MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0288.1 CUP9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 99 E= 0 0.070707 0.101010 0.030303 0.797980 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.840000 0.000000 0.090000 0.070000 0.010000 0.990000 0.000000 0.000000 0.910000 0.000000 0.090000 0.000000 0.000000 0.640000 0.090000 0.270000 0.750000 0.150000 0.000000 0.100000 0.400000 0.000000 0.000000 0.600000 0.390000 0.130000 0.030000 0.450000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0288.1 MOTIF MA0754.1 CUX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 36808 E= 0 0.111362 0.126304 0.065230 0.697104 0.492401 0.063251 0.298407 0.145941 0.982087 0.004172 0.007349 0.006392 0.002720 0.011264 0.002950 0.983066 0.001935 0.973481 0.002011 0.022574 0.367712 0.010133 0.617165 0.004990 0.986126 0.001729 0.003267 0.008878 0.005784 0.003663 0.001118 0.989434 0.516091 0.189469 0.152058 0.142383 0.318329 0.297478 0.154254 0.229939 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0754.1 MOTIF MA0755.1 CUX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 62500 E= 0 0.129776 0.073168 0.067952 0.729104 0.527657 0.058672 0.272507 0.141163 0.975698 0.005353 0.011562 0.007387 0.009902 0.038058 0.010026 0.942014 0.001592 0.980548 0.002023 0.015837 0.298161 0.004505 0.688779 0.008555 0.990803 0.001500 0.003544 0.004153 0.008551 0.006003 0.001425 0.984020 0.591936 0.152371 0.098554 0.157139 0.434694 0.209217 0.110950 0.245139 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0755.1 MOTIF PF0034.1 CYTAGCAAY letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 608 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.587171 0.000000 0.412829 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.967105 0.000000 0.032895 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0034.1 MOTIF PH0012.1 Cdx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.290000 0.150000 0.180000 0.380000 0.390000 0.100000 0.310000 0.200000 0.400000 0.250000 0.240000 0.110000 0.140000 0.060000 0.730000 0.070000 0.130000 0.030000 0.830000 0.010000 0.010000 0.280000 0.000000 0.710000 0.490000 0.470000 0.000000 0.040000 0.828283 0.000000 0.171717 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.740000 0.010000 0.000000 0.250000 0.920000 0.000000 0.000000 0.080000 0.940000 0.010000 0.000000 0.050000 0.646465 0.111111 0.050505 0.191919 0.161616 0.232323 0.171717 0.434343 0.140000 0.110000 0.260000 0.490000 0.360000 0.210000 0.100000 0.330000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0012.1 MOTIF PH0013.1 Cdx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.310000 0.150000 0.250000 0.290000 0.356436 0.178218 0.326733 0.138614 0.300000 0.300000 0.300000 0.100000 0.190000 0.060000 0.660000 0.090000 0.171717 0.030303 0.797980 0.000000 0.000000 0.464646 0.000000 0.535354 0.580000 0.400000 0.000000 0.020000 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.880000 0.000000 0.000000 0.120000 0.950000 0.000000 0.000000 0.050000 0.940000 0.010000 0.000000 0.050000 0.570000 0.150000 0.050000 0.230000 0.171717 0.262626 0.121212 0.444444 0.140000 0.110000 0.260000 0.490000 0.220000 0.300000 0.130000 0.350000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0013.1 MOTIF MA0102.1 Cebpa letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 18 E= 0 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.055556 0.055556 0.222222 0.666667 0.222222 0.055556 0.333333 0.388889 0.111111 0.500000 0.111111 0.277778 0.222222 0.111111 0.555556 0.111111 0.111111 0.833333 0.000000 0.055556 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.111111 0.555556 0.277778 0.333333 0.277778 0.111111 0.111111 0.277778 0.166667 0.444444 0.055556 0.333333 0.277778 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0102.1 MOTIF MA0015.1 Cf2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 80 E= 0 0.312500 0.162500 0.500000 0.025000 0.012500 0.025000 0.012500 0.950000 0.925000 0.025000 0.050000 0.000000 0.000000 0.112500 0.050000 0.837500 0.975000 0.025000 0.000000 0.000000 0.012500 0.050000 0.012500 0.925000 0.512500 0.025000 0.450000 0.012500 0.025000 0.112500 0.012500 0.850000 0.662500 0.037500 0.250000 0.050000 0.150000 0.362500 0.187500 0.300000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0015.1 MOTIF MA1700.1 Clamp letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 2651 E= 0 0.125236 0.094304 0.712184 0.068276 0.403998 0.171633 0.142588 0.281780 0.071294 0.066013 0.821577 0.041117 0.268955 0.498680 0.133535 0.098831 0.027914 0.010939 0.955111 0.006035 0.946813 0.012071 0.016220 0.024896 0.023387 0.004149 0.966428 0.006035 0.122595 0.753678 0.065636 0.058091 0.011694 0.004527 0.980762 0.003018 0.924557 0.010562 0.058469 0.006413 0.026782 0.013580 0.949453 0.010185 0.768767 0.125236 0.044512 0.061486 0.088269 0.189363 0.571482 0.150886 0.471897 0.123350 0.362127 0.042625 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1700.1 MOTIF UN0107.1 Cp190 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 3007 E= 0 0.231460 0.480213 0.075491 0.212837 0.086132 0.204523 0.589957 0.119388 0.035584 0.867975 0.032923 0.063518 0.094779 0.741935 0.048886 0.114400 0.146325 0.369471 0.170934 0.313269 0.619554 0.111074 0.196874 0.072498 0.818424 0.031926 0.070170 0.079481 0.933489 0.014300 0.035584 0.016628 0.916528 0.011307 0.038244 0.033921 0.059860 0.034253 0.871633 0.034253 0.011972 0.035251 0.004323 0.948454 0.941802 0.012637 0.033921 0.011640 0.010642 0.008314 0.141669 0.839375 0.035584 0.012970 0.938144 0.013302 0.014300 0.952777 0.010309 0.022614 0.656136 0.072165 0.012637 0.259062 0.773861 0.044563 0.125042 0.056535 0.111739 0.495843 0.053542 0.338876 0.499169 0.081144 0.310276 0.109411 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0107.1