MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0536.1 pnr
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 869 E= 0
 0.094361  0.207135  0.005754  0.692750
 0.922900  0.000000  0.000000  0.077100
 0.000000  0.036824  0.001151  0.962025
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.667434  0.000000  0.100115  0.232451
 0.141542  0.000000  0.609896  0.248562
 0.066743  0.319908  0.223245  0.390104
 0.104718  0.314154  0.126582  0.454545
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0536.1

MOTIF MA1703.1 pqm-1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2657 E= 0
 0.363944  0.183289  0.130598  0.322168
 0.570945  0.070380  0.209635  0.149040
 0.068875  0.789236  0.096349  0.045540
 0.030486  0.042153  0.001882  0.925480
 0.015055  0.004516  0.961987  0.018442
 0.974031  0.007151  0.006775  0.012044
 0.003764  0.001129  0.000753  0.994355
 0.957094  0.004893  0.006398  0.031615
 0.894618  0.013549  0.056455  0.035378
 0.164095  0.252540  0.402333  0.181031
 0.482123  0.152428  0.233722  0.131728
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1703.1

MOTIF MA0239.1 prd
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 21 E= 0
 0.476190  0.190476  0.000000  0.333333
 0.047619  0.190476  0.666667  0.095238
 0.190476  0.095238  0.095238  0.619048
 0.952381  0.000000  0.000000  0.047619
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.333333  0.238095  0.142857  0.285714
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.238095  0.190476  0.095238  0.476190
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0239.1

MOTIF PL0016.1 ref-1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 98 E= 0
 0.346939  0.132653  0.153061  0.367347
 0.265306  0.316327  0.224490  0.193878
 0.520408  0.173469  0.102041  0.204082
 0.346939  0.224490  0.153061  0.275510
 0.224490  0.030612  0.683673  0.061224
 0.224490  0.071429  0.693878  0.010204
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.979592  0.000000  0.020408  0.000000
 0.000000  0.979592  0.000000  0.020408
 0.010204  0.000000  0.989796  0.000000
 0.000000  0.020408  0.010204  0.969388
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.459184  0.091837  0.448980
 0.212121  0.474747  0.101010  0.212121
 0.306122  0.193878  0.163265  0.336735
 0.336735  0.071429  0.204082  0.387755
 0.500000  0.132653  0.142857  0.224490
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PL0016.1

MOTIF MA0240.1 repo
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 28 E= 0
 0.035714  0.142857  0.142857  0.678571
 0.035714  0.000000  0.000000  0.964286
 0.964286  0.000000  0.000000  0.035714
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.750000  0.000000  0.250000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0240.1

MOTIF MA0241.1 ro
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 23 E= 0
 0.043478  0.521739  0.130435  0.304348
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.130435  0.869565
 0.826087  0.000000  0.173913  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0241.1

MOTIF MA1431.1 rst2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0
 0.256513  0.163327  0.193387  0.386774
 0.392177  0.188566  0.204614  0.214644
 0.022044  0.938878  0.013026  0.026052
 0.007007  0.880881  0.004004  0.108108
 0.000000  0.996997  0.002002  0.001001
 0.006012  0.991984  0.000000  0.002004
 0.208417  0.040080  0.530060  0.221443
 0.056112  0.897796  0.002004  0.044088
 0.382766  0.216433  0.131263  0.269539
 0.165331  0.379760  0.141283  0.313627
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1431.1

MOTIF UN0081.1 rsv2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0
 0.222445  0.120240  0.465932  0.191383
 0.117352  0.091274  0.735206  0.056169
 0.160160  0.100100  0.258258  0.481481
 0.000000  0.002004  0.994990  0.003006
 0.003006  0.000000  0.996994  0.000000
 0.011011  0.925926  0.019019  0.044044
 0.207415  0.071142  0.644289  0.077154
 0.407816  0.198397  0.181363  0.212425
 0.287287  0.230230  0.230230  0.252252
 0.275275  0.214214  0.232232  0.278278
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0081.1

MOTIF MA0193.1 schlank
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 19 E= 0
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.473684  0.000000  0.526316
 0.894737  0.105263  0.000000  0.000000
 0.052632  0.947368  0.000000  0.000000
 0.000000  0.631579  0.000000  0.368421
 0.947368  0.000000  0.052632  0.000000
 0.631579  0.000000  0.210526  0.157895
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0193.1

MOTIF MA0243.1 sd
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 14 E= 0
 0.214286  0.000000  0.571429  0.214286
 0.571429  0.071429  0.071429  0.285714
 0.285714  0.571429  0.071429  0.071429
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.071429  0.071429  0.000000  0.857143
 0.214286  0.000000  0.071429  0.714286
 0.000000  0.571429  0.000000  0.428571
 0.214286  0.357143  0.214286  0.214286
 0.285714  0.071429  0.142857  0.500000
 0.357143  0.428571  0.214286  0.000000
 0.357143  0.071429  0.500000  0.071429
 0.285714  0.214286  0.285714  0.214286
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0243.1

