MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0693.1 Vdr letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 31267 E= 0 0.182685 0.047046 0.764736 0.005533 0.621105 0.000331 0.378534 0.000030 0.000282 0.000176 0.999153 0.000388 0.000150 0.000389 0.115783 0.883678 0.008410 0.014332 0.028947 0.948312 0.000897 0.979369 0.001293 0.018441 0.899443 0.003277 0.091986 0.005294 0.108200 0.260626 0.048650 0.582524 0.171072 0.360522 0.074511 0.393895 0.187325 0.069370 0.728580 0.014725 0.621060 0.000420 0.378429 0.000090 0.000211 0.000070 0.999542 0.000176 0.000063 0.000221 0.079208 0.920508 0.008522 0.012670 0.040214 0.938594 0.000147 0.963162 0.001536 0.035155 0.897135 0.003258 0.096065 0.003543 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0693.1 MOTIF MA0181.1 Vsx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 22 E= 0 0.045455 0.363636 0.045455 0.545455 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.090909 0.000000 0.136364 0.772727 0.681818 0.000000 0.272727 0.045455 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0181.1 MOTIF PH0176.1 Vsx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.227723 0.524752 0.108911 0.138614 0.151515 0.333333 0.383838 0.131313 0.500000 0.230000 0.090000 0.180000 0.370000 0.060000 0.490000 0.080000 0.060606 0.292929 0.010101 0.636364 0.009901 0.099010 0.000000 0.891089 0.989899 0.010101 0.000000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.000000 0.010101 0.989899 0.891089 0.000000 0.099010 0.009901 0.636364 0.010101 0.292929 0.060606 0.140000 0.280000 0.120000 0.460000 0.326733 0.188119 0.257426 0.227723 0.554455 0.237624 0.138614 0.069307 0.237624 0.227723 0.178218 0.356436 0.150000 0.190000 0.170000 0.490000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0176.1 MOTIF MA0180.1 Vsx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 13 E= 0 0.076923 0.076923 0.384615 0.461538 0.153846 0.153846 0.000000 0.692308 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.769231 0.000000 0.230769 0.000000 0.076923 0.153846 0.769231 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0180.1 MOTIF PF0152.1 WCAANNNYCAG letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 900 E= 0 0.723333 0.000000 0.000000 0.276667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.346667 0.310000 0.174444 0.168889 0.158889 0.108889 0.198889 0.533333 0.098889 0.615556 0.116667 0.168889 0.000000 0.767778 0.000000 0.232222 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0152.1 MOTIF PF0059.1 WCTCNATGGY letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 328 E= 0 0.128049 0.000000 0.000000 0.871951 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.012195 0.390244 0.103659 0.493902 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.378049 0.000000 0.621951 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0059.1 MOTIF PF0079.1 WGGAATGY letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1148 E= 0 0.580139 0.000000 0.000000 0.419861 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.425958 0.000000 0.574042 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0079.1 MOTIF PF0155.1 WGTTNNNNNAAA letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1580 E= 0 0.533544 0.000000 0.000000 0.466456 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.167722 0.179114 0.227215 0.425949 0.267722 0.233544 0.228481 0.270253 0.259494 0.234810 0.160759 0.344937 0.309494 0.119620 0.291139 0.279747 0.293038 0.211392 0.256962 0.238608 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0155.1 MOTIF MA1306.1 WRKY11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 597 E= 0 0.380235 0.112228 0.289782 0.217755 0.249581 0.182580 0.298157 0.269682 0.179229 0.599665 0.140704 0.080402 0.018425 0.000000 0.857621 0.123953 0.000000 0.001675 0.000000 0.998325 0.001675 0.000000 0.000000 0.998325 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.996650 0.000000 0.003350 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.026801 0.078727 0.000000 0.894472 0.098827 0.033501 0.013400 0.854271 0.093802 0.070352 0.061977 0.773869 0.170854 0.117253 0.155779 0.556114 0.241206 0.142379 0.232831 0.383585 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1306.1 MOTIF MA1075.1 WRKY12 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.171828 0.706294 0.075924 0.045954 0.070000 0.033000 0.819000 0.078000 0.020000 0.062000 0.005000 0.913000 0.010000 0.015000 0.029000 0.946000 0.007992 0.005994 0.953047 0.032967 0.970030 0.005994 0.009990 0.013986 0.029029 0.949950 0.005005 0.016016 0.025025 0.722723 0.101101 0.151151 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1075.1