MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0603.1 Arntl letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.251000 0.229000 0.261000 0.259000 0.246000 0.125000 0.558000 0.071000 0.061938 0.043956 0.142857 0.751249 0.003000 0.997000 0.000000 0.000000 0.953000 0.016000 0.010000 0.021000 0.002000 0.965000 0.009000 0.024000 0.048000 0.003000 0.946000 0.003000 0.054000 0.058000 0.051000 0.837000 0.009009 0.004004 0.938939 0.048048 0.255000 0.331000 0.146000 0.268000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0603.1 MOTIF PH0003.1 Arx letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.220000 0.400000 0.140000 0.130000 0.160000 0.190000 0.520000 0.158416 0.366337 0.287129 0.188119 0.217822 0.554455 0.128713 0.099010 0.495050 0.059406 0.376238 0.069307 0.010000 0.380000 0.010000 0.600000 0.010000 0.130000 0.000000 0.860000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.980198 0.000000 0.009901 0.009901 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.860000 0.000000 0.130000 0.010000 0.600000 0.010000 0.380000 0.010000 0.160000 0.160000 0.140000 0.540000 0.180000 0.110000 0.440000 0.270000 0.090000 0.360000 0.370000 0.180000 0.530000 0.100000 0.070000 0.300000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0003.1 MOTIF MA0874.1 Arx letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.220000 0.400000 0.140000 0.130000 0.160000 0.190000 0.520000 0.158416 0.366337 0.287129 0.188119 0.217822 0.554455 0.128713 0.099010 0.495050 0.059406 0.376238 0.069307 0.010000 0.380000 0.010000 0.600000 0.010000 0.130000 0.000000 0.860000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.980198 0.000000 0.009901 0.009901 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.860000 0.000000 0.130000 0.010000 0.600000 0.010000 0.380000 0.010000 0.160000 0.160000 0.140000 0.540000 0.180000 0.110000 0.440000 0.270000 0.090000 0.360000 0.370000 0.180000 0.530000 0.100000 0.070000 0.300000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0874.1 MOTIF MA0816.1 Ascl2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 352 E= 0 0.673295 0.102273 0.178977 0.045455 0.374269 0.119883 0.502924 0.002924 0.009868 0.986842 0.000000 0.003289 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 0.020115 0.066092 0.862069 0.051724 0.009804 0.980392 0.006536 0.003268 0.013158 0.000000 0.000000 0.986842 0.000000 0.003300 0.990099 0.006601 0.018692 0.641745 0.046729 0.292835 0.093923 0.279006 0.077348 0.549724 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0816.1 MOTIF PB0003.1 Ascl2_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.168317 0.326733 0.188119 0.316832 0.150000 0.190000 0.240000 0.420000 0.090909 0.484848 0.121212 0.303030 0.470000 0.200000 0.230000 0.100000 0.290000 0.180000 0.450000 0.080000 0.010000 0.970000 0.010000 0.010000 0.950000 0.010000 0.010000 0.030000 0.010000 0.180000 0.760000 0.050000 0.050000 0.820000 0.120000 0.010000 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.009901 0.009901 0.970297 0.009901 0.040000 0.720000 0.090000 0.150000 0.120000 0.240000 0.170000 0.470000 0.320000 0.320000 0.290000 0.070000 0.200000 0.370000 0.160000 0.270000 0.220000 0.210000 0.190000 0.380000 0.148515 0.138614 0.386139 0.326733 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0003.1 MOTIF PB0107.1 Ascl2_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.110000 0.350000 0.290000 0.250000 0.190000 0.250000 0.120000 0.440000 0.340000 0.300000 0.200000 0.160000 0.310000 0.120000 0.160000 0.410000 0.141414 0.606061 0.121212 0.131313 0.079208 0.712871 0.138614 0.069307 0.148515 0.683168 0.069307 0.099010 0.138614 0.643564 0.128713 0.089109 0.340000 0.090000 0.370000 0.200000 0.030303 0.636364 0.070707 0.262626 0.120000 0.620000 0.100000 0.160000 0.110000 0.630000 0.090000 0.170000 0.200000 0.250000 0.220000 0.330000 0.420000 0.120000 0.280000 0.180000 0.108911 0.217822 0.247525 0.425743 0.190000 0.300000 0.150000 0.360000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0107.1 MOTIF MA1400.1 At1g19000 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 599 E= 0 0.454090 0.036728 0.121870 0.387312 0.532554 0.015025 0.046745 0.405676 0.470785 0.045075 0.227045 0.257095 0.055092 0.135225 0.001669 0.808013 0.048414 0.000000 0.951586 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.968280 0.013356 0.008347 0.010017 0.924875 0.000000 0.055092 0.020033 0.136895 0.093489 0.564274 0.205342 0.287145 0.101836 0.532554 0.078464 0.268781 0.143573 0.080134 0.507513 0.282137 0.118531 0.143573 0.455760 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1400.1 MOTIF MA1186.1 At1g49010 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 599 E= 0 0.315526 0.253756 0.140234 0.290484 0.332220 0.171953 0.103506 0.392321 0.270451 0.186978 0.105175 0.437396 0.542571 0.108514 0.090150 0.258765 0.550918 0.033389 0.051753 0.363940 0.023372 0.535893 0.051753 0.388982 0.148581 0.714524 0.111853 0.025042 0.030050 0.020033 0.000000 0.949917 0.040067 0.090150 0.000000 0.869783 0.998331 0.000000 0.000000 0.001669 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.135225 0.465776 0.006678 0.392321 0.405676 0.081803 0.078464 0.434057 0.323873 0.337229 0.040067 0.298831 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1186.1 MOTIF MA1288.1 At1g72010 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 595 E= 0 0.381513 0.156303 0.183193 0.278992 0.277311 0.146218 0.188235 0.388235 0.020168 0.003361 0.976471 0.000000 0.000000 0.042017 0.000000 0.957983 0.001681 0.000000 0.998319 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.095798 0.005042 0.862185 0.036975 0.289076 0.381513 0.097479 0.231933 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.001681 0.998319 0.000000 0.000000 0.075630 0.737815 0.015126 0.171429 0.741176 0.042017 0.146218 0.070588 0.085714 0.539496 0.117647 0.257143 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1288.1 MOTIF MA1397.1 At1g74840 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 600 E= 0 0.500000 0.013333 0.023333 0.463333 0.425000 0.053333 0.190000 0.331667 0.076667 0.153333 0.003333 0.766667 0.065000 0.000000 0.935000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.963333 0.010000 0.008333 0.018333 0.915000 0.000000 0.063333 0.021667 0.280000 0.100000 0.391667 0.228333 0.346667 0.120000 0.380000 0.153333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1397.1