MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1193.1 At2g38090 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 64 E= 0 0.468750 0.203125 0.171875 0.156250 0.593750 0.156250 0.125000 0.125000 0.437500 0.156250 0.187500 0.218750 0.500000 0.015625 0.328125 0.156250 0.375000 0.031250 0.281250 0.312500 0.531250 0.015625 0.000000 0.453125 0.265625 0.140625 0.203125 0.390625 0.406250 0.109375 0.000000 0.484375 0.312500 0.000000 0.656250 0.031250 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.015625 0.984375 0.968750 0.015625 0.015625 0.000000 0.984375 0.000000 0.000000 0.015625 0.187500 0.046875 0.625000 0.140625 0.281250 0.156250 0.375000 0.187500 0.656250 0.062500 0.046875 0.234375 0.109375 0.046875 0.109375 0.734375 0.406250 0.140625 0.375000 0.078125 0.468750 0.093750 0.281250 0.156250 0.328125 0.000000 0.375000 0.296875 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1193.1 MOTIF MA1285.1 At2g45680 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 395 E= 0 0.194937 0.486076 0.151899 0.167089 0.215190 0.518987 0.144304 0.121519 0.493671 0.200000 0.129114 0.177215 0.164557 0.225316 0.124051 0.486076 0.126582 0.139241 0.197468 0.536709 0.260759 0.146835 0.106329 0.486076 0.164557 0.232911 0.382278 0.220253 0.232911 0.430380 0.075949 0.260759 0.225316 0.420253 0.086076 0.268354 0.116456 0.032911 0.840506 0.010127 0.002532 0.048101 0.002532 0.946835 0.040506 0.000000 0.959494 0.000000 0.002532 0.000000 0.997468 0.000000 0.060759 0.000000 0.936709 0.002532 0.134177 0.245570 0.058228 0.562025 0.000000 0.982278 0.000000 0.017722 0.005063 0.994937 0.000000 0.000000 0.002532 0.939241 0.002532 0.055696 0.901266 0.002532 0.096203 0.000000 0.005063 0.875949 0.027848 0.091139 0.263291 0.450633 0.091139 0.194937 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1285.1 MOTIF MA1182.1 At3g09600 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 593 E= 0 0.826307 0.013491 0.064081 0.096121 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.994941 0.000000 0.000000 0.005059 0.000000 0.003373 0.000000 0.996627 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.084317 0.003373 0.000000 0.912310 0.193929 0.074199 0.059022 0.672850 0.222597 0.187184 0.155143 0.435076 0.281619 0.123103 0.224283 0.370995 0.244519 0.161889 0.207420 0.386172 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1182.1 MOTIF MA1188.1 At3g11280 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 582 E= 0 0.620275 0.079038 0.103093 0.197595 0.446735 0.027491 0.048110 0.477663 0.049828 0.560137 0.058419 0.331615 0.201031 0.618557 0.109966 0.070447 0.000000 0.029210 0.000000 0.970790 0.006873 0.159794 0.000000 0.833333 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.005155 0.010309 0.984536 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.206186 0.247423 0.037801 0.508591 0.209622 0.108247 0.089347 0.592784 0.324742 0.335052 0.087629 0.252577 0.498282 0.025773 0.048110 0.427835 0.192440 0.266323 0.051546 0.489691 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1188.1 MOTIF MA1196.1 At5g05790 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 587 E= 0 0.543441 0.134583 0.100511 0.221465 0.502555 0.003407 0.056218 0.437819 0.027257 0.579216 0.068143 0.325383 0.236797 0.592845 0.114140 0.056218 0.000000 0.037479 0.000000 0.962521 0.011925 0.190801 0.025554 0.771721 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.226576 0.279387 0.025554 0.468484 0.202726 0.119250 0.097104 0.580920 0.223169 0.340716 0.197615 0.238501 0.597956 0.000000 0.044293 0.357751 0.156729 0.202726 0.063032 0.577513 0.255537 0.436116 0.069847 0.238501 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1196.1 MOTIF MA1399.1 At5g08520 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 598 E= 0 0.324415 0.115385 0.277592 0.282609 0.488294 0.038462 0.120401 0.352843 0.414716 0.028428 0.025084 0.531773 0.349498 0.070234 0.301003 0.279264 0.369565 0.098662 0.050167 0.481605 0.329431 0.003344 0.628763 0.038462 0.000000 0.000000 0.996656 0.003344 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.986622 0.000000 0.013378 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.008361 0.088629 0.827759 0.075251 0.341137 0.066890 0.521739 0.070234 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1399.1 MOTIF MA1192.1 At5g58900 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 580 E= 0 0.424138 0.046552 0.043103 0.486207 0.322414 0.112069 0.244828 0.320690 0.375862 0.081034 0.098276 0.444828 0.394828 0.012069 0.539655 0.053448 0.000000 0.000000 0.991379 0.008621 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.998276 0.000000 0.000000 0.001724 0.996552 0.000000 0.001724 0.001724 0.043103 0.091379 0.763793 0.101724 0.389655 0.062069 0.446552 0.101724 0.268966 0.106897 0.070690 0.553448 0.263793 0.094828 0.112069 0.529310 0.400000 0.091379 0.186207 0.322414 0.324138 0.108621 0.225862 0.341379 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1192.1 MOTIF MA0604.1 Atf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.462000 0.086000 0.387000 0.065000 0.024000 0.016000 0.000000 0.960000 0.000000 0.022000 0.803000 0.175000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.007000 0.000000 0.993000 0.000000 0.090000 0.198000 0.000000 0.712000 0.599401 0.137862 0.162837 0.099900 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0604.1 MOTIF PB0004.1 Atf1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.380000 0.140000 0.240000 0.240000 0.138614 0.415842 0.198020 0.247525 0.160000 0.100000 0.410000 0.330000 0.470000 0.100000 0.390000 0.040000 0.009901 0.029703 0.009901 0.950495 0.010101 0.010101 0.868687 0.111111 0.969697 0.000000 0.010101 0.020202 0.000000 0.959596 0.000000 0.040404 0.040404 0.000000 0.959596 0.000000 0.020202 0.010101 0.000000 0.969697 0.111111 0.868687 0.010101 0.010101 0.950495 0.009901 0.029703 0.009901 0.050000 0.360000 0.140000 0.450000 0.230000 0.450000 0.140000 0.180000 0.262626 0.101010 0.494949 0.141414 0.350000 0.180000 0.240000 0.230000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0004.1 MOTIF PB0108.1 Atf1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.210000 0.420000 0.180000 0.320000 0.110000 0.290000 0.280000 0.650000 0.110000 0.200000 0.040000 0.040000 0.050000 0.050000 0.860000 0.080000 0.050000 0.810000 0.060000 0.821782 0.039604 0.069307 0.069307 0.040000 0.860000 0.050000 0.050000 0.160000 0.030000 0.780000 0.030000 0.565657 0.232323 0.080808 0.121212 0.400000 0.020000 0.350000 0.230000 0.020000 0.260000 0.210000 0.510000 0.690000 0.070000 0.100000 0.140000 0.455446 0.108911 0.178218 0.257426 0.260000 0.300000 0.200000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0108.1