MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0071.1 SYATTGTG letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1008 E= 0 0.000000 0.598214 0.401786 0.000000 0.000000 0.672619 0.000000 0.327381 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0071.1 MOTIF UN0262.1 Sall4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 9248 E= 0 0.148789 0.061311 0.639922 0.149978 0.427660 0.200476 0.066933 0.304931 0.183607 0.048875 0.030601 0.736916 0.979779 0.004109 0.006055 0.010056 0.014814 0.944853 0.013625 0.026708 0.929931 0.009840 0.008218 0.052011 0.802119 0.033196 0.029736 0.134948 0.599373 0.014165 0.016652 0.369810 0.042063 0.019896 0.913603 0.024438 0.030385 0.012868 0.013300 0.943447 0.614619 0.059905 0.111592 0.213884 0.333910 0.074503 0.189879 0.401708 0.157980 0.637219 0.074719 0.130082 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0262.1 MOTIF MA0203.1 Scr letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 25 E= 0 0.120000 0.280000 0.000000 0.600000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.720000 0.280000 0.920000 0.000000 0.080000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0203.1 MOTIF PB0058.1 Sfpi1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 99 E= 0 0.212121 0.272727 0.232323 0.282828 0.300000 0.100000 0.290000 0.310000 0.595960 0.050505 0.151515 0.202020 0.460000 0.050000 0.170000 0.320000 0.190000 0.160000 0.590000 0.060000 0.400000 0.290000 0.290000 0.020000 0.050000 0.000000 0.950000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.979798 0.000000 0.000000 0.020202 0.940000 0.000000 0.000000 0.060000 0.050000 0.270000 0.670000 0.010000 0.059406 0.089109 0.029703 0.821782 0.300000 0.120000 0.270000 0.310000 0.277228 0.277228 0.217822 0.227723 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0058.1 MOTIF PB0162.1 Sfpi1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.260000 0.400000 0.120000 0.220000 0.405941 0.207921 0.178218 0.207921 0.660000 0.050000 0.150000 0.140000 0.480000 0.060000 0.030000 0.430000 0.220000 0.090000 0.020000 0.670000 0.210000 0.110000 0.120000 0.560000 0.310000 0.360000 0.160000 0.170000 0.313131 0.323232 0.292929 0.070707 0.222222 0.060606 0.666667 0.050505 0.120000 0.080000 0.730000 0.070000 0.722772 0.039604 0.099010 0.138614 0.722772 0.108911 0.039604 0.128713 0.220000 0.540000 0.120000 0.120000 0.217822 0.475248 0.118812 0.188119 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0162.1 MOTIF PH0160.1 Shox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.202020 0.424242 0.232323 0.141414 0.190000 0.160000 0.330000 0.320000 0.320000 0.350000 0.160000 0.170000 0.247525 0.267327 0.287129 0.198020 0.020000 0.420000 0.020000 0.540000 0.020000 0.060000 0.000000 0.920000 0.970000 0.010000 0.020000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.020000 0.010000 0.970000 0.920000 0.000000 0.060000 0.020000 0.540000 0.020000 0.420000 0.020000 0.198020 0.148515 0.247525 0.405941 0.120000 0.260000 0.200000 0.420000 0.310000 0.210000 0.360000 0.120000 0.250000 0.170000 0.270000 0.310000 0.121212 0.313131 0.333333 0.232323 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0160.1 MOTIF MA0720.1 Shox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 18179 E= 0 0.131470 0.423291 0.181088 0.264151 0.050500 0.465645 0.011761 0.472093 0.909086 0.031305 0.021303 0.038306 0.988043 0.007500 0.000163 0.004294 0.001592 0.000659 0.000000 0.997750 0.029568 0.026992 0.043089 0.900352 0.941771 0.009998 0.001865 0.046366 0.359886 0.166190 0.348608 0.125316 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0720.1 MOTIF PH0161.1 Six1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.130000 0.400000 0.150000 0.480000 0.210000 0.090000 0.220000 0.210000 0.090000 0.210000 0.490000 0.390000 0.140000 0.400000 0.070000 0.217822 0.049505 0.683168 0.049505 0.040000 0.050000 0.870000 0.040000 0.200000 0.010000 0.790000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050505 0.949495 0.969697 0.000000 0.030303 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.910000 0.020000 0.040000 0.030000 0.180000 0.270000 0.120000 0.430000 0.230000 0.160000 0.300000 0.310000 0.330000 0.160000 0.120000 0.390000 0.160000 0.270000 0.280000 0.290000 0.178218 0.069307 0.227723 0.524752 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0161.1 MOTIF PH0162.1 Six2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.450000 0.100000 0.290000 0.160000 0.584158 0.118812 0.089109 0.207921 0.190000 0.040000 0.260000 0.510000 0.300000 0.110000 0.520000 0.070000 0.120000 0.040000 0.800000 0.040000 0.010000 0.030000 0.920000 0.040000 0.130000 0.000000 0.870000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.960000 0.000000 0.040000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010000 0.980000 0.000000 0.010000 0.909091 0.020202 0.050505 0.020202 0.168317 0.504950 0.079208 0.247525 0.250000 0.170000 0.290000 0.290000 0.340000 0.080000 0.060000 0.520000 0.230000 0.270000 0.220000 0.280000 0.171717 0.080808 0.222222 0.525253 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0162.1 MOTIF PH0163.1 Six3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.333333 0.090909 0.363636 0.212121 0.720000 0.080000 0.080000 0.120000 0.230000 0.050000 0.170000 0.550000 0.474747 0.101010 0.323232 0.101010 0.070000 0.070000 0.820000 0.040000 0.019802 0.019802 0.891089 0.069307 0.160000 0.010000 0.830000 0.000000 0.000000 0.000000 0.040404 0.959596 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.920000 0.030000 0.030000 0.020000 0.190000 0.450000 0.090000 0.270000 0.250000 0.230000 0.200000 0.320000 0.404040 0.080808 0.111111 0.404040 0.336634 0.217822 0.178218 0.267327 0.079208 0.108911 0.237624 0.574257 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0163.1