MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA1449.1 hlh-30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1762 E= 0
 0.291146  0.210556  0.229285  0.269012
 0.394438  0.089671  0.376844  0.139047
 0.070942  0.102724  0.059024  0.767310
 0.003405  0.986947  0.006243  0.003405
 0.946084  0.009081  0.006810  0.038025
 0.007946  0.886493  0.017594  0.087968
 0.087968  0.017594  0.886493  0.007946
 0.038025  0.006810  0.009081  0.946084
 0.003405  0.006243  0.986947  0.003405
 0.767310  0.059024  0.102724  0.070942
 0.139047  0.376844  0.089671  0.394438
 0.269012  0.229285  0.210556  0.291146
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1449.1

MOTIF MA0227.1 hth
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 17 E= 0
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.823529  0.000000  0.176471  0.000000
 0.000000  0.000000  0.666667  0.333333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0227.1

MOTIF MA0120.1 id1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 24 E= 0
 0.041667  0.041667  0.083333  0.833333
 0.125000  0.125000  0.166667  0.583333
 0.041667  0.083333  0.375000  0.500000
 0.000000  0.375000  0.125000  0.500000
 0.000000  0.541667  0.166667  0.291667
 0.083333  0.458333  0.166667  0.291667
 0.125000  0.333333  0.083333  0.458333
 0.041667  0.041667  0.041667  0.875000
 0.333333  0.208333  0.041667  0.416667
 0.000000  0.250000  0.291667  0.458333
 0.000000  0.708333  0.000000  0.291667
 0.083333  0.000000  0.750000  0.166667
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0120.1

MOTIF MA0228.1 ind
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0
 0.000000  0.571429  0.000000  0.428571
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.047619  0.952381
 0.000000  0.000000  0.380952  0.619048
 0.904762  0.000000  0.095238  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0228.1

MOTIF MA0229.1 inv
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 16 E= 0
 0.250000  0.000000  0.187500  0.562500
 0.062500  0.562500  0.000000  0.375000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.687500  0.000000  0.312500  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0229.1

MOTIF MA0451.1 kni
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 26 E= 0
 0.730769  0.038462  0.076923  0.153846
 0.961538  0.038462  0.000000  0.000000
 0.615385  0.000000  0.000000  0.384615
 0.192308  0.346154  0.230769  0.230769
 0.000000  0.153846  0.038462  0.807692
 0.807692  0.000000  0.192308  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.653846  0.000000  0.307692  0.038462
 0.038462  0.115385  0.692308  0.153846
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.961538  0.000000  0.038462  0.000000
 0.192308  0.461538  0.269231  0.076923
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0451.1

MOTIF MA0230.1 lab
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0
 0.062500  0.187500  0.000000  0.750000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.062500  0.000000  0.000000  0.937500
 0.000000  0.000000  0.375000  0.625000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0230.1

MOTIF MA0231.1 lbe
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.045455  0.454545  0.090909  0.409091
 0.181818  0.227273  0.136364  0.454545
 0.863636  0.000000  0.136364  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0231.1

MOTIF MA0232.1 lbl
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 23 E= 0
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.217391  0.000000  0.782609
 0.043478  0.130435  0.304348  0.521739
 0.739130  0.000000  0.260870  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0232.1

MOTIF MA0923.1 lim-4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1000 E= 0
 0.274000  0.238000  0.312000  0.176000
 0.112000  0.403000  0.304000  0.181000
 0.022000  0.291000  0.006000  0.681000
 0.852000  0.117000  0.020000  0.011000
 0.979021  0.006993  0.011988  0.001998
 0.007007  0.004004  0.003003  0.985986
 0.009990  0.102897  0.048951  0.838162
 0.939000  0.010000  0.013000  0.038000
 0.514000  0.052000  0.331000  0.103000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0923.1

