MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0164.1 Smad3_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.150000 0.130000 0.250000 0.470000 0.316832 0.287129 0.148515 0.247525 0.260000 0.410000 0.110000 0.220000 0.210000 0.220000 0.350000 0.220000 0.170000 0.510000 0.080000 0.240000 0.050000 0.760000 0.090000 0.100000 0.050000 0.790000 0.120000 0.040000 0.000000 0.949495 0.030303 0.020202 0.040000 0.050000 0.890000 0.020000 0.000000 0.919192 0.020202 0.060606 0.030000 0.940000 0.010000 0.020000 0.640000 0.140000 0.110000 0.110000 0.240000 0.390000 0.180000 0.190000 0.210000 0.270000 0.090000 0.430000 0.090000 0.450000 0.210000 0.250000 0.180000 0.270000 0.150000 0.400000 0.100000 0.250000 0.370000 0.280000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0164.1 MOTIF MA1153.1 Smad4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.088235 0.250000 0.080882 0.580883 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.595588 0.000000 0.404412 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.492647 0.272059 0.125000 0.110294 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1153.1 MOTIF UN0104.1 Smp_097750 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 998 E= 0 0.009018 0.009018 0.009018 0.972946 0.972946 0.009018 0.009018 0.009018 0.009018 0.009018 0.972946 0.009018 0.972946 0.009018 0.009018 0.009018 0.009018 0.009018 0.009018 0.972946 0.972946 0.009018 0.009018 0.009018 0.009018 0.009018 0.972946 0.009018 0.972946 0.009018 0.009018 0.009018 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0104.1 MOTIF MA0870.1 Sox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 2316 E= 0 0.591105 0.170984 0.153713 0.084197 0.930868 0.020498 0.014469 0.034164 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.991863 0.005139 0.000000 0.002998 0.876941 0.123059 0.000000 0.000000 0.005582 0.000000 0.000000 0.994418 0.627612 0.001866 0.133955 0.236567 0.337505 0.219249 0.226586 0.216659 0.001664 0.963394 0.021215 0.013727 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.095312 0.904687 0.000000 0.006009 0.000000 0.993991 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.029119 0.095835 0.021379 0.853668 0.095896 0.142117 0.114471 0.647516 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0870.1 MOTIF MA0869.1 Sox11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 305 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.003268 0.000000 0.996732 0.050617 0.048148 0.376543 0.524691 0.000000 0.996732 0.000000 0.003268 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.754950 0.245050 0.000000 0.000000 0.006515 0.993485 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.003077 0.043077 0.015385 0.938462 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0869.1 MOTIF PB0061.1 Sox11_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.350000 0.240000 0.140000 0.270000 0.198020 0.237624 0.277228 0.287129 0.350000 0.170000 0.210000 0.270000 0.484848 0.111111 0.171717 0.232323 0.280000 0.070000 0.480000 0.170000 0.868687 0.040404 0.080808 0.010101 0.980000 0.000000 0.000000 0.020000 0.009901 0.970297 0.009901 0.009901 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.696970 0.000000 0.000000 0.303030 0.190000 0.000000 0.800000 0.010000 0.350000 0.070000 0.570000 0.010000 0.540000 0.180000 0.190000 0.090000 0.200000 0.300000 0.210000 0.290000 0.290000 0.200000 0.180000 0.330000 0.386139 0.217822 0.148515 0.247525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0061.1 MOTIF PB0165.1 Sox11_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.450000 0.140000 0.200000 0.210000 0.380000 0.120000 0.260000 0.240000 0.828283 0.000000 0.141414 0.030303 0.940000 0.010000 0.040000 0.010000 0.010000 0.020000 0.020000 0.950000 0.020000 0.020000 0.010000 0.950000 0.171717 0.020202 0.797980 0.010101 0.080808 0.010101 0.010101 0.898990 0.110000 0.270000 0.100000 0.520000 0.380000 0.190000 0.140000 0.290000 0.227723 0.178218 0.267327 0.326733 0.250000 0.150000 0.460000 0.140000 0.350000 0.110000 0.300000 0.240000 0.350000 0.170000 0.200000 0.280000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0165.1 MOTIF PB0062.1 Sox12_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 99 E= 0 0.121212 0.232323 0.111111 0.535354 0.415842 0.237624 0.029703 0.316832 0.848485 0.000000 0.010101 0.141414 0.010000 0.010000 0.010000 0.970000 0.020000 0.000000 0.010000 0.970000 0.050000 0.010000 0.930000 0.010000 0.020000 0.000000 0.010000 0.970000 0.040000 0.060000 0.020000 0.880000 0.230000 0.420000 0.180000 0.170000 0.160000 0.110000 0.070000 0.660000 0.290000 0.260000 0.200000 0.250000 0.564356 0.108911 0.108911 0.217822 0.420000 0.150000 0.090000 0.340000 0.270000 0.280000 0.200000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0062.1 MOTIF PB0166.1 Sox12_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.376238 0.316832 0.207921 0.099010 0.353535 0.323232 0.222222 0.101010 0.323232 0.181818 0.212121 0.282828 0.138614 0.326733 0.207921 0.326733 0.660000 0.060000 0.150000 0.130000 0.050000 0.290000 0.540000 0.120000 0.881188 0.039604 0.039604 0.039604 0.040404 0.696970 0.090909 0.171717 0.880000 0.040000 0.020000 0.060000 0.860000 0.040000 0.070000 0.030000 0.790000 0.050000 0.040000 0.120000 0.090000 0.140000 0.710000 0.060000 0.297030 0.128713 0.485149 0.089109 0.656566 0.131313 0.111111 0.101010 0.350000 0.130000 0.220000 0.300000 0.200000 0.200000 0.100000 0.500000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0166.1 MOTIF PB0063.1 Sox13_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.270000 0.120000 0.170000 0.440000 0.188119 0.237624 0.178218 0.396040 0.370000 0.140000 0.160000 0.330000 0.500000 0.110000 0.280000 0.110000 0.130000 0.090000 0.620000 0.160000 0.821782 0.019802 0.128713 0.029703 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.020000 0.900000 0.010000 0.070000 0.940000 0.010000 0.010000 0.040000 0.950000 0.010000 0.030000 0.010000 0.039604 0.029703 0.009901 0.920792 0.465347 0.019802 0.079208 0.435644 0.415842 0.089109 0.118812 0.376238 0.360000 0.100000 0.180000 0.360000 0.210000 0.200000 0.120000 0.470000 0.303030 0.161616 0.070707 0.464646 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0063.1