MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0071.1 Sox4_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.430000 0.230000 0.120000 0.220000 0.200000 0.240000 0.300000 0.260000 0.300000 0.160000 0.290000 0.250000 0.430000 0.150000 0.200000 0.220000 0.257426 0.079208 0.475248 0.188119 0.840000 0.050000 0.100000 0.010000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.000000 0.980000 0.010000 0.010000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.777778 0.000000 0.000000 0.222222 0.240000 0.000000 0.760000 0.000000 0.370000 0.090000 0.530000 0.010000 0.480000 0.200000 0.240000 0.080000 0.188119 0.356436 0.217822 0.237624 0.250000 0.230000 0.160000 0.360000 0.404040 0.181818 0.161616 0.252525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0071.1 MOTIF PB0175.1 Sox4_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.217822 0.247525 0.405941 0.128713 0.267327 0.237624 0.297030 0.198020 0.470000 0.160000 0.120000 0.250000 0.410000 0.110000 0.240000 0.240000 0.430000 0.100000 0.290000 0.180000 0.782178 0.009901 0.168317 0.039604 0.930000 0.010000 0.040000 0.020000 0.010101 0.020202 0.010101 0.959596 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.120000 0.030000 0.840000 0.010000 0.100000 0.010000 0.010000 0.880000 0.130000 0.240000 0.090000 0.540000 0.343434 0.202020 0.242424 0.212121 0.230000 0.270000 0.290000 0.210000 0.290000 0.100000 0.420000 0.190000 0.310000 0.180000 0.280000 0.230000 0.445545 0.158416 0.207921 0.188119 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0175.1 MOTIF MA0087.1 Sox5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.043478 0.000000 0.956522 0.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.956522 0.043478 0.043478 0.000000 0.913043 0.347826 0.130435 0.173913 0.347826 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0087.1 MOTIF PB0072.1 Sox5_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.130000 0.170000 0.390000 0.257426 0.198020 0.148515 0.396040 0.260000 0.120000 0.260000 0.360000 0.450000 0.090000 0.290000 0.170000 0.150000 0.090000 0.630000 0.130000 0.821782 0.029703 0.128713 0.019802 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.009901 0.930693 0.009901 0.049505 0.970000 0.000000 0.010000 0.020000 0.979798 0.000000 0.010101 0.010101 0.030303 0.010101 0.000000 0.959596 0.485149 0.019802 0.089109 0.405941 0.454545 0.101010 0.242424 0.202020 0.434343 0.111111 0.222222 0.232323 0.333333 0.252525 0.090909 0.323232 0.333333 0.111111 0.181818 0.373737 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0072.1 MOTIF PB0176.1 Sox5_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.250000 0.230000 0.240000 0.280000 0.350000 0.220000 0.160000 0.270000 0.247525 0.128713 0.217822 0.405941 0.009901 0.732673 0.089109 0.168317 0.570000 0.060000 0.190000 0.180000 0.151515 0.020202 0.161616 0.666667 0.540000 0.280000 0.130000 0.050000 0.752475 0.099010 0.039604 0.108911 0.170000 0.100000 0.090000 0.640000 0.099010 0.227723 0.069307 0.603960 0.350000 0.170000 0.180000 0.300000 0.606061 0.202020 0.111111 0.080808 0.141414 0.303030 0.454545 0.101010 0.250000 0.240000 0.260000 0.250000 0.290000 0.210000 0.250000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0176.1 MOTIF MA0515.1 Sox6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 249 E= 0 0.016064 0.558233 0.200803 0.224900 0.000000 0.887550 0.000000 0.112450 0.646586 0.000000 0.000000 0.353414 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.461847 0.020080 0.518072 0.016064 0.449799 0.000000 0.534137 0.056225 0.305221 0.124498 0.514056 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0515.1 MOTIF PB0073.1 Sox7_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 100 E= 0 0.360000 0.300000 0.120000 0.220000 0.306931 0.227723 0.168317 0.297030 0.150000 0.180000 0.240000 0.430000 0.376238 0.099010 0.277228 0.247525 0.393939 0.171717 0.131313 0.303030 0.444444 0.070707 0.212121 0.272727 0.363636 0.070707 0.373737 0.191919 0.790000 0.040000 0.090000 0.080000 0.969697 0.000000 0.000000 0.030303 0.000000 0.959596 0.010101 0.030303 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.060606 0.000000 0.000000 0.939394 0.500000 0.020000 0.240000 0.240000 0.310000 0.090000 0.530000 0.070000 0.415842 0.198020 0.158416 0.227723 0.340000 0.220000 0.190000 0.250000 0.190000 0.300000 0.170000 0.340000 0.240000 0.140000 0.130000 0.490000 0.290000 0.270000 0.120000 0.320000 0.220000 0.300000 0.230000 0.250000 0.490000 0.170000 0.080000 0.260000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0073.1 MOTIF PB0177.1 Sox7_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 100 E= 0 0.070000 0.130000 0.650000 0.150000 0.160000 0.110000 0.150000 0.580000 0.207921 0.267327 0.356436 0.168317 0.090909 0.464646 0.272727 0.171717 0.290000 0.100000 0.150000 0.460000 0.640000 0.180000 0.070000 0.110000 0.750000 0.040000 0.090000 0.120000 0.080808 0.060606 0.040404 0.818182 0.141414 0.040404 0.020202 0.797980 0.250000 0.090000 0.620000 0.040000 0.297030 0.039604 0.029703 0.633663 0.190000 0.310000 0.340000 0.160000 0.180000 0.190000 0.100000 0.530000 0.148515 0.168317 0.554455 0.128713 0.270000 0.240000 0.210000 0.280000 0.220000 0.110000 0.570000 0.100000 0.180000 0.180000 0.300000 0.340000 0.330000 0.200000 0.270000 0.200000 0.230000 0.360000 0.180000 0.230000 0.060000 0.070000 0.460000 0.410000 0.202020 0.323232 0.303030 0.171717 0.180000 0.290000 0.200000 0.330000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0177.1 MOTIF PB0074.1 Sox8_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.200000 0.280000 0.280000 0.240000 0.140000 0.280000 0.340000 0.510000 0.130000 0.140000 0.220000 0.188119 0.089109 0.128713 0.594059 0.150000 0.330000 0.190000 0.330000 0.380000 0.130000 0.040000 0.450000 0.940594 0.009901 0.009901 0.039604 0.010000 0.030000 0.000000 0.960000 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.148515 0.039604 0.801980 0.009901 0.110000 0.010000 0.010000 0.870000 0.090000 0.100000 0.060000 0.750000 0.252525 0.434343 0.080808 0.232323 0.250000 0.170000 0.150000 0.430000 0.207921 0.138614 0.297030 0.356436 0.320000 0.150000 0.160000 0.370000 0.480000 0.130000 0.150000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0074.1 MOTIF PB0178.1 Sox8_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.410000 0.170000 0.210000 0.210000 0.170000 0.500000 0.130000 0.200000 0.850000 0.040000 0.020000 0.090000 0.020000 0.030000 0.030000 0.920000 0.030000 0.020000 0.020000 0.930000 0.060000 0.810000 0.030000 0.100000 0.910000 0.020000 0.060000 0.010000 0.050000 0.120000 0.160000 0.670000 0.230000 0.090000 0.570000 0.110000 0.420000 0.190000 0.160000 0.230000 0.260000 0.340000 0.200000 0.200000 0.525253 0.202020 0.111111 0.161616 0.198020 0.287129 0.277228 0.237624 0.227723 0.277228 0.366337 0.128713 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0178.1