MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0846.1 FOXC2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 22189 E= 0 0.402857 0.057641 0.020461 0.519041 0.698610 0.056419 0.173935 0.071036 0.417612 0.128451 0.115628 0.338310 0.305154 0.020921 0.667459 0.006466 0.075504 0.142082 0.012088 0.770326 0.745916 0.246463 0.003172 0.004449 0.974652 0.016390 0.003859 0.005098 0.970306 0.004981 0.013234 0.011479 0.001508 0.702262 0.003308 0.292921 0.969479 0.004787 0.015545 0.010190 0.548221 0.086051 0.070507 0.295221 0.419897 0.117625 0.101165 0.361314 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0846.1 MOTIF MA0031.1 FOXD1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 20 E= 0 0.050000 0.050000 0.850000 0.050000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.950000 0.050000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.900000 0.050000 0.050000 0.000000 0.050000 0.900000 0.000000 0.050000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.350000 0.100000 0.150000 0.400000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0031.1 MOTIF MA0847.1 FOXD2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 1949 E= 0 0.310416 0.027193 0.646998 0.015393 0.103943 0.152927 0.000000 0.743130 0.823114 0.123952 0.000000 0.052933 0.943854 0.029843 0.010116 0.016186 0.981589 0.000000 0.000000 0.018411 0.000000 0.718585 0.014784 0.266631 0.823841 0.000000 0.098455 0.077704 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0847.1 MOTIF MA0847.2 FOXD2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 5994 E= 0 0.234234 0.305973 0.386053 0.073740 0.120658 0.335612 0.043102 0.500628 0.361783 0.005966 0.000497 0.631753 0.809697 0.012426 0.174770 0.003106 0.414012 0.201501 0.125438 0.259049 0.299426 0.011596 0.688289 0.000689 0.020705 0.140599 0.000000 0.838696 0.898127 0.098577 0.001648 0.001648 0.961970 0.033537 0.002728 0.001765 0.990418 0.000000 0.004130 0.005452 0.000000 0.722986 0.000000 0.277014 0.939361 0.008305 0.019586 0.032748 0.400400 0.167334 0.085919 0.346346 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0847.2 MOTIF MA1487.1 FOXE1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 663 E= 0 0.081448 0.435897 0.248869 0.233786 0.302521 0.400210 0.297269 0.000000 0.050068 0.403248 0.051421 0.495264 0.223392 0.000000 0.000000 0.776608 0.936530 0.021157 0.042313 0.000000 0.682425 0.058582 0.059609 0.199383 0.744395 0.000000 0.255605 0.000000 0.000000 0.487952 0.000000 0.512048 0.985163 0.014837 0.000000 0.000000 0.988095 0.011905 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.995502 0.000000 0.004498 0.000000 0.598851 0.096552 0.141379 0.163218 0.223228 0.271493 0.150830 0.354449 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1487.1 MOTIF MA0030.1 FOXF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 27 E= 0 0.037037 0.370370 0.259259 0.333333 0.370370 0.259259 0.185185 0.185185 0.629630 0.148148 0.074074 0.148148 0.464286 0.178571 0.178571 0.178571 0.136364 0.500000 0.363636 0.000000 0.259259 0.000000 0.740741 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.925926 0.000000 0.074074 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.592593 0.148148 0.074074 0.185185 0.259259 0.148148 0.222222 0.370370 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0030.1 MOTIF MA0613.1 FOXG1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.374374 0.001001 0.623624 0.001001 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.498000 0.167000 0.002000 0.333000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0613.1 MOTIF MA0479.1 FOXH1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 8211 E= 0 0.114359 0.345877 0.181464 0.358300 0.192181 0.284131 0.260261 0.263427 0.118500 0.397150 0.384362 0.099988 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.919133 0.000000 0.027889 0.052978 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.289124 0.703081 0.000000 0.007794 0.172208 0.827792 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.869322 0.000000 0.000000 0.130678 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0479.1 MOTIF MA0042.1 FOXI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 31 E= 0 0.193548 0.032258 0.451613 0.322581 0.129032 0.258065 0.387097 0.225806 0.354839 0.129032 0.258065 0.258065 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.419355 0.000000 0.580645 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.483871 0.000000 0.516129 0.000000 0.000000 0.000000 0.225806 0.774194 0.258065 0.032258 0.129032 0.580645 0.064516 0.032258 0.129032 0.774194 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0042.1 MOTIF MA0042.2 FOXI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 5832 E= 0 0.105967 0.006687 0.887346 0.000000 0.013847 0.011228 0.006549 0.968376 0.899687 0.093880 0.006433 0.000000 0.995575 0.004425 0.000000 0.000000 0.977706 0.004345 0.005479 0.012469 0.025363 0.836026 0.007754 0.130856 0.992901 0.002302 0.004797 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0042.2