050000 0.220000 0.630000 0.060000 0.090000 0.230000 0.340000 0.210000 0.220000 0.237624 0.326733 0.148515 0.287129 0.200000 0.240000 0.190000 0.370000 0.267327 0.128713 0.247525 0.356436 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0156.1 MOTIF PH0142.1 Pou1f1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.297030 0.138614 0.326733 0.237624 0.386139 0.237624 0.257426 0.118812 0.270000 0.190000 0.200000 0.340000 0.090000 0.050000 0.210000 0.650000 0.800000 0.100000 0.020000 0.080000 0.890000 0.040000 0.020000 0.050000 0.060000 0.010000 0.010000 0.920000 0.030000 0.020000 0.020000 0.930000 0.930000 0.020000 0.020000 0.030000 0.920000 0.010000 0.010000 0.060000 0.050000 0.020000 0.040000 0.890000 0.080000 0.020000 0.100000 0.800000 0.790000 0.090000 0.020000 0.100000 0.430000 0.110000 0.210000 0.250000 0.240000 0.190000 0.330000 0.240000 0.220000 0.140000 0.200000 0.440000 0.151515 0.484848 0.181818 0.181818 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0142.1 MOTIF PH0143.1 Pou2f1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.140000 0.280000 0.270000 0.168317 0.207921 0.128713 0.495050 0.310000 0.120000 0.310000 0.260000 0.300000 0.240000 0.090000 0.370000 0.450000 0.100000 0.310000 0.140000 0.320000 0.240000 0.020000 0.420000 0.040000 0.010000 0.000000 0.950000 0.890000 0.090000 0.010000 0.010000 0.980000 0.000000 0.000000 0.020000 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.020000 0.020000 0.100000 0.860000 0.930000 0.010000 0.000000 0.060000 0.485149 0.049505 0.316832 0.148515 0.108911 0.168317 0.435644 0.287129 0.210000 0.180000 0.070000 0.540000 0.510000 0.050000 0.120000 0.320000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0143.1 MOTIF PH0144.1 Pou2f2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.140000 0.270000 0.210000 0.380000 0.272727 0.202020 0.171717 0.353535 0.230000 0.150000 0.350000 0.270000 0.128713 0.099010 0.029703 0.742574 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.020202 0.000000 0.979798 0.010000 0.000000 0.920000 0.070000 0.000000 0.890000 0.010000 0.100000 0.747475 0.000000 0.000000 0.252525 0.898990 0.000000 0.010101 0.090909 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.030000 0.010000 0.020000 0.940000 0.200000 0.120000 0.270000 0.410000 0.495050 0.198020 0.108911 0.198020 0.350000 0.130000 0.370000 0.150000 0.405941 0.237624 0.217822 0.138614 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0144.1 MOTIF PH0145.1 Pou2f3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.160000 0.200000 0.200000 0.440000 0.240000 0.220000 0.150000 0.390000 0.190000 0.130000 0.400000 0.280000 0.090000 0.120000 0.040000 0.750000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.000000 0.000000 0.940000 0.060000 0.000000 0.919192 0.000000 0.080808 0.740000 0.000000 0.000000 0.260000 0.910000 0.000000 0.010000 0.080000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.020000 0.000000 0.020000 0.960000 0.150000 0.160000 0.290000 0.400000 0.460000 0.240000 0.110000 0.190000 0.292929 0.161616 0.353535 0.191919 0.414141 0.242424 0.181818 0.161616 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0145.1 MOTIF MA0627.1 Pou2f3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.160000 0.200000 0.200000 0.440000 0.240000 0.220000 0.150000 0.390000 0.190000 0.130000 0.400000 0.280000 0.090000 0.120000 0.040000 0.750000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.000000 0.000000 0.940000 0.060000 0.000000 0.919192 0.000000 0.080808 0.740000 0.000000 0.000000 0.260000 0.910000 0.000000 0.010000 0.080000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.020000 0.000000 0.020000 0.960000 0.150000 0.160000 0.290000 0.400000 0.460000 0.240000 0.110000 0.190000 0.292929 0.161616 0.353535 0.191919 0.414141 0.242424 0.181818 0.161616 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0627.1