MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1603.1 Dmrt1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 18295 E= 0 0.141733 0.060836 0.673900 0.123531 0.408472 0.230773 0.068106 0.292648 0.213993 0.067122 0.050178 0.668707 0.980213 0.003772 0.004482 0.011533 0.011533 0.963815 0.007598 0.017054 0.955944 0.006013 0.005685 0.032359 0.850943 0.026346 0.024925 0.097786 0.679585 0.011205 0.017600 0.291610 0.039738 0.010112 0.930965 0.019186 0.029899 0.008800 0.010932 0.950369 0.566658 0.067395 0.137797 0.228150 0.322984 0.072861 0.225854 0.378300 0.146925 0.645477 0.075922 0.131675 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1603.1 MOTIF UN0252.1 Dmrtb1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 4093 E= 0 0.106035 0.059614 0.740044 0.094307 0.408258 0.264354 0.063279 0.264109 0.227462 0.104080 0.060347 0.608111 0.978011 0.004886 0.006108 0.010994 0.013193 0.954312 0.019057 0.013438 0.938676 0.012216 0.002688 0.046421 0.764720 0.056682 0.048131 0.130467 0.552651 0.007085 0.023210 0.417054 0.032006 0.016369 0.939164 0.012460 0.022233 0.009284 0.015148 0.953335 0.818226 0.030540 0.066455 0.084779 0.254092 0.038114 0.202541 0.505253 0.109699 0.748839 0.062057 0.079404 0.348644 0.305888 0.076716 0.268752 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0252.1 MOTIF MA0020.1 Dof2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 21 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.142857 0.666667 0.095238 0.095238 0.333333 0.285714 0.142857 0.238095 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0020.1 MOTIF MA0021.1 Dof3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 21 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.476190 0.142857 0.380952 0.285714 0.285714 0.428571 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0021.1 MOTIF MA0188.1 Dr letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.047619 0.619048 0.285714 0.047619 0.000000 0.761905 0.000000 0.238095 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0188.1 MOTIF MA1456.1 Dref letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 3112 E= 0 0.261568 0.196658 0.351864 0.189910 0.254177 0.330334 0.114717 0.300771 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.117931 0.053342 0.039203 0.789524 0.586440 0.060411 0.147494 0.205656 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1456.1 MOTIF UN0108.1 Dsp1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 1078 E= 0 0.365492 0.201299 0.102041 0.331169 0.087199 0.126160 0.733766 0.052876 0.369202 0.369202 0.144712 0.116883 0.054731 0.008349 0.929499 0.007421 0.976809 0.006494 0.009276 0.007421 0.062152 0.011132 0.921150 0.005566 0.154917 0.703154 0.076994 0.064935 0.019481 0.005566 0.971243 0.003711 0.895176 0.008349 0.092764 0.003711 0.014842 0.003711 0.974954 0.006494 0.952690 0.019481 0.014842 0.012987 0.052876 0.397032 0.374768 0.175325 0.233766 0.062152 0.685529 0.018553 0.076994 0.055659 0.848794 0.018553 0.378479 0.384972 0.169759 0.066790 0.219852 0.187384 0.455473 0.137291 0.439703 0.215213 0.243043 0.102041 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0108.1 MOTIF MA0611.1 Dux letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.219000 0.312000 0.250000 0.219000 0.000000 0.869000 0.000000 0.131000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.485000 0.031000 0.242000 0.242000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0611.1 MOTIF PH0026.1 Duxbl letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.060000 0.550000 0.100000 0.290000 0.350000 0.050000 0.470000 0.130000 0.770000 0.020000 0.160000 0.050000 0.060000 0.670000 0.110000 0.160000 0.020202 0.666667 0.090909 0.222222 0.000000 0.747475 0.000000 0.252525 0.990000 0.010000 0.000000 0.000000 0.979798 0.020202 0.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.980000 0.000000 0.020000 0.970000 0.000000 0.000000 0.030000 0.830000 0.030000 0.090000 0.050000 0.050000 0.530000 0.180000 0.240000 0.247525 0.247525 0.277228 0.227723 0.310000 0.190000 0.340000 0.160000 0.280000 0.200000 0.150000 0.370000 0.200000 0.290000 0.340000 0.170000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PH0026.1 MOTIF MA0024.1 E2F1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 10 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.400000 0.600000 0.000000 0.000000 0.200000 0.800000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.900000 0.100000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0024.1