MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0533.1 su(Hw) letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 4737 E= 0 0.070931 0.239181 0.592780 0.097108 0.051298 0.868904 0.007389 0.072409 0.164239 0.633523 0.048765 0.153473 0.180494 0.312434 0.206249 0.300823 0.584125 0.123707 0.195271 0.096897 0.725776 0.043910 0.111674 0.118640 0.890226 0.019633 0.062276 0.027866 0.824150 0.004011 0.066709 0.105130 0.086553 0.049609 0.793540 0.070298 0.003589 0.093097 0.020266 0.883048 0.902681 0.004433 0.020055 0.072831 0.001478 0.002322 0.240659 0.755541 0.042010 0.001056 0.955457 0.001478 0.024488 0.969812 0.001267 0.004433 0.595525 0.086764 0.001689 0.316023 0.716065 0.062487 0.150517 0.070931 0.110407 0.512983 0.040321 0.336289 0.535149 0.074731 0.297446 0.092675 0.383154 0.271058 0.162550 0.183238 0.470973 0.094364 0.072831 0.361832 0.421364 0.080008 0.074098 0.424530 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0533.1 MOTIF UN0097.1 sub-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 998 E= 0 0.224449 0.326653 0.224449 0.224449 0.203407 0.299599 0.391784 0.105210 0.225677 0.726179 0.024072 0.024072 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.897898 0.102102 0.347695 0.117234 0.510020 0.025050 0.144144 0.144144 0.144144 0.567568 0.225225 0.324324 0.225225 0.225225 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0097.1 MOTIF MA1461.1 sv letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 998 E= 0 0.187375 0.314629 0.238477 0.259519 0.002004 0.273547 0.444890 0.279559 0.058116 0.735471 0.004008 0.202405 0.645938 0.015045 0.312939 0.026078 0.152305 0.284569 0.383768 0.179359 0.001002 0.323647 0.005010 0.670341 0.002002 0.640641 0.356356 0.001001 0.934935 0.002002 0.059059 0.004004 0.375752 0.029058 0.068136 0.527054 0.001001 0.129129 0.868869 0.001001 0.001002 0.983968 0.003006 0.012024 0.106212 0.001002 0.891784 0.001002 0.004012 0.002006 0.008024 0.985958 0.128257 0.001002 0.869739 0.001002 0.946894 0.002004 0.013026 0.038076 0.025025 0.971972 0.002002 0.001001 0.071142 0.213427 0.670341 0.045090 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1461.1 MOTIF MA0247.1 tin letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 16 E= 0 0.000000 0.562500 0.187500 0.250000 0.062500 0.000000 0.000000 0.937500 0.000000 0.687500 0.062500 0.250000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.187500 0.000000 0.812500 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0247.1 MOTIF MA0247.2 tin letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 515 E= 0 0.264078 0.104854 0.155340 0.475728 0.000000 0.365049 0.266019 0.368932 0.000000 0.099029 0.000000 0.900971 0.000000 0.825243 0.066019 0.108738 0.633010 0.000000 0.366990 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.025243 0.304854 0.584466 0.085437 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0247.2 MOTIF MA0459.1 tll letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 33 E= 0 0.606061 0.121212 0.121212 0.151515 0.878788 0.000000 0.121212 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.939394 0.030303 0.030303 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.060606 0.000000 0.939394 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.939394 0.000000 0.030303 0.030303 0.515152 0.303030 0.060606 0.121212 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0459.1 MOTIF UN0109.1 trx letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 4058 E= 0 0.442090 0.207491 0.192706 0.157713 0.202563 0.113110 0.585017 0.099310 0.663135 0.083292 0.169788 0.083785 0.005668 0.002957 0.979300 0.012075 0.972400 0.007146 0.014046 0.006407 0.002464 0.001479 0.986693 0.009364 0.971907 0.006654 0.018728 0.002711 0.008625 0.006900 0.980532 0.003943 0.067767 0.826023 0.080335 0.025875 0.213406 0.125678 0.571957 0.088960 0.363726 0.172499 0.277230 0.186545 0.222523 0.197388 0.431986 0.148103 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0109.1 MOTIF MA0460.1 ttk letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 22 E= 0 0.454545 0.363636 0.136364 0.045455 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.227273 0.000000 0.772727 0.954545 0.000000 0.000000 0.045455 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.045455 0.227273 0.136364 0.590909 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0460.1 MOTIF MA0248.1 tup letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.250000 0.125000 0.062500 0.562500 0.062500 0.000000 0.000000 0.937500 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.125000 0.875000 0.062500 0.000000 0.437500 0.500000 0.125000 0.000000 0.812500 0.062500 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0248.1 MOTIF MA0249.1 twi letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 15 E= 0 0.066667 0.266667 0.200000 0.466667 0.200000 0.466667 0.200000 0.133333 0.066667 0.200000 0.666667 0.066667 0.000000 0.933333 0.066667 0.000000 0.733333 0.200000 0.066667 0.000000 0.000000 0.266667 0.066667 0.666667 0.466667 0.066667 0.333333 0.133333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.800000 0.200000 0.066667 0.000000 0.133333 0.800000 0.066667 0.133333 0.133333 0.666667 0.133333 0.200000 0.533333 0.133333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0249.1