MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PB0208.1 Zscan4_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.390000 0.110000 0.220000 0.270000 0.330000 0.360000 0.040000 0.444444 0.232323 0.020202 0.303030 0.410000 0.140000 0.390000 0.060000 0.040000 0.010000 0.940000 0.010000 0.070000 0.910000 0.020000 0.000000 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.040000 0.940000 0.010000 0.010000 0.960396 0.009901 0.019802 0.009901 0.070000 0.640000 0.040000 0.250000 0.800000 0.070000 0.010000 0.120000 0.770000 0.120000 0.020000 0.090000 0.320000 0.240000 0.210000 0.230000 0.370000 0.190000 0.130000 0.310000 0.297030 0.247525 0.099010 0.356436 0.330000 0.240000 0.250000 0.180000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0208.1 MOTIF MA0206.1 abd-A letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 18 E= 0 0.055556 0.166667 0.000000 0.777778 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.111111 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.000000 0.333333 0.666667 0.833333 0.055556 0.111111 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0206.1 MOTIF MA0123.1 abi4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 49 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.244898 0.000000 0.755102 0.000000 0.000000 0.408163 0.591837 0.000000 0.000000 0.469388 0.020408 0.510204 0.020408 0.061224 0.918367 0.000000 0.000000 0.918367 0.081633 0.000000 0.102041 0.571429 0.122449 0.204082 0.061224 0.510204 0.224490 0.204082 0.061224 0.632653 0.102041 0.204082 0.081633 0.530612 0.142857 0.244898 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0123.1 MOTIF MA0207.1 achi letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 23 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.956522 0.000000 0.043478 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.176471 0.000000 0.705882 0.117647 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0207.1 MOTIF UN0083.1 ada-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 997 E= 0 0.304915 0.231695 0.231695 0.231695 0.340340 0.274274 0.110110 0.275275 0.059118 0.583166 0.224449 0.133267 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.072072 0.927928 0.000000 0.090180 0.018036 0.272545 0.619238 0.139279 0.582164 0.139279 0.139279 0.351351 0.190190 0.268268 0.190190 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0083.1 MOTIF UN0084.1 ada-3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 997 E= 0 0.562688 0.157472 0.157472 0.122367 0.154309 0.679359 0.071142 0.095190 0.040080 0.020040 0.357715 0.582164 0.000000 0.953954 0.046046 0.000000 0.000000 0.045090 0.954910 0.000000 0.000000 0.990991 0.009009 0.000000 0.000000 0.018036 0.972946 0.009018 0.691383 0.154309 0.083166 0.071142 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0084.1 MOTIF MA0208.1 al letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.150000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0208.1 MOTIF MA0209.1 ap letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 19 E= 0 0.105263 0.526316 0.000000 0.368421 0.052632 0.000000 0.000000 0.947368 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.315789 0.684211 0.842105 0.000000 0.157895 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0209.1 MOTIF MA0210.1 ara letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 34 E= 0 0.411765 0.000000 0.147059 0.441176 0.676471 0.000000 0.000000 0.323529 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0210.1 MOTIF SA0001.1 at_AC_acceptor letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 70794 E= 0 0.149179 0.267763 0.138105 0.444953 0.136876 0.267071 0.134927 0.461127 0.126819 0.277057 0.128203 0.467921 0.115306 0.274698 0.122680 0.487315 0.105517 0.271859 0.117171 0.505452 0.095149 0.272636 0.105291 0.526923 0.087832 0.256208 0.102791 0.553168 0.088722 0.275730 0.108328 0.527220 0.101548 0.288683 0.113894 0.495875 0.110758 0.318516 0.104260 0.466466 0.116846 0.328940 0.091095 0.463118 0.087931 0.336399 0.064271 0.511399 0.091293 0.288767 0.063056 0.556883 0.240783 0.268737 0.200342 0.290138 0.059821 0.632864 0.002034 0.305280 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.260785 0.141580 0.484490 0.113145 0.246334 0.188406 0.191598 0.373662 0.266110 0.229356 0.230994 0.273540 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/SA0001.1