MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0138.2 REST letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 1591 E= 0 0.132621 0.109365 0.230044 0.527970 0.036318 0.168441 0.091421 0.703820 0.047589 0.855354 0.031309 0.065748 0.906367 0.018727 0.058677 0.016230 0.021197 0.027431 0.945137 0.006234 0.076012 0.609346 0.201246 0.113396 0.980697 0.004359 0.007472 0.007472 0.001868 0.987547 0.007472 0.003113 0.021793 0.922167 0.012453 0.043587 0.568847 0.125234 0.100935 0.204984 0.136534 0.233791 0.077307 0.552369 0.024314 0.004364 0.966958 0.004364 0.012469 0.003117 0.983167 0.001247 0.877105 0.069869 0.021210 0.031815 0.008125 0.800000 0.145625 0.046250 0.983750 0.005625 0.004375 0.006250 0.026349 0.008156 0.959849 0.005646 0.128688 0.632141 0.114878 0.124294 0.229899 0.019472 0.432161 0.318467 0.133962 0.586792 0.200629 0.078616 0.112579 0.700629 0.023270 0.163522 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0138.2 MOTIF MA0365.1 RFX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.120000 0.270000 0.420000 0.190000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.310000 0.000000 0.690000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.020000 0.480000 0.020000 0.480000 0.880000 0.040000 0.040000 0.040000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0365.1 MOTIF MA0509.2 RFX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 17992 E= 0 0.179969 0.310749 0.208370 0.300912 0.193697 0.144953 0.287128 0.374222 0.023844 0.005947 0.958704 0.011505 0.007337 0.016674 0.009449 0.966541 0.027012 0.028791 0.009337 0.934860 0.060527 0.016785 0.880169 0.042519 0.006781 0.954369 0.005502 0.033348 0.003557 0.367608 0.005725 0.623110 0.920798 0.017397 0.042964 0.018842 0.132170 0.046854 0.151012 0.669964 0.114384 0.026845 0.803913 0.054858 0.144898 0.086928 0.691029 0.077145 0.250723 0.332592 0.198366 0.218319 0.522121 0.106547 0.206592 0.164740 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0509.2 MOTIF MA0600.1 RFX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 2346 E= 0 0.158994 0.060102 0.731458 0.049446 0.026428 0.078431 0.135124 0.760017 0.081841 0.313725 0.027280 0.577153 0.183717 0.135124 0.387894 0.293265 0.014493 0.825234 0.051577 0.108696 0.000426 0.921569 0.002984 0.075021 0.667945 0.184143 0.017477 0.130435 0.069906 0.094629 0.040068 0.795396 0.247656 0.000000 0.752344 0.000000 0.082268 0.002131 0.914749 0.000853 0.091219 0.823529 0.000000 0.085251 0.893009 0.003410 0.072464 0.031117 0.985507 0.000000 0.011935 0.002558 0.000000 0.977835 0.000000 0.022165 0.323956 0.334186 0.229753 0.112106 0.250639 0.171782 0.502131 0.075448 0.173061 0.354220 0.312447 0.160273 0.249361 0.268542 0.324382 0.157715 0.264280 0.284740 0.289003 0.161978 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0600.1 MOTIF MA0600.2 RFX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 13412 E= 0 0.102967 0.421488 0.301372 0.174172 0.018971 0.000843 0.979623 0.000562 0.002012 0.002731 0.001006 0.994251 0.129263 0.057681 0.000909 0.812147 0.294935 0.017705 0.599582 0.087778 0.000813 0.894045 0.006300 0.098842 0.000127 0.784147 0.000318 0.215408 0.971471 0.003777 0.006461 0.018290 0.015567 0.006372 0.002100 0.975961 0.205323 0.000459 0.794087 0.000131 0.131927 0.008414 0.859462 0.000197 0.094982 0.579955 0.024741 0.300321 0.809682 0.002272 0.083712 0.104334 0.994462 0.001410 0.002517 0.001611 0.000487 0.977962 0.000070 0.021482 0.186328 0.281923 0.420569 0.111180 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0600.2 MOTIF MA0798.1 RFX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 21645 E= 0 0.133102 0.351952 0.300809 0.214137 0.088406 0.001284 0.905285 0.005025 0.013843 0.026295 0.012715 0.947147 0.186227 0.120487 0.004111 0.689175 0.295696 0.042193 0.533951 0.128161 0.002707 0.882789 0.028479 0.086025 0.000053 0.778248 0.002486 0.219213 0.885533 0.018346 0.026563 0.069558 0.066320 0.014080 0.012208 0.907392 0.233469 0.002221 0.764256 0.000055 0.172475 0.021054 0.805536 0.000935 0.155848 0.497450 0.051471 0.295230 0.714217 0.004397 0.137056 0.144330 0.961031 0.008424 0.025717 0.004828 0.005675 0.942477 0.001553 0.050296 0.197589 0.319614 0.409773 0.073025 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0798.1 MOTIF MA0798.2 RFX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 4345 E= 0 0.128884 0.386191 0.222325 0.262601 0.157883 0.213349 0.315305 0.313464 0.031300 0.010587 0.942002 0.016110 0.008285 0.020944 0.017952 0.952819 0.029689 0.060529 0.017952 0.891830 0.074799 0.033142 0.827848 0.064212 0.009896 0.906789 0.009436 0.073878 0.011507 0.486766 0.008055 0.493671 0.911623 0.023015 0.051093 0.014269 0.072727 0.034522 0.095282 0.797468 0.067434 0.010587 0.893211 0.028769 0.086536 0.052934 0.822555 0.037975 0.246720 0.377675 0.172152 0.203452 0.516456 0.099425 0.257077 0.127043 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0798.2 MOTIF MA0799.1 RFX4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 11648 E= 0 0.188530 0.356885 0.247854 0.206731 0.122698 0.000923 0.863017 0.013362 0.028489 0.025962 0.013869 0.931680 0.329752 0.136430 0.006103 0.527715 0.308716 0.033928 0.488081 0.169275 0.000273 0.849863 0.001641 0.148222 0.000081 0.715234 0.003643 0.281043 0.789132 0.065423 0.071538 0.073907 0.054798 0.037706 0.029699 0.877797 0.163528 0.003777 0.832639 0.000056 0.236091 0.029564 0.728686 0.005659 0.120666 0.518415 0.008825 0.352094 0.563666 0.008033 0.112910 0.315390 0.965237 0.014041 0.018302 0.002421 0.003614 0.961892 0.001205 0.033290 0.161005 0.278538 0.411286 0.149171 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0799.1 MOTIF MA0510.1 RFX5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 3868 E= 0 0.088676 0.406412 0.145036 0.359876 0.153826 0.205791 0.222854 0.417528 0.001551 0.483454 0.331696 0.183299 0.046794 0.953206 0.000000 0.000000 0.307394 0.561272 0.015770 0.115564 0.000000 0.215098 0.000000 0.784902 0.476732 0.000259 0.523009 0.000000 0.063340 0.000000 0.908480 0.028180 0.000000 0.727766 0.105481 0.166753 0.790331 0.128490 0.081179 0.000000 0.954498 0.045502 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.538780 0.202172 0.000000 0.259049 0.247156 0.093330 0.564633 0.094881 0.225181 0.358842 0.320321 0.095657 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0510.1 MOTIF MA0510.2 RFX5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 2632 E= 0 0.105243 0.408435 0.300152 0.186170 0.030843 0.000000 0.966073 0.003084 0.001354 0.011171 0.005078 0.982397 0.015682 0.032699 0.003337 0.948282 0.301949 0.029790 0.616035 0.052225 0.001206 0.955788 0.015273 0.027733 0.000351 0.742897 0.002455 0.254297 0.885679 0.017334 0.019397 0.077590 0.046542 0.018100 0.007111 0.928248 0.249589 0.003612 0.744171 0.002627 0.050088 0.016813 0.933100 0.000000 0.051577 0.598516 0.022635 0.327273 0.933218 0.004308 0.042654 0.019819 0.979574 0.009325 0.007105 0.003996 0.010467 0.957729 0.004831 0.026973 0.181675 0.349980 0.355879 0.112466 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0510.2