MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0851.1 Foxj3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.270000 0.260000 0.210000 0.260000 0.340000 0.130000 0.310000 0.220000 0.480000 0.190000 0.160000 0.170000 0.510000 0.130000 0.170000 0.190000 0.346535 0.128713 0.326733 0.198020 0.303030 0.010101 0.686869 0.000000 0.010000 0.020000 0.000000 0.970000 0.919192 0.080808 0.000000 0.000000 0.950495 0.019802 0.000000 0.029703 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.818182 0.000000 0.181818 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.782178 0.069307 0.059406 0.089109 0.570000 0.090000 0.070000 0.270000 0.220000 0.340000 0.260000 0.180000 0.270000 0.270000 0.240000 0.220000 0.242424 0.393939 0.171717 0.191919 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0851.1 MOTIF PB0017.1 Foxj3_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.270000 0.260000 0.210000 0.260000 0.340000 0.130000 0.310000 0.220000 0.480000 0.190000 0.160000 0.170000 0.510000 0.130000 0.170000 0.190000 0.346535 0.128713 0.326733 0.198020 0.303030 0.010101 0.686869 0.000000 0.010000 0.020000 0.000000 0.970000 0.919192 0.080808 0.000000 0.000000 0.950495 0.019802 0.000000 0.029703 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.818182 0.000000 0.181818 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.782178 0.069307 0.059406 0.089109 0.570000 0.090000 0.070000 0.270000 0.220000 0.340000 0.260000 0.180000 0.270000 0.270000 0.240000 0.220000 0.242424 0.393939 0.171717 0.191919 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0017.1 MOTIF PB0121.1 Foxj3_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.316832 0.247525 0.217822 0.217822 0.350000 0.160000 0.230000 0.260000 0.171717 0.303030 0.262626 0.262626 0.530000 0.100000 0.260000 0.110000 0.207921 0.386139 0.198020 0.207921 0.030303 0.858586 0.010101 0.101010 0.670000 0.280000 0.040000 0.010000 0.500000 0.240000 0.010000 0.250000 0.910000 0.040000 0.020000 0.030000 0.959596 0.010101 0.010101 0.020202 0.010000 0.860000 0.010000 0.120000 0.960000 0.010000 0.010000 0.020000 0.410000 0.130000 0.140000 0.320000 0.465347 0.128713 0.069307 0.336634 0.212121 0.101010 0.414141 0.272727 0.180000 0.310000 0.350000 0.160000 0.290000 0.220000 0.240000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0121.1 MOTIF MA0852.1 Foxk1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.190000 0.210000 0.260000 0.405941 0.118812 0.277228 0.198020 0.600000 0.070000 0.120000 0.210000 0.710000 0.040000 0.050000 0.200000 0.120000 0.120000 0.180000 0.580000 0.200000 0.010000 0.790000 0.000000 0.020202 0.000000 0.000000 0.979798 0.920000 0.080000 0.000000 0.000000 0.970000 0.010000 0.000000 0.020000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.890000 0.000000 0.110000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.808081 0.060606 0.020202 0.111111 0.565657 0.090909 0.101010 0.242424 0.270000 0.300000 0.290000 0.140000 0.340000 0.220000 0.250000 0.190000 0.151515 0.272727 0.323232 0.252525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0852.1 MOTIF PB0018.1 Foxk1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.190000 0.210000 0.260000 0.405941 0.118812 0.277228 0.198020 0.600000 0.070000 0.120000 0.210000 0.710000 0.040000 0.050000 0.200000 0.120000 0.120000 0.180000 0.580000 0.200000 0.010000 0.790000 0.000000 0.020202 0.000000 0.000000 0.979798 0.920000 0.080000 0.000000 0.000000 0.970000 0.010000 0.000000 0.020000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.890000 0.000000 0.110000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.808081 0.060606 0.020202 0.111111 0.565657 0.090909 0.101010 0.242424 0.270000 0.300000 0.290000 0.140000 0.340000 0.220000 0.250000 0.190000 0.151515 0.272727 0.323232 0.252525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0018.1 MOTIF PB0122.1 Foxk1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.430000 0.140000 0.190000 0.366337 0.247525 0.118812 0.267327 0.490000 0.220000 0.110000 0.180000 0.740000 0.040000 0.150000 0.070000 0.080000 0.550000 0.030000 0.340000 0.590000 0.290000 0.080000 0.040000 0.910000 0.030000 0.050000 0.010000 0.010000 0.570000 0.010000 0.410000 0.950000 0.020000 0.020000 0.010000 0.900000 0.020000 0.030000 0.050000 0.079208 0.792079 0.029703 0.099010 0.828283 0.040404 0.050505 0.080808 0.252525 0.343434 0.141414 0.262626 0.320000 0.340000 0.130000 0.210000 0.230000 0.260000 0.170000 0.340000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0122.1 MOTIF PB0019.1 Foxl1_1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.320000 0.150000 0.190000 0.340000 0.425743 0.059406 0.099010 0.415842 0.660000 0.040000 0.040000 0.260000 0.650000 0.050000 0.080000 0.220000 0.210000 0.080000 0.070000 0.640000 0.340000 0.000000 0.650000 0.010000 0.020000 0.000000 0.000000 0.980000 0.950000 0.050000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.990000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.787879 0.000000 0.212121 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.800000 0.040000 0.020000 0.140000 0.530000 0.090000 0.110000 0.270000 0.210000 0.270000 0.370000 0.150000 0.280000 0.220000 0.340000 0.160000 0.150000 0.250000 0.290000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0019.1 MOTIF PB0123.1 Foxl1_2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 99 E= 0 0.565657 0.121212 0.080808 0.232323 0.320000 0.150000 0.180000 0.350000 0.480000 0.120000 0.170000 0.230000 0.200000 0.160000 0.190000 0.450000 0.030000 0.570000 0.020000 0.380000 0.640000 0.170000 0.020000 0.170000 0.570000 0.110000 0.010000 0.310000 0.898990 0.050505 0.010101 0.040404 0.910000 0.030000 0.030000 0.030000 0.010101 0.747475 0.020202 0.222222 0.910000 0.020000 0.030000 0.040000 0.700000 0.070000 0.080000 0.150000 0.445545 0.316832 0.059406 0.178218 0.590000 0.130000 0.140000 0.140000 0.260000 0.330000 0.170000 0.240000 0.360000 0.330000 0.150000 0.160000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PB0123.1 MOTIF MA1607.1 Foxl2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 18101 E= 0 0.344456 0.167449 0.255290 0.232805 0.326667 0.160875 0.194520 0.317938 0.355395 0.087067 0.088338 0.469201 0.616430 0.113309 0.116402 0.153859 0.164908 0.049500 0.075742 0.709850 0.144025 0.020275 0.809237 0.026463 0.060604 0.016629 0.023148 0.899619 0.951715 0.030827 0.006188 0.011270 0.950887 0.018563 0.010331 0.020220 0.947240 0.011933 0.022706 0.018121 0.015579 0.867245 0.008342 0.108834 0.863101 0.044583 0.022153 0.070162 0.288879 0.234573 0.212364 0.264184 0.284128 0.239158 0.250207 0.226507 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1607.1 MOTIF MA1684.1 Foxn1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 5235 E= 0 0.279656 0.000000 0.488634 0.231710 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.436867 0.563133 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1684.1