MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0117.1 TGTYNNNNNRGCARM letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 256 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.390625 0.000000 0.609375 0.214844 0.101562 0.277344 0.406250 0.089844 0.425781 0.136719 0.347656 0.128906 0.468750 0.234375 0.167969 0.457031 0.210938 0.207031 0.125000 0.246094 0.238281 0.132812 0.382812 0.531250 0.000000 0.468750 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.542969 0.000000 0.457031 0.000000 0.312500 0.687500 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0117.1 MOTIF MA0597.1 THAP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 199 E= 0 0.090452 0.467337 0.135678 0.306533 0.075377 0.236181 0.060302 0.628141 0.100503 0.000000 0.688442 0.211055 0.035176 0.914573 0.000000 0.050251 0.015075 0.979899 0.000000 0.005025 0.291457 0.683417 0.005025 0.020101 0.236181 0.085427 0.386935 0.291457 0.150754 0.356784 0.206030 0.286432 0.582915 0.170854 0.085427 0.160804 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0597.1 MOTIF MA1573.1 THAP11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 451 E= 0 0.341463 0.161863 0.337029 0.159645 0.443459 0.042129 0.474501 0.039911 0.432373 0.011086 0.538803 0.017738 0.982262 0.011086 0.004435 0.002217 0.000000 0.993348 0.002217 0.004435 0.004435 0.033259 0.002217 0.960089 0.911308 0.035477 0.022173 0.031042 0.002217 0.988914 0.002217 0.006652 0.891353 0.017738 0.075388 0.015521 0.365854 0.086475 0.073171 0.474501 0.070953 0.237251 0.104213 0.587583 0.006652 0.037694 0.011086 0.944568 0.008869 0.975610 0.002217 0.013304 0.002217 0.993348 0.002217 0.002217 0.004435 0.982262 0.004435 0.008869 0.849224 0.011086 0.128603 0.011086 0.075388 0.050998 0.809313 0.064302 0.339246 0.407982 0.197339 0.055432 0.547672 0.186253 0.188470 0.077605 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1573.1 MOTIF MA0407.1 THI2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1265 E= 0 0.081423 0.000000 0.918577 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.517504 0.436073 0.000000 0.046423 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.809486 0.000000 0.190514 0.000000 0.402819 0.000000 0.597181 0.053343 0.450038 0.429001 0.067618 0.346519 0.000000 0.000000 0.653481 0.728063 0.000000 0.000000 0.271937 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.643196 0.000000 0.356804 0.000000 0.100311 0.830482 0.069207 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0407.1 MOTIF MA1574.1 THRB letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 8627 E= 0 0.267300 0.161933 0.429466 0.141301 0.452989 0.026192 0.512536 0.008283 0.018079 0.005630 0.933853 0.042438 0.009778 0.001316 0.811019 0.177886 0.002104 0.013889 0.076389 0.907618 0.003088 0.760939 0.072689 0.163285 0.910684 0.001689 0.086254 0.001372 0.695477 0.013303 0.163267 0.127953 0.815312 0.004064 0.179584 0.001040 0.002753 0.000688 0.989561 0.006998 0.003369 0.001310 0.807224 0.188097 0.002234 0.023895 0.135988 0.837882 0.011293 0.716267 0.060284 0.212156 0.680982 0.011684 0.289571 0.017763 0.224438 0.253884 0.250406 0.271273 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1574.1 MOTIF MA1575.1 THRB(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 4111 E= 0 0.245682 0.151788 0.398930 0.203600 0.005451 0.129560 0.003145 0.861845 0.048138 0.122636 0.785291 0.043935 0.615327 0.052537 0.064661 0.267475 0.007001 0.992516 0.000483 0.000000 0.000243 0.997331 0.000485 0.001941 0.000000 0.219530 0.014350 0.766120 0.069569 0.367794 0.212114 0.350523 0.596935 0.058623 0.329117 0.015325 0.257845 0.251277 0.228412 0.262467 0.015325 0.307954 0.075894 0.600827 0.357247 0.219844 0.361868 0.061041 0.754035 0.019442 0.226156 0.000367 0.000000 0.000729 0.999271 0.000000 0.000000 0.000000 0.992755 0.007245 0.256847 0.071516 0.046105 0.625533 0.037639 0.777568 0.129752 0.055041 0.865474 0.001053 0.132421 0.001053 0.203114 0.401119 0.148382 0.247385 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1575.1 MOTIF MA1576.1 THRB(var.3) letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 389 E= 0 0.305913 0.079692 0.403599 0.210797 0.000000 0.020566 0.000000 0.979434 0.050817 0.161525 0.705989 0.081670 0.784274 0.038306 0.034274 0.143145 0.000000 0.948780 0.009756 0.041463 0.000000 0.831197 0.126068 0.042735 0.025243 0.145631 0.073786 0.755340 0.028278 0.344473 0.239075 0.388175 0.676093 0.071979 0.228792 0.023136 0.108247 0.569588 0.182990 0.139175 0.259542 0.218830 0.521628 0.000000 0.000000 0.000000 0.015038 0.984962 0.000000 0.000000 0.992347 0.007653 0.800412 0.022634 0.000000 0.176955 0.000000 0.994885 0.000000 0.005115 0.017370 0.965261 0.007444 0.009926 0.000000 0.022613 0.000000 0.977387 0.000000 0.378788 0.158009 0.463203 0.797531 0.019753 0.182716 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1576.1 MOTIF MA1220.1 TINY letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 596 E= 0 0.244966 0.379195 0.110738 0.265101 0.248322 0.164430 0.236577 0.350671 0.092282 0.536913 0.088926 0.281879 0.068792 0.724832 0.038591 0.167785 0.684564 0.000000 0.312081 0.003356 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.895973 0.055369 0.000000 0.048658 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.813758 0.003356 0.159396 0.023490 0.355705 0.317114 0.137584 0.189597 0.340604 0.213087 0.107383 0.338926 0.327181 0.110738 0.276846 0.285235 0.258389 0.290268 0.159396 0.291946 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1220.1 MOTIF MA1577.1 TLX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 7799 E= 0 0.127837 0.329786 0.237338 0.305039 0.077559 0.421522 0.060102 0.440817 0.989846 0.000000 0.010154 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.280072 0.169659 0.441011 0.109259 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1577.1 MOTIF UN0138.1 TLX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 212 E= 0 0.179245 0.179245 0.349057 0.292453 0.926087 0.021739 0.030435 0.021739 0.986111 0.000000 0.000000 0.013889 0.067797 0.021186 0.008475 0.902542 0.080586 0.043956 0.095238 0.780220 0.022321 0.017857 0.950893 0.008929 0.150235 0.319249 0.262911 0.267606 0.169014 0.239437 0.281690 0.309859 0.164319 0.305164 0.276995 0.253521 0.240566 0.193396 0.254717 0.311321 0.309859 0.117371 0.286385 0.286385 0.299065 0.271028 0.158879 0.271028 0.295775 0.276995 0.169014 0.258216 0.240566 0.283019 0.301887 0.174528 0.333333 0.258216 0.239437 0.169014 0.264151 0.273585 0.334906 0.127358 0.004505 0.959459 0.018018 0.018018 0.780220 0.102564 0.062271 0.054945 0.918103 0.004310 0.021552 0.056034 0.017778 0.031111 0.004444 0.946667 0.025974 0.030303 0.021645 0.922078 0.291080 0.352113 0.159624 0.197183 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0138.1