MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0372.1 RPH1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.530000 0.140000 0.140000 0.190000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.636364 0.010101 0.070707 0.282828 0.732673 0.069307 0.069307 0.128713 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0372.1 MOTIF MA0373.1 RPN4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 99 E= 0 0.232323 0.000000 0.676768 0.090909 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.120000 0.880000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.130000 0.000000 0.870000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0373.1 MOTIF PF0129.1 RRAGTTGT letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 888 E= 0 0.376126 0.000000 0.623874 0.000000 0.506757 0.000000 0.493243 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0129.1 MOTIF PF0146.1 RRCCGTTA letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 444 E= 0 0.349099 0.000000 0.650901 0.000000 0.468468 0.000000 0.531532 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0146.1 MOTIF MA0073.1 RREB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 11 E= 0 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 0.090909 0.909091 0.000000 0.000000 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.636364 0.363636 0.000000 0.000000 0.818182 0.181818 0.000000 0.000000 0.727273 0.272727 0.000000 0.000000 0.363636 0.545455 0.000000 0.090909 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.363636 0.636364 0.000000 0.000000 0.090909 0.909091 0.000000 0.000000 0.272727 0.727273 0.000000 0.000000 0.363636 0.545455 0.090909 0.000000 0.181818 0.818182 0.000000 0.000000 0.363636 0.454545 0.000000 0.181818 0.363636 0.454545 0.090909 0.090909 0.363636 0.545455 0.000000 0.090909 0.090909 0.636364 0.272727 0.000000 0.363636 0.363636 0.181818 0.090909 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0073.1 MOTIF MA0374.1 RSC3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 100 E= 0 0.000000 0.910000 0.050000 0.040000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.060606 0.555556 0.181818 0.202020 0.190000 0.300000 0.370000 0.140000 0.227723 0.257426 0.336634 0.178218 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0374.1 MOTIF MA0375.1 RSC30 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.500000 0.190000 0.120000 0.151515 0.383838 0.464646 0.000000 0.000000 0.920000 0.080000 0.000000 0.000000 0.080000 0.920000 0.000000 0.000000 0.920000 0.080000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.850000 0.150000 0.000000 0.000000 0.310000 0.690000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0375.1 MOTIF PF0036.1 RTAAACA letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 2920 E= 0 0.458562 0.000000 0.541438 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0036.1 MOTIF MA0376.1 RTG3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 998 E= 0 0.393788 0.145291 0.330661 0.130261 0.220441 0.147295 0.267535 0.364729 0.357715 0.322645 0.207415 0.112224 0.164329 0.176353 0.295591 0.363727 0.156156 0.121121 0.250250 0.472472 0.535070 0.113226 0.203407 0.148297 0.034068 0.027054 0.663327 0.275551 0.019038 0.954910 0.019038 0.007014 0.906814 0.005010 0.081162 0.007014 0.005010 0.950902 0.016032 0.028056 0.028056 0.016032 0.950902 0.005010 0.007014 0.081162 0.005010 0.906814 0.007014 0.019038 0.954910 0.019038 0.275551 0.663327 0.027054 0.034068 0.152305 0.332665 0.156313 0.358717 0.111222 0.270541 0.187375 0.430862 0.398798 0.122244 0.276553 0.202405 0.275275 0.257257 0.296296 0.171171 0.323647 0.165331 0.033066 0.477956 0.249499 0.396794 0.108216 0.245491 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0376.1 MOTIF PF0107.1 RTTTNNNYTGGM letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 364 E= 0 0.508242 0.000000 0.491758 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.239011 0.197802 0.310440 0.252747 0.134615 0.381868 0.184066 0.299451 0.296703 0.192308 0.115385 0.395604 0.000000 0.274725 0.000000 0.725275 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.593407 0.406593 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0107.1