MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0631.1 Six3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.333333 0.090909 0.363636 0.212121 0.720000 0.080000 0.080000 0.120000 0.230000 0.050000 0.170000 0.550000 0.474747 0.101010 0.323232 0.101010 0.070000 0.070000 0.820000 0.040000 0.019802 0.019802 0.891089 0.069307 0.160000 0.010000 0.830000 0.000000 0.000000 0.000000 0.040404 0.959596 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.920000 0.030000 0.030000 0.020000 0.190000 0.450000 0.090000 0.270000 0.250000 0.230000 0.200000 0.320000 0.404040 0.080808 0.111111 0.404040 0.336634 0.217822 0.178218 0.267327 0.079208 0.108911 0.237624 0.574257 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0631.1 MOTIF MA0204.1 Six4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.350000 0.200000 0.450000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0204.1 MOTIF PH0164.1 Six4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.520000 0.170000 0.140000 0.170000 0.188119 0.178218 0.247525 0.386139 0.410000 0.120000 0.310000 0.160000 0.350000 0.290000 0.130000 0.230000 0.610000 0.120000 0.100000 0.170000 0.019802 0.029703 0.019802 0.930693 0.010101 0.000000 0.969697 0.020202 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.010000 0.810000 0.010000 0.170000 0.970000 0.030000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.000000 0.000000 0.000000 0.970000 0.010000 0.020000 0.210000 0.230000 0.210000 0.350000 0.340000 0.300000 0.100000 0.260000 0.128713 0.287129 0.247525 0.336634 0.170000 0.300000 0.250000 0.280000 0.410000 0.210000 0.300000 0.080000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0164.1 MOTIF PB0059.1 Six6_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.160000 0.290000 0.230000 0.400000 0.170000 0.110000 0.320000 0.360000 0.060000 0.180000 0.400000 0.376238 0.148515 0.336634 0.138614 0.120000 0.030000 0.820000 0.030000 0.020202 0.020202 0.929293 0.030303 0.150000 0.010000 0.840000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010000 0.970000 0.000000 0.020000 0.940000 0.010000 0.030000 0.020000 0.260000 0.320000 0.080000 0.340000 0.350000 0.170000 0.180000 0.300000 0.240000 0.140000 0.140000 0.480000 0.350000 0.220000 0.170000 0.260000 0.181818 0.212121 0.171717 0.434343 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0059.1 MOTIF PH0165.1 Six6_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.330000 0.120000 0.280000 0.270000 0.610000 0.100000 0.070000 0.220000 0.180000 0.050000 0.130000 0.640000 0.434343 0.171717 0.323232 0.070707 0.130000 0.040000 0.810000 0.020000 0.020202 0.030303 0.919192 0.030303 0.140000 0.010000 0.850000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.950000 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.010000 0.980000 0.000000 0.010000 0.940594 0.009901 0.019802 0.029703 0.370000 0.310000 0.060000 0.260000 0.267327 0.207921 0.217822 0.306931 0.292929 0.131313 0.090909 0.484848 0.350000 0.200000 0.180000 0.270000 0.090909 0.111111 0.191919 0.606061 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0165.1 MOTIF PB0163.1 Six6_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.333333 0.272727 0.212121 0.181818 0.272727 0.171717 0.202020 0.353535 0.141414 0.282828 0.313131 0.262626 0.111111 0.313131 0.474747 0.101010 0.029703 0.069307 0.485149 0.415842 0.800000 0.060000 0.130000 0.010000 0.050000 0.060000 0.010000 0.880000 0.900000 0.030000 0.040000 0.030000 0.010000 0.020000 0.040000 0.930000 0.929293 0.050505 0.010101 0.010101 0.019802 0.148515 0.039604 0.792079 0.440000 0.490000 0.030000 0.040000 0.090000 0.630000 0.120000 0.160000 0.330000 0.180000 0.350000 0.140000 0.190000 0.330000 0.160000 0.320000 0.240000 0.360000 0.130000 0.270000 0.151515 0.131313 0.232323 0.484848 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0163.1 MOTIF PH0166.1 Six6_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.356436 0.099010 0.346535 0.198020 0.415842 0.108911 0.158416 0.316832 0.280000 0.110000 0.180000 0.430000 0.460000 0.140000 0.300000 0.100000 0.188119 0.039604 0.722772 0.049505 0.040404 0.020202 0.898990 0.040404 0.200000 0.020000 0.780000 0.000000 0.009901 0.000000 0.029703 0.960396 0.970000 0.000000 0.020000 0.010000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.019802 0.950495 0.009901 0.019802 0.930000 0.020000 0.010000 0.040000 0.410000 0.140000 0.100000 0.350000 0.217822 0.237624 0.207921 0.336634 0.414141 0.131313 0.080808 0.373737 0.210000 0.270000 0.110000 0.410000 0.090000 0.160000 0.220000 0.530000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0166.1 MOTIF UN0263.1 Smad1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 8304 E= 0 0.226156 0.231214 0.225434 0.317197 0.213150 0.241811 0.205804 0.339234 0.098627 0.372953 0.196411 0.332009 0.037693 0.808285 0.067558 0.086464 0.020231 0.029624 0.006262 0.943882 0.016739 0.010959 0.006864 0.965438 0.964475 0.012645 0.012524 0.010356 0.007948 0.007587 0.005178 0.979287 0.008309 0.978203 0.005901 0.007587 0.152457 0.020352 0.031671 0.795520 0.123796 0.512885 0.192919 0.170400 0.214355 0.220857 0.105853 0.458935 0.245544 0.249759 0.247712 0.256985 0.262885 0.268666 0.200506 0.267943 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0263.1 MOTIF MA1622.1 Smad2::Smad3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 10345 E= 0 0.289512 0.217883 0.252779 0.239826 0.242436 0.243113 0.224650 0.289802 0.241566 0.158724 0.336298 0.263412 0.430256 0.213823 0.279169 0.076752 0.007637 0.005703 0.005413 0.981247 0.008700 0.007927 0.944224 0.039149 0.980280 0.004253 0.005607 0.009860 0.060609 0.723055 0.149058 0.067279 0.023876 0.005123 0.006573 0.964427 0.068729 0.912808 0.008700 0.009763 0.972064 0.008217 0.007637 0.012083 0.066022 0.197873 0.191300 0.544804 0.284969 0.239633 0.208217 0.267182 0.265442 0.250846 0.243983 0.239729 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1622.1 MOTIF PB0060.1 Smad3_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.282828 0.414141 0.111111 0.191919 0.336634 0.138614 0.267327 0.257426 0.400000 0.170000 0.170000 0.260000 0.366337 0.198020 0.207921 0.227723 0.242424 0.181818 0.222222 0.353535 0.029703 0.801980 0.039604 0.128713 0.000000 0.820000 0.040000 0.140000 0.930000 0.060000 0.010000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.970000 0.020000 0.000000 0.010000 0.010101 0.989899 0.000000 0.000000 0.670000 0.010000 0.280000 0.040000 0.131313 0.171717 0.333333 0.363636 0.200000 0.290000 0.250000 0.260000 0.424242 0.191919 0.161616 0.222222 0.212121 0.292929 0.292929 0.202020 0.370000 0.290000 0.150000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0060.1