MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0165.1 Abd-B letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.238095 0.000000 0.000000 0.761905 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.142857 0.000000 0.857143 0.142857 0.000000 0.523810 0.333333 0.619048 0.000000 0.238095 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0165.1 MOTIF MA1277.1 Adof1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 595 E= 0 0.465546 0.157983 0.163025 0.213445 0.522689 0.119328 0.178151 0.179832 0.556303 0.084034 0.196639 0.163025 0.531092 0.127731 0.178151 0.163025 0.460504 0.114286 0.205042 0.220168 0.275630 0.233613 0.339496 0.151261 0.652101 0.080672 0.181513 0.085714 0.783193 0.000000 0.005042 0.211765 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.966387 0.000000 0.033613 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.161345 0.189916 0.157983 0.490756 0.623529 0.030252 0.151261 0.194958 0.574790 0.043697 0.297479 0.084034 0.640336 0.087395 0.139496 0.132773 0.547899 0.115966 0.110924 0.225210 0.492437 0.085714 0.226891 0.194958 0.484034 0.146218 0.220168 0.149580 0.447059 0.131092 0.159664 0.262185 0.458824 0.104202 0.253782 0.183193 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1277.1 MOTIF MA0006.1 Ahr::Arnt letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 24 E= 0 0.125000 0.333333 0.083333 0.458333 0.000000 0.000000 0.958333 0.041667 0.000000 0.958333 0.000000 0.041667 0.000000 0.000000 0.958333 0.041667 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0006.1 MOTIF MA0854.1 Alx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.440000 0.170000 0.200000 0.070000 0.210000 0.650000 0.070000 0.380000 0.330000 0.140000 0.150000 0.430000 0.090000 0.310000 0.170000 0.050000 0.400000 0.020000 0.530000 0.010000 0.070000 0.000000 0.920000 0.989899 0.000000 0.010101 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.920000 0.000000 0.070000 0.010000 0.530000 0.020000 0.400000 0.050000 0.150000 0.210000 0.110000 0.530000 0.230000 0.320000 0.160000 0.290000 0.393939 0.313131 0.121212 0.171717 0.240000 0.290000 0.230000 0.240000 0.150000 0.400000 0.140000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0854.1 MOTIF PH0010.1 Alx1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.440000 0.170000 0.200000 0.070000 0.210000 0.650000 0.070000 0.380000 0.330000 0.140000 0.150000 0.430000 0.090000 0.310000 0.170000 0.050000 0.400000 0.020000 0.530000 0.010000 0.070000 0.000000 0.920000 0.989899 0.000000 0.010101 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.920000 0.000000 0.070000 0.010000 0.530000 0.020000 0.400000 0.050000 0.150000 0.210000 0.110000 0.530000 0.230000 0.320000 0.160000 0.290000 0.393939 0.313131 0.121212 0.171717 0.240000 0.290000 0.230000 0.240000 0.150000 0.400000 0.140000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0010.1 MOTIF PH0011.1 Alx1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.170000 0.410000 0.200000 0.220000 0.333333 0.212121 0.353535 0.101010 0.292929 0.464646 0.101010 0.141414 0.323232 0.202020 0.262626 0.212121 0.019802 0.237624 0.009901 0.732673 0.010000 0.040000 0.000000 0.950000 0.989899 0.000000 0.010101 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.950000 0.000000 0.040000 0.010000 0.732673 0.009901 0.237624 0.019802 0.158416 0.217822 0.198020 0.425743 0.171717 0.232323 0.191919 0.404040 0.242424 0.202020 0.323232 0.232323 0.257426 0.207921 0.287129 0.247525 0.270000 0.340000 0.210000 0.180000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0011.1 MOTIF PH0001.1 Alx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.300000 0.030000 0.130000 0.540000 0.370000 0.200000 0.240000 0.190000 0.410000 0.180000 0.160000 0.250000 0.535354 0.151515 0.232323 0.080808 0.040000 0.480000 0.010000 0.470000 0.000000 0.080808 0.000000 0.919192 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.919192 0.000000 0.080808 0.000000 0.470000 0.010000 0.480000 0.040000 0.080808 0.444444 0.050505 0.424242 0.070000 0.150000 0.100000 0.680000 0.240000 0.270000 0.340000 0.150000 0.430000 0.190000 0.140000 0.240000 0.260000 0.250000 0.290000 0.200000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0001.1 MOTIF PH0002.1 Alx4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.158416 0.584158 0.148515 0.108911 0.100000 0.240000 0.560000 0.100000 0.190000 0.440000 0.160000 0.210000 0.400000 0.150000 0.290000 0.160000 0.020202 0.343434 0.010101 0.626263 0.009901 0.079208 0.000000 0.910891 0.980198 0.009901 0.009901 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.009901 0.009901 0.980198 0.910891 0.000000 0.079208 0.009901 0.626263 0.010101 0.343434 0.020202 0.170000 0.230000 0.180000 0.420000 0.290000 0.280000 0.130000 0.300000 0.360000 0.230000 0.190000 0.220000 0.230000 0.290000 0.250000 0.230000 0.120000 0.430000 0.210000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0002.1 MOTIF MA0853.1 Alx4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.158416 0.584158 0.148515 0.108911 0.100000 0.240000 0.560000 0.100000 0.190000 0.440000 0.160000 0.210000 0.400000 0.150000 0.290000 0.160000 0.020202 0.343434 0.010101 0.626263 0.009901 0.079208 0.000000 0.910891 0.980198 0.009901 0.009901 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.009901 0.009901 0.980198 0.910891 0.000000 0.079208 0.009901 0.626263 0.010101 0.343434 0.020202 0.170000 0.230000 0.180000 0.420000 0.290000 0.280000 0.130000 0.300000 0.360000 0.230000 0.190000 0.220000 0.230000 0.290000 0.250000 0.230000 0.120000 0.430000 0.210000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0853.1 MOTIF MA0166.1 Antp letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.062500 0.062500 0.000000 0.875000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.562500 0.437500 0.937500 0.000000 0.062500 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0166.1