MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0077.1 SOX9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 76 E= 0 0.039474 0.723684 0.118421 0.118421 0.105263 0.500000 0.078947 0.315789 0.934211 0.013158 0.000000 0.052632 0.026316 0.013158 0.026316 0.934211 0.092105 0.000000 0.052632 0.855263 0.026316 0.026316 0.947368 0.000000 0.171053 0.000000 0.052632 0.776316 0.118421 0.092105 0.078947 0.710526 0.184211 0.407895 0.092105 0.315789 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0077.1 MOTIF MA0079.1 SP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 8 E= 0 0.125000 0.125000 0.500000 0.250000 0.250000 0.125000 0.500000 0.125000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.625000 0.250000 0.125000 0.250000 0.000000 0.500000 0.250000 0.000000 0.125000 0.625000 0.250000 0.000000 0.000000 0.750000 0.250000 0.125000 0.125000 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 0.000000 0.750000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0079.1 MOTIF MA0079.2 SP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 35 E= 0 0.000000 0.914286 0.028571 0.057143 0.000000 0.857143 0.028571 0.114286 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.114286 0.771429 0.000000 0.114286 0.057143 0.142857 0.428571 0.371429 0.000000 0.800000 0.028571 0.171429 0.028571 0.885714 0.000000 0.085714 0.000000 0.685714 0.085714 0.228571 0.171429 0.714286 0.000000 0.114286 0.085714 0.742857 0.085714 0.085714 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0079.2 MOTIF MA0079.3 SP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 8734 E= 0 0.098122 0.204488 0.489008 0.208381 0.000000 0.711587 0.073506 0.214907 0.011335 0.767460 0.000000 0.221204 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.991642 0.000000 0.008358 0.155599 0.000000 0.529425 0.314976 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.764713 0.000000 0.235287 0.120678 0.727845 0.000000 0.151477 0.074651 0.568926 0.084039 0.272384 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0079.3 MOTIF MA0079.4 SP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 49663 E= 0 0.158388 0.267261 0.195135 0.379216 0.553795 0.036720 0.019596 0.389890 0.565615 0.029949 0.381259 0.023177 0.278959 0.000000 0.718114 0.002927 0.019232 0.976650 0.001639 0.002479 0.001071 0.966423 0.000000 0.032507 0.768869 0.231131 0.000000 0.000000 0.000000 0.999376 0.000000 0.000624 0.018884 0.000000 0.964043 0.017073 0.000000 0.999658 0.000000 0.000342 0.000161 0.999839 0.000000 0.000000 0.000000 0.971322 0.000000 0.028678 0.490866 0.481512 0.000299 0.027323 0.023690 0.745634 0.018219 0.212458 0.253670 0.314238 0.061293 0.370799 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0079.4 MOTIF MA0516.1 SP2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1686 E= 0 0.094899 0.150059 0.609727 0.145314 0.023132 0.481020 0.152432 0.343416 0.030842 0.822064 0.000593 0.146501 0.000000 0.995848 0.004152 0.000000 0.000000 0.974496 0.000000 0.025504 0.103203 0.000000 0.759193 0.137604 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.982206 0.000000 0.017794 0.000000 0.657177 0.000000 0.342823 0.122183 0.709371 0.000000 0.168446 0.068209 0.575919 0.058719 0.297153 0.110913 0.328588 0.192764 0.367734 0.134045 0.425267 0.237841 0.202847 0.135231 0.470937 0.241993 0.151839 0.120403 0.441874 0.250297 0.187426 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0516.1 MOTIF MA0516.2 SP2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 793 E= 0 0.322825 0.388398 0.155107 0.133670 0.059618 0.192351 0.064117 0.683915 0.705409 0.087457 0.000000 0.207135 0.803629 0.089648 0.035219 0.071505 0.053202 0.125123 0.779310 0.042365 0.041212 0.552727 0.009697 0.396364 0.017744 0.980989 0.001267 0.000000 0.019441 0.955043 0.015796 0.009721 0.004843 0.953995 0.026634 0.014528 0.085506 0.054223 0.813347 0.046924 0.000000 0.977860 0.000000 0.022140 0.006017 0.954272 0.031288 0.008424 0.027913 0.939320 0.000000 0.032767 0.483755 0.469314 0.026474 0.020457 0.027397 0.845579 0.001245 0.125778 0.130852 0.265306 0.000000 0.603842 0.189155 0.255990 0.110971 0.443884 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0516.2 MOTIF MA0746.1 SP3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 18576 E= 0 0.223999 0.300549 0.355782 0.119671 0.176351 0.709806 0.042316 0.071528 0.085544 0.838812 0.031730 0.043914 0.716826 0.238364 0.026742 0.018069 0.022596 0.933343 0.012004 0.032058 0.261176 0.038908 0.555378 0.144538 0.020670 0.962009 0.005531 0.011790 0.025942 0.957826 0.007681 0.008551 0.009571 0.810920 0.015092 0.164417 0.433481 0.453752 0.023493 0.089274 0.127548 0.558995 0.090502 0.222955 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0746.1 MOTIF MA0746.2 SP3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 6591 E= 0 0.192232 0.285844 0.287513 0.234411 0.284502 0.070396 0.589288 0.055813 0.084845 0.842193 0.028878 0.044084 0.022834 0.940631 0.007707 0.028828 0.795427 0.202604 0.000303 0.001666 0.000908 0.997276 0.000000 0.001816 0.061508 0.000000 0.871825 0.066667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.998636 0.000000 0.001364 0.000273 0.901272 0.000273 0.098181 0.477649 0.440050 0.005431 0.076870 0.074691 0.687265 0.039898 0.198146 0.230011 0.395691 0.079502 0.294796 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0746.2 MOTIF MA0685.1 SP4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 4471 E= 0 0.138895 0.314247 0.184075 0.362782 0.517012 0.037116 0.015465 0.430407 0.567190 0.031850 0.357548 0.043412 0.163731 0.001046 0.832432 0.002790 0.055237 0.943913 0.000000 0.000850 0.000432 0.969357 0.001079 0.029132 0.751376 0.247874 0.000750 0.000000 0.000429 0.999571 0.000000 0.000000 0.001811 0.002535 0.985696 0.009958 0.000427 0.998720 0.000853 0.000000 0.000633 0.998944 0.000422 0.000000 0.000000 0.984184 0.000633 0.015183 0.423378 0.559135 0.002071 0.015416 0.020632 0.780719 0.003834 0.194815 0.214528 0.168799 0.044035 0.572638 0.137621 0.285174 0.085836 0.491369 0.229582 0.280152 0.132004 0.358262 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0685.1