MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0235.1 onecut letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 15 E= 0 0.066667 0.133333 0.000000 0.800000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.333333 0.000000 0.266667 0.400000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0235.1 MOTIF MA0456.1 opa letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.055556 0.833333 0.111111 0.555556 0.388889 0.055556 0.000000 0.055556 0.888889 0.000000 0.055556 0.055556 0.833333 0.055556 0.055556 0.000000 0.888889 0.055556 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.777778 0.000000 0.222222 0.222222 0.000000 0.722222 0.055556 0.000000 0.777778 0.111111 0.111111 0.166667 0.055556 0.222222 0.555556 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0456.1 MOTIF MA0236.1 otp letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.050000 0.300000 0.100000 0.550000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050000 0.200000 0.750000 0.750000 0.000000 0.150000 0.100000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0236.1 MOTIF MA0126.1 ovo letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 21 E= 0 0.476190 0.190476 0.000000 0.333333 0.047619 0.190476 0.666667 0.095238 0.190476 0.095238 0.095238 0.619048 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.238095 0.142857 0.285714 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.238095 0.190476 0.095238 0.476190 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0126.1 MOTIF MA0924.1 pal-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.091000 0.001000 0.907000 0.001000 0.000999 0.307692 0.000999 0.690310 0.921000 0.077000 0.001000 0.001000 0.997003 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.997003 0.537463 0.000999 0.000999 0.460539 0.997003 0.000999 0.000999 0.000999 0.886000 0.112000 0.001000 0.001000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0924.1 MOTIF MA0237.1 pan letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 25 E= 0 0.160000 0.400000 0.120000 0.320000 0.080000 0.120000 0.000000 0.800000 0.080000 0.000000 0.040000 0.880000 0.080000 0.000000 0.000000 0.920000 0.000000 0.080000 0.800000 0.120000 0.680000 0.000000 0.200000 0.120000 0.320000 0.000000 0.000000 0.680000 0.280000 0.440000 0.120000 0.160000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0237.1 MOTIF MA0237.2 pan letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 71 E= 0 0.000000 0.000000 0.478873 0.521127 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.281690 0.563380 0.154930 0.098592 0.605634 0.042254 0.253521 0.154930 0.140845 0.267606 0.436620 0.098592 0.563380 0.000000 0.338028 0.000000 0.422535 0.211268 0.366197 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.154930 0.845070 0.154930 0.126761 0.577465 0.140845 0.478873 0.000000 0.295775 0.225352 0.309859 0.000000 0.000000 0.690141 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0237.2 MOTIF MA0238.1 pb letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 24 E= 0 0.166667 0.375000 0.000000 0.458333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.458333 0.541667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0238.1 MOTIF MA0546.1 pha-4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1010 E= 0 0.579208 0.070297 0.000000 0.350495 0.528713 0.000000 0.466337 0.004950 0.531683 0.000000 0.078218 0.390099 0.040594 0.000000 0.959406 0.000000 0.000000 0.402970 0.000000 0.597030 0.853465 0.146535 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.616832 0.000000 0.383168 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0546.1 MOTIF MA1460.1 pho letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 6951 E= 0 0.329881 0.250036 0.183571 0.236513 0.324558 0.170047 0.294922 0.210473 0.890663 0.042728 0.038556 0.028054 0.014962 0.022155 0.017839 0.945044 0.020573 0.045749 0.906776 0.026903 0.016688 0.021580 0.937419 0.024313 0.043015 0.874694 0.039419 0.042872 0.048914 0.753273 0.132787 0.065027 0.071644 0.025752 0.862466 0.040138 0.268451 0.346137 0.177672 0.207740 0.190620 0.361243 0.215796 0.232341 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1460.1