MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0422.1 URC2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 101 E= 0 0.247525 0.376238 0.108911 0.267327 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.740000 0.090000 0.170000 0.000000 0.230000 0.170000 0.460000 0.140000 0.565657 0.000000 0.000000 0.434343 0.141414 0.000000 0.000000 0.858586 0.940000 0.060000 0.000000 0.000000 0.360000 0.170000 0.150000 0.320000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0422.1 MOTIF MA0093.1 USF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 30 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.933333 0.000000 0.066667 0.033333 0.000000 0.966667 0.000000 0.000000 0.033333 0.033333 0.933333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.300000 0.066667 0.466667 0.166667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0093.1 MOTIF MA0093.2 USF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 16842 E= 0 0.287733 0.223489 0.425246 0.063532 0.087401 0.442228 0.177117 0.293255 0.002553 0.997447 0.000000 0.000000 0.984028 0.000000 0.000000 0.015972 0.011163 0.610319 0.055338 0.323180 0.095297 0.035328 0.869374 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.876499 0.000000 0.081641 0.041860 0.000000 0.781736 0.000000 0.218264 0.108123 0.589360 0.066085 0.236433 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0093.2 MOTIF MA0093.3 USF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 55334 E= 0 0.260599 0.189142 0.264720 0.285539 0.290870 0.113420 0.375682 0.220027 0.136878 0.054758 0.778798 0.029566 0.069415 0.172462 0.070698 0.687425 0.009632 0.967506 0.013843 0.009018 0.969639 0.011819 0.008620 0.009922 0.007554 0.238280 0.066252 0.687913 0.062403 0.025066 0.904977 0.007554 0.008096 0.004771 0.010861 0.976271 0.007283 0.014765 0.969277 0.008675 0.823852 0.055029 0.084559 0.036560 0.033343 0.749087 0.054542 0.163028 0.203853 0.351610 0.125474 0.319062 0.254581 0.261593 0.186739 0.297087 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0093.3 MOTIF MA0526.1 USF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 13819 E= 0 0.287720 0.150011 0.515594 0.046675 0.108184 0.324915 0.138143 0.428758 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.351907 0.099139 0.548954 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.756422 0.053911 0.185831 0.003835 0.000000 0.718504 0.052753 0.228743 0.158043 0.479991 0.032926 0.329040 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0526.1 MOTIF MA0526.2 USF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 6730 E= 0 0.202526 0.295394 0.274889 0.227192 0.206984 0.278603 0.282021 0.232392 0.258247 0.203418 0.284844 0.253492 0.227340 0.079643 0.546805 0.146211 0.125111 0.037593 0.830609 0.006686 0.028232 0.072808 0.026746 0.872214 0.001932 0.989896 0.006389 0.001783 0.985884 0.005052 0.006538 0.002526 0.001634 0.961516 0.009510 0.027340 0.071768 0.004309 0.922140 0.001783 0.009361 0.010104 0.008470 0.972065 0.002080 0.002823 0.991976 0.003120 0.399851 0.068648 0.444577 0.086924 0.047400 0.448143 0.182021 0.322437 0.177117 0.388856 0.189302 0.244725 0.266270 0.281724 0.231055 0.220951 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0526.2 MOTIF MA0526.3 USF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 38218 E= 0 0.247187 0.201554 0.260532 0.290727 0.275969 0.144147 0.374928 0.204956 0.171699 0.083704 0.696295 0.048302 0.072060 0.170705 0.081035 0.676200 0.009550 0.967005 0.013737 0.009707 0.966377 0.014286 0.008609 0.010728 0.008164 0.287273 0.049976 0.654587 0.045633 0.020619 0.926605 0.007143 0.009341 0.005181 0.013031 0.972448 0.008792 0.014653 0.967555 0.009001 0.818803 0.055785 0.084986 0.040426 0.037888 0.745068 0.062824 0.154221 0.201423 0.361243 0.122743 0.314590 0.262573 0.256241 0.200612 0.280575 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0526.3 MOTIF MA0413.1 USV1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 997 E= 0 0.269809 0.223671 0.250752 0.255767 0.306613 0.182365 0.216433 0.294589 0.342342 0.168168 0.206206 0.283283 0.131263 0.193387 0.146293 0.529058 0.133400 0.055165 0.157472 0.653962 0.318637 0.552104 0.101202 0.028056 0.001003 0.969910 0.026078 0.003009 0.000000 0.979940 0.000000 0.020060 0.003006 0.994990 0.001002 0.001002 0.001002 0.982966 0.000000 0.016032 0.000000 0.006012 0.003006 0.990982 0.000000 0.002006 0.871615 0.126379 0.958877 0.000000 0.036108 0.005015 0.851703 0.092184 0.021042 0.035070 0.174349 0.257515 0.162325 0.405812 0.233233 0.235235 0.093093 0.438438 0.212212 0.191191 0.197197 0.399399 0.181363 0.185371 0.321643 0.311623 0.205411 0.100200 0.265531 0.428858 0.219659 0.297894 0.366098 0.116349 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0413.1 MOTIF MA0094.1 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 4 nsites= 88 E= 0 0.034091 0.000000 0.000000 0.965909 0.818182 0.045455 0.034091 0.102273 0.897727 0.011364 0.068182 0.022727 0.011364 0.056818 0.045455 0.886364 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0094.1 MOTIF MA0094.2 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 20 E= 0 0.150000 0.250000 0.150000 0.450000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.000000 0.150000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.300000 0.700000 0.700000 0.000000 0.300000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0094.2