MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF PL0003.1 hlh-2::cnd-1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0
 0.336735  0.326531  0.122449  0.214286
 0.163265  0.265306  0.387755  0.183673
 0.234694  0.122449  0.346939  0.295918
 0.673469  0.183673  0.071429  0.071429
 0.734694  0.183673  0.051020  0.030612
 0.061224  0.887755  0.020408  0.030612
 0.959184  0.010204  0.010204  0.020408
 0.010204  0.030612  0.612245  0.346939
 0.195876  0.773196  0.020619  0.010309
 0.040816  0.000000  0.010204  0.948980
 0.030612  0.010204  0.918367  0.040816
 0.020202  0.090909  0.111111  0.777778
 0.071429  0.500000  0.183673  0.244898
 0.224490  0.295918  0.112245  0.367347
 0.363636  0.212121  0.181818  0.242424
 0.408163  0.163265  0.193878  0.234694
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0003.1

MOTIF PL0017.1 hlh-2::hlh-10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 99 E= 0
 0.212121  0.323232  0.232323  0.232323
 0.247423  0.309278  0.164948  0.278351
 0.204082  0.153061  0.397959  0.244898
 0.163265  0.244898  0.306122  0.285714
 0.755102  0.132653  0.091837  0.020408
 0.826531  0.081633  0.091837  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.010101  0.151515  0.838384  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.010101  0.232323  0.383838  0.373737
 0.112245  0.193878  0.244898  0.448980
 0.214286  0.357143  0.255102  0.173469
 0.163265  0.244898  0.295918  0.295918
 0.336735  0.183673  0.285714  0.193878
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0017.1

MOTIF PL0015.1 hlh-2::hlh-14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0
 0.234694  0.255102  0.244898  0.265306
 0.204082  0.193878  0.255102  0.346939
 0.571429  0.112245  0.173469  0.142857
 0.636364  0.151515  0.191919  0.020202
 0.010309  0.989691  0.000000  0.000000
 0.989796  0.000000  0.000000  0.010204
 0.000000  0.418367  0.326531  0.255102
 0.020408  0.969388  0.010204  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.989796  0.010204
 0.000000  0.142857  0.081633  0.775510
 0.020408  0.734694  0.020408  0.224490
 0.346939  0.275510  0.275510  0.102041
 0.346939  0.255102  0.214286  0.183673
 0.285714  0.153061  0.275510  0.285714
 0.494949  0.161616  0.131313  0.212121
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0015.1

MOTIF PL0013.1 hlh-2::hlh-15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0
 0.326531  0.153061  0.357143  0.163265
 0.255102  0.224490  0.336735  0.183673
 0.469388  0.408163  0.061224  0.061224
 0.214286  0.387755  0.346939  0.051020
 0.010309  0.979381  0.000000  0.010309
 0.959184  0.000000  0.000000  0.040816
 0.000000  0.387755  0.551020  0.061224
 0.051546  0.804124  0.134021  0.010309
 0.010101  0.010101  0.010101  0.969697
 0.000000  0.010204  0.969388  0.020408
 0.051020  0.265306  0.428571  0.255102
 0.091837  0.030612  0.724490  0.153061
 0.132653  0.408163  0.244898  0.214286
 0.163265  0.561224  0.122449  0.153061
 0.298969  0.515464  0.123711  0.061856
 0.071429  0.122449  0.193878  0.612245
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0013.1

MOTIF PL0010.1 hlh-2::hlh-19
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 97 E= 0
 0.216495  0.123711  0.319588  0.340206
 0.237113  0.237113  0.247423  0.278351
 0.175258  0.103093  0.237113  0.484536
 0.540816  0.122449  0.255102  0.081633
 0.565657  0.323232  0.080808  0.030303
 0.030612  0.948980  0.010204  0.010204
 0.959184  0.010204  0.020408  0.010204
 0.010204  0.091837  0.642857  0.255102
 0.103093  0.525773  0.371134  0.000000
 0.030928  0.020619  0.000000  0.948454
 0.020202  0.010101  0.929293  0.040404
 0.020408  0.061224  0.336735  0.581633
 0.080808  0.383838  0.141414  0.393939
 0.408163  0.397959  0.071429  0.122449
 0.255102  0.326531  0.173469  0.244898
 0.265306  0.255102  0.234694  0.244898
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0010.1

MOTIF PL0002.1 hlh-2::hlh-3
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 98 E= 0
 0.326531  0.285714  0.234694  0.153061
 0.326531  0.132653  0.367347  0.173469
 0.173469  0.183673  0.244898  0.397959
 0.500000  0.061224  0.295918  0.142857
 0.453608  0.422680  0.123711  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.857143  0.020408  0.122449
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.857143  0.030612  0.112245
 0.051546  0.247423  0.072165  0.628866
 0.357143  0.224490  0.193878  0.224490
 0.428571  0.214286  0.214286  0.142857
 0.216495  0.257732  0.123711  0.402062
 0.224490  0.336735  0.142857  0.295918
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0002.1

MOTIF PL0011.1 hlh-2::hlh-4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 98 E= 0
 0.448980  0.234694  0.183673  0.132653
 0.540816  0.081633  0.265306  0.112245
 0.285714  0.091837  0.071429  0.551020
 0.546392  0.000000  0.010309  0.443299
 0.226804  0.298969  0.185567  0.288660
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.929293  0.050505  0.020202
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.704082  0.040816  0.255102
 0.081633  0.173469  0.061224  0.683673
 0.252525  0.282828  0.191919  0.272727
 0.367347  0.183673  0.234694  0.214286
 0.244898  0.234694  0.183673  0.336735
 0.163265  0.306122  0.214286  0.316327
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0011.1

MOTIF PL0012.1 hlh-2::hlh-8
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 98 E= 0
 0.336735  0.214286  0.224490  0.224490
 0.142857  0.306122  0.224490  0.326531
 0.402062  0.288660  0.175258  0.134021
 0.642857  0.163265  0.112245  0.081633
 0.785714  0.163265  0.040816  0.010204
 0.020408  0.969388  0.000000  0.010204
 0.969697  0.010101  0.010101  0.010101
 0.000000  0.061224  0.051020  0.887755
 0.357143  0.581633  0.061224  0.000000
 0.010309  0.010309  0.000000  0.979381
 0.000000  0.010204  0.969388  0.020408
 0.010204  0.020408  0.785714  0.183673
 0.132653  0.214286  0.081633  0.571429
 0.285714  0.193878  0.234694  0.285714
 0.142857  0.183673  0.255102  0.418367
 0.285714  0.397959  0.132653  0.183673
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0012.1

MOTIF PL0006.1 hlh-2::lin-32
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0
 0.282828  0.282828  0.171717  0.262626
 0.397959  0.295918  0.183673  0.122449
 0.247423  0.154639  0.360825  0.237113
 0.474747  0.232323  0.222222  0.070707
 0.653061  0.285714  0.061224  0.000000
 0.010101  0.989899  0.000000  0.000000
 0.989796  0.000000  0.010204  0.000000
 0.000000  0.163265  0.642857  0.193878
 0.193878  0.642857  0.163265  0.000000
 0.000000  0.010204  0.000000  0.989796
 0.000000  0.000000  0.989899  0.010101
 0.000000  0.061224  0.285714  0.653061
 0.051020  0.387755  0.071429  0.489796
 0.244898  0.357143  0.173469  0.224490
 0.224490  0.244898  0.153061  0.377551
 0.216495  0.340206  0.247423  0.195876
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0006.1

MOTIF PL0005.1 hlh-30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 98 E= 0
 0.387755  0.183673  0.163265  0.265306
 0.216495  0.247423  0.309278  0.226804
 0.367347  0.112245  0.204082  0.316327
 0.622449  0.040816  0.234694  0.102041
 0.051020  0.061224  0.040816  0.846939
 0.000000  0.989691  0.000000  0.010309
 0.959184  0.010204  0.010204  0.020408
 0.000000  0.867347  0.000000  0.132653
 0.132653  0.000000  0.867347  0.000000
 0.020408  0.010204  0.010204  0.959184
 0.010309  0.000000  0.989691  0.000000
 0.846939  0.040816  0.061224  0.051020
 0.000000  0.649485  0.000000  0.350515
 0.371134  0.216495  0.144330  0.268041
 0.387755  0.193878  0.183673  0.234694
 0.282828  0.101010  0.222222  0.393939
 0.212121  0.252525  0.242424  0.292929
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0005.1

