MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1327.2 ATHB23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2432 E= 0 0.271382 0.156661 0.114309 0.457648 0.191612 0.092928 0.042352 0.673109 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.265625 0.127467 0.153783 0.453125 0.275493 0.163240 0.124178 0.437089 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1327.2 MOTIF MA1328.1 ATHB34 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0 0.401667 0.018333 0.018333 0.561667 0.253333 0.075000 0.028333 0.643333 0.376667 0.086667 0.006667 0.530000 0.553333 0.153333 0.110000 0.183333 0.368333 0.126667 0.170000 0.335000 0.230000 0.228333 0.091667 0.450000 0.290000 0.303333 0.155000 0.251667 0.403333 0.291667 0.211667 0.093333 0.025000 0.375000 0.031667 0.568333 0.006667 0.001667 0.000000 0.991667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.998333 0.000000 0.001667 0.000000 0.006667 0.015000 0.000000 0.978333 0.000000 0.370000 0.010000 0.620000 0.898333 0.021667 0.053333 0.026667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1328.1 MOTIF MA1406.1 ATHB4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100000 E= 0 0.023920 0.403810 0.019150 0.553120 0.822550 0.032980 0.006180 0.138290 0.983480 0.012910 0.000930 0.002680 0.002970 0.003330 0.000760 0.992940 0.034660 0.428280 0.404600 0.132460 0.991280 0.000660 0.003330 0.004730 0.009980 0.002280 0.004220 0.983520 0.055649 0.007640 0.028060 0.908651 0.180450 0.035990 0.684090 0.099470 0.125420 0.338250 0.350170 0.186160 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1406.1 MOTIF MA1214.1 ATHB40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 600 E= 0 0.388333 0.155000 0.196667 0.260000 0.355000 0.281667 0.158333 0.205000 0.673333 0.041667 0.113333 0.171667 0.185000 0.541667 0.113333 0.160000 0.035000 0.883333 0.000000 0.081667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.646667 0.030000 0.041667 0.281667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.093333 0.008333 0.068333 0.830000 0.153333 0.015000 0.661667 0.170000 0.425000 0.100000 0.235000 0.240000 0.368333 0.173333 0.210000 0.248333 0.285000 0.241667 0.221667 0.251667 0.320000 0.265000 0.131667 0.283333 0.343333 0.201667 0.093333 0.361667 0.360000 0.111667 0.116667 0.411667 0.435000 0.106667 0.090000 0.368333 0.368333 0.141667 0.085000 0.405000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1214.1 MOTIF MA1215.1 ATHB53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0 0.272120 0.410684 0.110184 0.207012 0.180301 0.676127 0.000000 0.143573 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.939900 0.000000 0.023372 0.036728 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.056761 0.000000 0.056761 0.886477 0.217028 0.048414 0.634391 0.100167 0.402337 0.095159 0.243740 0.258765 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1215.1 MOTIF MA0954.2 ATHB7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 600 E= 0 0.153333 0.096667 0.113333 0.636667 0.088333 0.648333 0.153333 0.110000 0.788333 0.103333 0.018333 0.090000 0.933333 0.005000 0.000000 0.061667 0.000000 0.001667 0.001667 0.996667 0.003333 0.003333 0.773333 0.220000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.003333 0.996667 0.061667 0.005000 0.918333 0.015000 0.540000 0.076667 0.301667 0.081667 0.290000 0.095000 0.163333 0.451667 0.213333 0.151667 0.155000 0.480000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0954.2 MOTIF UN0358.1 ATMYB13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 1148 E= 0 0.303136 0.261324 0.146341 0.289199 0.282230 0.230836 0.186411 0.300523 0.304007 0.278746 0.136760 0.280488 0.187282 0.411150 0.128049 0.273519 0.121951 0.506098 0.060976 0.310976 0.052265 0.796167 0.031359 0.120209 0.964286 0.004355 0.009582 0.021777 0.093206 0.890244 0.006969 0.009582 0.008711 0.972997 0.005226 0.013066 0.788328 0.040070 0.014808 0.156794 0.963415 0.009582 0.019164 0.007840 0.078397 0.900697 0.004355 0.016551 0.030488 0.885017 0.013937 0.070557 0.634146 0.166376 0.082753 0.116725 0.339721 0.313589 0.092334 0.254355 0.326655 0.272648 0.133275 0.267422 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0358.1 MOTIF MA1467.1 ATOH1(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2005 E= 0 0.682294 0.085287 0.232419 0.000000 0.736304 0.130752 0.132944 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.947368 0.000000 0.000000 0.052632 0.000000 0.000000 0.883150 0.116850 0.129771 0.870229 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.067982 0.216374 0.025585 0.690058 0.000000 0.688824 0.000000 0.311176 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1467.1 MOTIF MA1468.1 ATOH7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1013 E= 0 0.702863 0.095755 0.140178 0.061204 0.424157 0.296348 0.216292 0.063202 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.816514 0.000000 0.116972 0.066514 0.016816 0.118834 0.066143 0.798206 0.734021 0.185567 0.080412 0.000000 0.000000 0.032808 0.032808 0.934383 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.007022 0.217697 0.366573 0.408708 0.023256 0.547196 0.002736 0.426813 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1468.1 MOTIF MA0277.1 AZF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 102 E= 0 0.617647 0.127451 0.127451 0.127451 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.871287 0.128713 0.000000 0.000000 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.780000 0.160000 0.030000 0.030000 0.818182 0.060606 0.060606 0.060606 0.617647 0.127451 0.127451 0.127451 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0277.1