MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0205.1 Zic1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.160000 0.410000 0.170000 0.260000 0.257426 0.356436 0.148515 0.237624 0.370000 0.030000 0.280000 0.320000 0.090000 0.880000 0.020000 0.010000 0.420000 0.170000 0.250000 0.160000 0.000000 0.980000 0.000000 0.020000 0.910000 0.020000 0.010000 0.060000 0.039604 0.009901 0.940594 0.009901 0.000000 0.841584 0.009901 0.148515 0.808081 0.000000 0.151515 0.040404 0.019802 0.019802 0.673267 0.287129 0.000000 0.010000 0.940000 0.050000 0.430000 0.270000 0.140000 0.160000 0.270000 0.240000 0.370000 0.120000 0.400000 0.100000 0.210000 0.290000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0205.1 MOTIF MA1629.1 Zic2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 11919 E= 0 0.263864 0.294236 0.231647 0.210253 0.205554 0.147244 0.320581 0.326621 0.097408 0.833375 0.049081 0.020136 0.577901 0.148083 0.069553 0.204463 0.011326 0.962832 0.015773 0.010068 0.929105 0.032805 0.015605 0.022485 0.011746 0.019129 0.963504 0.005621 0.006712 0.945717 0.022569 0.025002 0.891434 0.009900 0.061666 0.037000 0.016109 0.011159 0.938334 0.034399 0.008054 0.017116 0.961910 0.012921 0.256733 0.123836 0.412031 0.207400 0.305227 0.139357 0.417736 0.137679 0.195738 0.181894 0.445843 0.176525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1629.1 MOTIF PB0102.1 Zic2_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.170000 0.300000 0.280000 0.250000 0.272727 0.494949 0.090909 0.141414 0.140000 0.720000 0.030000 0.110000 0.120000 0.770000 0.050000 0.060000 0.100000 0.840000 0.030000 0.030000 0.060000 0.810000 0.070000 0.060000 0.059406 0.762376 0.158416 0.019802 0.070000 0.110000 0.630000 0.190000 0.060000 0.070000 0.810000 0.060000 0.030000 0.030000 0.840000 0.100000 0.060000 0.050000 0.770000 0.120000 0.110000 0.030000 0.720000 0.140000 0.120000 0.070000 0.610000 0.200000 0.069307 0.217822 0.554455 0.158416 0.178218 0.198020 0.207921 0.415842 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0102.1 MOTIF PB0206.1 Zic2_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.200000 0.340000 0.180000 0.280000 0.240000 0.350000 0.170000 0.240000 0.350000 0.030000 0.310000 0.310000 0.100000 0.870000 0.020000 0.010000 0.310000 0.260000 0.280000 0.150000 0.000000 0.979798 0.000000 0.020202 0.891089 0.029703 0.019802 0.059406 0.049505 0.009901 0.930693 0.009901 0.000000 0.860000 0.010000 0.130000 0.770000 0.000000 0.190000 0.040000 0.010000 0.020000 0.590000 0.380000 0.000000 0.010000 0.960000 0.030000 0.370000 0.230000 0.200000 0.200000 0.270000 0.190000 0.430000 0.110000 0.444444 0.101010 0.212121 0.242424 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0206.1 MOTIF PB0103.1 Zic3_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 99 E= 0 0.131313 0.373737 0.252525 0.242424 0.310000 0.450000 0.090000 0.150000 0.130000 0.720000 0.030000 0.120000 0.130000 0.750000 0.050000 0.070000 0.118812 0.801980 0.039604 0.039604 0.049505 0.811881 0.079208 0.059406 0.050000 0.790000 0.140000 0.020000 0.059406 0.089109 0.663366 0.188119 0.059406 0.079208 0.811881 0.049505 0.039604 0.039604 0.801980 0.118812 0.070000 0.050000 0.750000 0.130000 0.120000 0.030000 0.720000 0.130000 0.100000 0.070000 0.640000 0.190000 0.070000 0.200000 0.580000 0.150000 0.148515 0.237624 0.227723 0.386139 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0103.1 MOTIF PB0207.1 Zic3_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.230000 0.220000 0.280000 0.270000 0.330000 0.180000 0.210000 0.280000 0.306931 0.019802 0.386139 0.287129 0.100000 0.870000 0.020000 0.010000 0.540000 0.090000 0.240000 0.130000 0.000000 0.979798 0.000000 0.020202 0.900000 0.020000 0.020000 0.060000 0.039604 0.009901 0.940594 0.009901 0.000000 0.830000 0.010000 0.160000 0.727273 0.000000 0.222222 0.050505 0.010101 0.020202 0.565657 0.404040 0.000000 0.010101 0.949495 0.040404 0.480000 0.270000 0.110000 0.140000 0.227723 0.297030 0.257426 0.217822 0.366337 0.188119 0.198020 0.247525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0207.1 MOTIF MA1630.1 Znf281 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 6568 E= 0 0.182247 0.133678 0.538825 0.145250 0.151644 0.163825 0.571102 0.113429 0.001218 0.035475 0.004415 0.958892 0.002893 0.013398 0.981882 0.001827 0.003806 0.024817 0.967722 0.003654 0.005481 0.019945 0.971072 0.003502 0.003350 0.017509 0.974726 0.004415 0.002741 0.006242 0.983100 0.007917 0.990256 0.006851 0.001218 0.001675 0.111906 0.063642 0.656516 0.167935 0.056943 0.054202 0.840895 0.047960 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1630.1 MOTIF MA0116.1 Znf423 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 33 E= 0 0.212121 0.121212 0.666667 0.000000 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.000000 0.515152 0.484848 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.030303 0.515152 0.000000 0.454545 0.727273 0.000000 0.000000 0.272727 0.393939 0.000000 0.484848 0.121212 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.515152 0.484848 0.000000 0.000000 0.484848 0.515152 0.000000 0.242424 0.484848 0.272727 0.333333 0.666667 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0116.1 MOTIF UN0269.1 Znf431 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 515 E= 0 0.069903 0.396117 0.236893 0.297087 0.172816 0.299029 0.302913 0.225243 0.370874 0.174757 0.359223 0.095146 0.168932 0.122330 0.048544 0.660194 0.083495 0.258252 0.477670 0.180583 0.007767 0.949515 0.000000 0.042718 0.023301 0.963107 0.009709 0.003883 0.000000 0.019417 0.001942 0.978641 0.042718 0.009709 0.945631 0.001942 0.003883 0.003883 0.038835 0.953398 0.000000 0.984466 0.009709 0.005825 0.025243 0.011650 0.000000 0.963107 0.001942 0.001942 0.009709 0.986408 0.953398 0.003883 0.034951 0.007767 0.015534 0.000000 0.982524 0.001942 0.009709 0.003883 0.982524 0.003883 0.087379 0.089320 0.027184 0.796117 0.069903 0.277670 0.019417 0.633010 0.147573 0.060194 0.640777 0.151456 0.147573 0.120388 0.592233 0.139806 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0269.1 MOTIF PB0104.1 Zscan4_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.200000 0.160000 0.310000 0.330000 0.356436 0.267327 0.148515 0.227723 0.250000 0.300000 0.240000 0.210000 0.490000 0.120000 0.210000 0.180000 0.120000 0.050000 0.060000 0.770000 0.020000 0.010000 0.970000 0.000000 0.009901 0.029703 0.009901 0.950495 0.030000 0.000000 0.970000 0.000000 0.000000 0.970000 0.000000 0.030000 0.950495 0.009901 0.029703 0.009901 0.000000 0.970000 0.010000 0.020000 0.770000 0.060000 0.050000 0.120000 0.040404 0.383838 0.040404 0.535354 0.750000 0.050000 0.040000 0.160000 0.360000 0.230000 0.090000 0.320000 0.440000 0.110000 0.220000 0.230000 0.300000 0.290000 0.200000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0104.1