MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1616.1 Prdm15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 2237 E= 0 0.285203 0.217255 0.250335 0.247206 0.278945 0.147072 0.411265 0.162718 0.112651 0.145284 0.595887 0.146178 0.898972 0.026822 0.060349 0.013858 0.948145 0.015199 0.025928 0.010729 0.868127 0.021010 0.089405 0.021457 0.805096 0.061690 0.067948 0.065266 0.029951 0.867680 0.045150 0.057219 0.099240 0.843093 0.047832 0.009835 0.098346 0.161377 0.012517 0.727760 0.008494 0.003129 0.983013 0.005364 0.028610 0.010282 0.950380 0.010729 0.684399 0.140367 0.098346 0.076889 0.307108 0.195798 0.334376 0.162718 0.241395 0.283862 0.205633 0.269110 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1616.1 MOTIF UN0260.1 Prdm9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 9937 E= 0 0.414713 0.122975 0.275838 0.186475 0.306934 0.161719 0.179330 0.352018 0.181745 0.024253 0.690047 0.103955 0.222200 0.031197 0.700614 0.045990 0.078293 0.676462 0.020529 0.224716 0.897253 0.004428 0.080407 0.017913 0.037134 0.011573 0.934185 0.017108 0.029687 0.245849 0.013384 0.711080 0.931267 0.007044 0.050116 0.011573 0.118547 0.053940 0.730804 0.096709 0.007950 0.971017 0.005636 0.015397 0.859112 0.027976 0.020328 0.092583 0.057361 0.555500 0.180940 0.206199 0.029788 0.935393 0.012378 0.022441 0.397907 0.161819 0.072356 0.367918 0.186575 0.222703 0.287310 0.303411 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0260.1 MOTIF PH0153.1 Prop1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.242424 0.383838 0.212121 0.161616 0.210000 0.190000 0.470000 0.130000 0.360000 0.250000 0.220000 0.170000 0.470000 0.180000 0.250000 0.100000 0.019802 0.158416 0.009901 0.811881 0.010101 0.030303 0.000000 0.959596 0.970297 0.009901 0.009901 0.009901 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.009901 0.009901 0.009901 0.970297 0.959596 0.000000 0.030303 0.010101 0.811881 0.009901 0.158416 0.019802 0.160000 0.160000 0.350000 0.330000 0.450000 0.110000 0.180000 0.260000 0.310000 0.180000 0.250000 0.260000 0.350000 0.180000 0.240000 0.230000 0.140000 0.530000 0.100000 0.230000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0153.1 MOTIF PH0154.1 Prrx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.252525 0.272727 0.313131 0.161616 0.140000 0.150000 0.270000 0.440000 0.550000 0.220000 0.100000 0.130000 0.640000 0.100000 0.200000 0.060000 0.030303 0.636364 0.030303 0.303030 0.010101 0.080808 0.000000 0.909091 0.980000 0.010000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.940594 0.000000 0.039604 0.019802 0.490000 0.050000 0.430000 0.030000 0.030000 0.480000 0.160000 0.330000 0.090000 0.060000 0.110000 0.740000 0.396040 0.168317 0.247525 0.188119 0.200000 0.390000 0.250000 0.160000 0.050000 0.180000 0.170000 0.600000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0154.1 MOTIF MA0075.1 Prrx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 59 E= 0 0.881356 0.033898 0.067797 0.016949 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.016949 0.983051 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.983051 0.000000 0.016949 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0075.1 MOTIF PH0155.1 Prrx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.580000 0.040000 0.120000 0.260000 0.320000 0.260000 0.250000 0.170000 0.410000 0.280000 0.110000 0.200000 0.277228 0.089109 0.554455 0.079208 0.020202 0.707071 0.010101 0.262626 0.000000 0.120000 0.000000 0.880000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.980198 0.000000 0.009901 0.009901 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.880000 0.000000 0.120000 0.000000 0.262626 0.010101 0.707071 0.020202 0.029703 0.534653 0.039604 0.396040 0.181818 0.171717 0.414141 0.232323 0.435644 0.148515 0.257426 0.158416 0.420000 0.150000 0.180000 0.250000 0.300000 0.200000 0.260000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0155.1 MOTIF MA0075.2 Prrx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3850 E= 0 0.167273 0.395325 0.185714 0.251688 0.090324 0.455393 0.055482 0.398802 0.782317 0.073374 0.083740 0.060569 0.900351 0.054269 0.029006 0.016374 0.003338 0.005648 0.002824 0.988190 0.092131 0.099644 0.047252 0.760973 0.858003 0.044137 0.008694 0.089166 0.320603 0.228111 0.268901 0.182385 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0075.2 MOTIF MA1618.1 Ptf1a letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 14441 E= 0 0.283360 0.206980 0.253514 0.256146 0.309951 0.253584 0.247074 0.189391 0.592341 0.190222 0.167163 0.050274 0.009210 0.969877 0.009002 0.011911 0.973894 0.008171 0.010595 0.007340 0.017312 0.032269 0.905200 0.045218 0.840108 0.119382 0.030261 0.010249 0.008725 0.015511 0.008171 0.967592 0.016689 0.008448 0.960321 0.014542 0.066824 0.142511 0.197632 0.593034 0.104633 0.162108 0.158923 0.574337 0.241742 0.249359 0.253722 0.255176 0.259954 0.255453 0.233779 0.250814 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1618.1 MOTIF MA1619.1 Ptf1a(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 7253 E= 0 0.257686 0.248587 0.272163 0.221563 0.272715 0.335034 0.224597 0.167655 0.599200 0.147525 0.180339 0.072935 0.006756 0.985661 0.003860 0.003723 0.981525 0.005653 0.008962 0.003860 0.004688 0.042327 0.922239 0.030746 0.030884 0.923342 0.041224 0.004550 0.003585 0.009100 0.005515 0.981801 0.003723 0.003723 0.985799 0.006756 0.073763 0.180891 0.146836 0.598511 0.168344 0.225010 0.334482 0.272163 0.220874 0.272577 0.248587 0.257962 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1619.1 MOTIF MA1620.1 Ptf1a(var.3) letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 10291 E= 0 0.275386 0.239918 0.258867 0.225828 0.253911 0.359537 0.231173 0.155378 0.667282 0.115441 0.137013 0.080264 0.017880 0.960742 0.010980 0.010397 0.974930 0.005830 0.008162 0.011078 0.011272 0.832475 0.114858 0.041395 0.024876 0.934020 0.028569 0.012535 0.008260 0.009134 0.009523 0.973083 0.006608 0.010592 0.969002 0.013798 0.051210 0.156933 0.147313 0.644544 0.163055 0.245554 0.324653 0.266738 0.222816 0.291906 0.212127 0.273151 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1620.1