MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0973.1 CDF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1001 E= 0 0.333666 0.283716 0.234765 0.147852 0.608000 0.092000 0.150000 0.150000 0.693000 0.016000 0.041000 0.250000 0.980981 0.010010 0.004004 0.005005 0.979000 0.010000 0.002000 0.009000 0.868000 0.029000 0.081000 0.022000 0.017017 0.007007 0.969970 0.006006 0.053000 0.295000 0.154000 0.498000 0.328000 0.077000 0.395000 0.200000 0.299000 0.282000 0.155000 0.264000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0973.1 MOTIF MA0974.1 CDF3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1001 E= 0 0.446553 0.142857 0.219780 0.190809 0.607608 0.029029 0.065065 0.298298 0.994000 0.003000 0.001000 0.002000 0.989000 0.005000 0.000000 0.006000 0.880000 0.027000 0.083000 0.010000 0.018981 0.006993 0.968032 0.005994 0.070000 0.291000 0.160000 0.479000 0.222222 0.102102 0.495495 0.180180 0.286000 0.343000 0.169000 0.202000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0974.1 MOTIF MA0974.2 CDF3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1157 E= 0 0.342264 0.143475 0.184097 0.330164 0.291271 0.184961 0.221262 0.302506 0.759723 0.054451 0.068280 0.117545 0.833189 0.020743 0.025065 0.121003 0.987900 0.001729 0.006050 0.004322 0.979257 0.003457 0.009507 0.007779 0.972342 0.002593 0.016422 0.008643 0.000864 0.000000 0.997407 0.001729 0.025065 0.038029 0.031979 0.904927 0.074330 0.006050 0.897148 0.022472 0.371651 0.181504 0.089888 0.356958 0.448574 0.160761 0.112360 0.278306 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0974.2 MOTIF UN0360.1 CDF5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 3821 E= 0 0.341795 0.126145 0.168804 0.363256 0.216174 0.235540 0.242345 0.305941 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.995027 0.000000 0.000000 0.004973 0.999738 0.000000 0.000000 0.000262 0.999738 0.000000 0.000000 0.000262 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.246271 0.133473 0.189479 0.430777 0.417953 0.085056 0.257786 0.239204 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0360.1 MOTIF MA0878.1 CDX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 9274 E= 0 0.241104 0.167889 0.529545 0.061462 0.030161 0.536736 0.001983 0.431121 0.511102 0.388151 0.019296 0.081451 0.905753 0.013087 0.073933 0.007227 0.003006 0.001288 0.000000 0.995705 0.832570 0.026932 0.010055 0.130443 0.903634 0.007210 0.007600 0.081555 0.869084 0.045919 0.023990 0.061006 0.501402 0.188376 0.135540 0.174682 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0878.1 MOTIF MA0878.2 CDX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 18999 E= 0 0.170851 0.130059 0.462340 0.236749 0.088375 0.000000 0.911481 0.000144 0.000000 0.702284 0.000053 0.297663 0.379113 0.619416 0.001472 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.999474 0.000000 0.000526 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.999001 0.000000 0.000999 0.000000 0.607353 0.230946 0.053932 0.107769 0.093804 0.562878 0.141759 0.201558 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0878.2 MOTIF MA0465.1 CDX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1597 E= 0 0.383845 0.199750 0.300564 0.115842 0.416406 0.005009 0.314339 0.264245 0.192862 0.085160 0.721979 0.000000 0.000000 0.656230 0.000000 0.343770 0.436443 0.520977 0.000000 0.042580 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.634314 0.093926 0.195992 0.075767 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0465.1 MOTIF MA0465.2 CDX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 32026 E= 0 0.354993 0.199213 0.232124 0.213670 0.366421 0.080185 0.275276 0.278118 0.098576 0.065447 0.756073 0.079904 0.038281 0.830169 0.018953 0.112596 0.834322 0.103416 0.005745 0.056517 0.935396 0.012927 0.037345 0.014332 0.008556 0.012209 0.012053 0.967183 0.912415 0.023762 0.031193 0.032630 0.956879 0.010897 0.011428 0.020796 0.940642 0.018579 0.015675 0.025105 0.429401 0.165459 0.183726 0.221414 0.318491 0.215606 0.185287 0.280616 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0465.2 MOTIF MA1473.1 CDX4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 23367 E= 0 0.158899 0.095391 0.520221 0.225489 0.093600 0.039317 0.863462 0.003621 0.000000 0.628295 0.000000 0.371705 0.529731 0.469200 0.001069 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.997567 0.002433 0.000000 0.000000 0.634025 0.176177 0.058825 0.130973 0.116185 0.490157 0.160818 0.232840 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1473.1 MOTIF MA0102.2 CEBPA letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 18 E= 0 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.055556 0.055556 0.222222 0.666667 0.222222 0.055556 0.333333 0.388889 0.111111 0.500000 0.111111 0.277778 0.222222 0.111111 0.555556 0.111111 0.111111 0.833333 0.000000 0.055556 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.111111 0.555556 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0102.2