MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PH0173.1 Uncx letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0 0.303030 0.313131 0.272727 0.111111 0.350000 0.210000 0.230000 0.210000 0.230000 0.170000 0.130000 0.470000 0.480000 0.160000 0.200000 0.160000 0.630000 0.170000 0.110000 0.090000 0.010000 0.150000 0.010000 0.830000 0.010000 0.060000 0.000000 0.930000 0.980000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.980000 0.930000 0.000000 0.060000 0.010000 0.830000 0.010000 0.150000 0.010000 0.150000 0.360000 0.220000 0.270000 0.180000 0.180000 0.470000 0.170000 0.168317 0.366337 0.306931 0.158416 0.128713 0.148515 0.554455 0.168317 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0173.1 MOTIF MA0722.1 VAX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 6156 E= 0 0.072612 0.450780 0.073912 0.402697 0.096614 0.141577 0.014371 0.747439 0.795066 0.130619 0.028606 0.045709 0.940555 0.027395 0.008236 0.023814 0.050778 0.014703 0.036416 0.898102 0.063239 0.039960 0.242873 0.653928 0.742999 0.012306 0.188402 0.056294 0.185954 0.363723 0.177579 0.272745 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0722.1 MOTIF MA0723.1 VAX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 16603 E= 0 0.055472 0.470758 0.083358 0.390411 0.075196 0.150552 0.011786 0.762466 0.791771 0.154012 0.022927 0.031290 0.964580 0.014371 0.006342 0.014708 0.036928 0.010322 0.036158 0.916592 0.060140 0.044264 0.254417 0.641179 0.758220 0.009493 0.202482 0.029805 0.189620 0.395048 0.200671 0.214660 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0723.1 MOTIF MA0693.2 VDR letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.222000 0.280000 0.043000 0.455000 0.356000 0.045000 0.567000 0.032000 0.555556 0.024024 0.386386 0.034034 0.024000 0.025000 0.919000 0.032000 0.017000 0.023000 0.070000 0.890000 0.060939 0.030969 0.081918 0.826174 0.055000 0.743000 0.028000 0.174000 0.886000 0.019000 0.076000 0.019000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0693.2 MOTIF MA0724.1 VENTX letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 23923 E= 0 0.724993 0.041090 0.080843 0.153074 0.271400 0.379106 0.188737 0.160757 0.019755 0.840908 0.000000 0.139337 0.258121 0.187092 0.534057 0.020729 0.988554 0.008388 0.000000 0.003058 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.328884 0.026326 0.563167 0.081624 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0724.1 MOTIF MA1578.1 VEZF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0 0.071142 0.791583 0.137275 0.000000 0.001002 0.998998 0.000000 0.000000 0.004004 0.995996 0.000000 0.000000 0.002002 0.997998 0.000000 0.000000 0.006006 0.989990 0.000000 0.004004 0.010020 0.978958 0.003006 0.008016 0.406814 0.357715 0.110220 0.125251 0.044088 0.551102 0.070140 0.334669 0.240240 0.171171 0.211211 0.377377 0.334002 0.173521 0.152457 0.340020 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1578.1 MOTIF MA0725.1 VSX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 14889 E= 0 0.050776 0.567735 0.037679 0.343811 0.096070 0.163832 0.029930 0.710167 0.886769 0.040902 0.036132 0.036197 0.970260 0.011009 0.012296 0.006434 0.012245 0.014168 0.007333 0.966254 0.055381 0.046932 0.060685 0.837003 0.722030 0.027451 0.177528 0.072990 0.193501 0.261956 0.269545 0.274998 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0725.1 MOTIF MA0726.1 VSX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 14681 E= 0 0.029085 0.650773 0.030311 0.289830 0.060077 0.151583 0.020192 0.768148 0.923617 0.026553 0.022942 0.026888 0.978044 0.008782 0.008712 0.004462 0.008307 0.013094 0.006477 0.972122 0.040520 0.036701 0.028934 0.893844 0.800383 0.018605 0.122240 0.058772 0.209356 0.234847 0.310522 0.245275 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0726.1 MOTIF PH0174.1 Vax1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.500000 0.240000 0.180000 0.080000 0.191919 0.343434 0.333333 0.131313 0.220000 0.130000 0.530000 0.120000 0.160000 0.150000 0.150000 0.540000 0.010000 0.120000 0.000000 0.870000 0.890000 0.100000 0.000000 0.010000 0.969697 0.010101 0.000000 0.020202 0.020202 0.000000 0.010101 0.969697 0.010000 0.000000 0.100000 0.890000 0.870000 0.000000 0.120000 0.010000 0.350000 0.250000 0.340000 0.060000 0.120000 0.530000 0.130000 0.220000 0.190000 0.370000 0.090000 0.350000 0.227723 0.396040 0.118812 0.257426 0.643564 0.079208 0.128713 0.148515 0.200000 0.100000 0.510000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0174.1 MOTIF PH0175.1 Vax2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 101 E= 0 0.158416 0.237624 0.306931 0.297030 0.320000 0.160000 0.190000 0.330000 0.260000 0.260000 0.270000 0.210000 0.171717 0.434343 0.212121 0.181818 0.530000 0.130000 0.260000 0.080000 0.060606 0.565657 0.121212 0.252525 0.010000 0.110000 0.000000 0.880000 0.888889 0.111111 0.000000 0.000000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.020000 0.980000 0.939394 0.000000 0.030303 0.030303 0.500000 0.190000 0.250000 0.060000 0.080000 0.230000 0.410000 0.280000 0.343434 0.212121 0.313131 0.131313 0.168317 0.574257 0.168317 0.089109 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0175.1