MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1559.1 SNAI3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 6248 E= 0 0.472471 0.105794 0.244078 0.177657 0.609081 0.000000 0.362463 0.028456 0.003647 0.990802 0.000000 0.005550 0.994113 0.000000 0.005410 0.000477 0.018329 0.004505 0.970488 0.006679 0.000000 0.002873 0.997127 0.000000 0.000000 0.001908 0.004453 0.993639 0.014752 0.000000 0.980540 0.004708 0.037429 0.541327 0.147375 0.273869 0.624833 0.091856 0.209479 0.073832 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1559.1 MOTIF MA0384.1 SNT2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 3219 E= 0 0.000000 0.027648 0.097235 0.875116 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.413844 0.079234 0.506922 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.988906 0.000000 0.011094 0.000000 0.002231 0.000000 0.997769 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.002536 0.973693 0.023772 0.000000 0.053554 0.946446 0.000000 0.000000 0.275219 0.067347 0.485714 0.171720 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0384.1 MOTIF MA0554.1 SOC1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 888 E= 0 0.324324 0.138514 0.111486 0.425676 0.193694 0.297297 0.127252 0.381757 0.073198 0.030405 0.038288 0.858108 0.069820 0.000000 0.057432 0.872748 0.131757 0.052928 0.100225 0.715090 0.022523 0.962838 0.014640 0.000000 0.000000 0.694820 0.010135 0.295045 0.516892 0.041667 0.063063 0.378378 0.154279 0.087838 0.000000 0.757883 0.146396 0.006757 0.000000 0.846847 0.024775 0.009009 0.000000 0.966216 0.110360 0.027027 0.000000 0.862613 0.101351 0.079955 0.096847 0.721847 0.203829 0.011261 0.769144 0.015766 0.019144 0.025901 0.748874 0.206081 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0554.1 MOTIF MA1560.1 SOHLH2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1212 E= 0 0.189769 0.400165 0.151815 0.258251 0.089397 0.137214 0.629938 0.143451 0.033186 0.893805 0.021386 0.051622 0.967279 0.000000 0.032721 0.000000 0.000000 0.985366 0.008943 0.005691 0.011281 0.000000 0.976632 0.012087 0.027418 0.049505 0.000000 0.923077 0.032514 0.003172 0.961142 0.003172 0.150359 0.669983 0.095080 0.084577 0.314097 0.197032 0.304204 0.184666 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1560.1 MOTIF MA0385.1 SOK2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 101 E= 0 0.495050 0.188119 0.158416 0.158416 0.150000 0.490000 0.180000 0.180000 0.410000 0.470000 0.090000 0.030000 0.040000 0.010000 0.040000 0.910000 0.040000 0.010000 0.940000 0.010000 0.040000 0.910000 0.010000 0.040000 0.970000 0.010000 0.010000 0.010000 0.050000 0.050000 0.500000 0.400000 0.170000 0.210000 0.520000 0.100000 0.280000 0.320000 0.220000 0.180000 0.303030 0.232323 0.232323 0.232323 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0385.1 MOTIF MA1379.1 SOL1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0 0.320000 0.028333 0.045000 0.606667 0.158333 0.026667 0.010000 0.805000 0.278333 0.061667 0.011667 0.648333 0.365000 0.115000 0.076667 0.443333 0.735000 0.090000 0.116667 0.058333 0.905000 0.000000 0.071667 0.023333 0.776667 0.005000 0.110000 0.108333 0.806667 0.000000 0.038333 0.155000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.281667 0.000000 0.718333 0.803333 0.000000 0.196667 0.000000 0.925000 0.075000 0.000000 0.000000 0.998333 0.000000 0.001667 0.000000 0.446667 0.026667 0.000000 0.526667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1379.1 MOTIF MA0442.1 SOX10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0 0.000000 0.863636 0.000000 0.136364 0.363636 0.090909 0.090909 0.454545 0.000000 0.045455 0.181818 0.772727 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.136364 0.863636 0.000000 0.000000 0.000000 0.045455 0.954545 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0442.1 MOTIF MA0442.2 SOX10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2055 E= 0 0.332360 0.193187 0.256448 0.218005 0.351825 0.137713 0.277859 0.232603 0.544039 0.181022 0.154258 0.120681 0.984428 0.001946 0.001460 0.012165 0.001460 0.967883 0.005353 0.025304 0.987348 0.003406 0.003406 0.005839 0.957664 0.013625 0.009732 0.018978 0.953285 0.011192 0.005839 0.029684 0.004866 0.006326 0.979075 0.009732 0.324088 0.268613 0.301217 0.106083 0.310462 0.270073 0.245742 0.173723 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0442.2 MOTIF MA1561.1 SOX12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1368 E= 0 0.624269 0.195175 0.079678 0.100877 0.133858 0.747157 0.050744 0.068241 0.048387 0.860887 0.034274 0.056452 0.048205 0.026667 0.875897 0.049231 0.967157 0.029445 0.002265 0.001133 0.993023 0.002326 0.004651 0.000000 0.000000 0.996499 0.000000 0.003501 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.846383 0.090188 0.043608 0.019822 0.103118 0.168665 0.045564 0.682654 0.231850 0.245902 0.357143 0.165105 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1561.1 MOTIF MA1120.1 SOX13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4552 E= 0 0.338093 0.145650 0.306459 0.209798 0.394332 0.210457 0.230448 0.164763 0.977812 0.004833 0.008787 0.008568 0.012083 0.939367 0.013181 0.035369 0.951011 0.012083 0.010984 0.025923 0.964411 0.010545 0.013840 0.011204 0.034271 0.016916 0.006151 0.942663 0.128515 0.012522 0.842926 0.016037 0.170914 0.142135 0.585677 0.101274 0.269772 0.276142 0.235940 0.218146 0.269772 0.247364 0.229789 0.253076 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1120.1