MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF POL003.1 GC-box letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 274 E= 0 0.372263 0.145985 0.182482 0.299270 0.354015 0.113139 0.408759 0.124088 0.182482 0.021898 0.562044 0.233577 0.244526 0.003650 0.751825 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.007299 0.000000 0.992701 0.000000 0.197080 0.620438 0.000000 0.182482 0.167883 0.003650 0.817518 0.010949 0.003650 0.010949 0.810219 0.175182 0.288321 0.000000 0.624088 0.087591 0.083942 0.062044 0.700730 0.153285 0.000000 0.605839 0.127737 0.266423 0.072993 0.313869 0.189781 0.423358 0.145985 0.087591 0.397810 0.368613 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/POL003.1 MOTIF PF0035.1 GCANCTGNY letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 3756 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.062034 0.359425 0.458733 0.119808 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.095847 0.430511 0.215921 0.257721 0.000000 0.526092 0.000000 0.473908 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0035.1 MOTIF PF0010.1 GCCATNTTG letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 2088 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.074234 0.412356 0.147989 0.365421 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0010.1 MOTIF PF0095.1 GCCNNNWTAAR letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 460 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.167391 0.443478 0.215217 0.173913 0.171739 0.521739 0.067391 0.239130 0.097826 0.219565 0.060870 0.621739 0.313043 0.000000 0.000000 0.686957 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.476087 0.000000 0.523913 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0095.1 MOTIF PF0048.1 GCGNNANTTCC letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 620 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.083871 0.250000 0.388710 0.277419 0.069355 0.548387 0.343548 0.038710 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.022581 0.654839 0.138710 0.183871 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0048.1 MOTIF PF0164.1 GCGSCMNTTT letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 312 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.679487 0.320513 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.750000 0.250000 0.000000 0.000000 0.266026 0.102564 0.070513 0.560897 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0164.1 MOTIF MA0646.1 GCM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 21439 E= 0 0.117636 0.398946 0.240403 0.243015 0.779005 0.065804 0.145707 0.009484 0.007368 0.007048 0.004394 0.981190 0.167478 0.010498 0.821449 0.000575 0.041937 0.897292 0.023940 0.036831 0.022756 0.009769 0.821323 0.146152 0.000000 0.000186 0.998184 0.001630 0.000000 0.000838 0.998696 0.000466 0.005463 0.186798 0.005501 0.802238 0.624516 0.084622 0.232194 0.058668 0.036802 0.625589 0.225244 0.112365 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0646.1 MOTIF MA0767.1 GCM2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1321 E= 0 0.135503 0.257381 0.283876 0.323240 0.758185 0.044227 0.171740 0.025847 0.016335 0.029119 0.017045 0.937500 0.162848 0.019814 0.817337 0.000000 0.050330 0.790893 0.082684 0.076093 0.035466 0.000695 0.917942 0.045897 0.000000 0.000000 0.990248 0.009752 0.000757 0.000000 0.999243 0.000000 0.045187 0.261788 0.044695 0.648330 0.453788 0.106061 0.258333 0.181818 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0767.1 MOTIF MA0303.1 GCN4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 998 E= 0 0.218437 0.295591 0.245491 0.240481 0.371743 0.217435 0.268537 0.142285 0.362725 0.213427 0.150301 0.273547 0.282565 0.119238 0.325651 0.272545 0.275551 0.177355 0.316633 0.230461 0.169169 0.140140 0.365365 0.325325 0.536072 0.035070 0.413828 0.015030 0.011022 0.008016 0.006012 0.974950 0.002004 0.005010 0.935872 0.057114 0.969940 0.013026 0.004008 0.013026 0.002004 0.433868 0.563126 0.001002 0.013026 0.004008 0.013026 0.969940 0.057114 0.935872 0.005010 0.002004 0.974950 0.006012 0.008016 0.011022 0.015030 0.413828 0.035070 0.536072 0.376376 0.290290 0.131131 0.202202 0.207207 0.354354 0.194194 0.244244 0.284569 0.216433 0.202405 0.296593 0.226453 0.234469 0.177355 0.361723 0.254509 0.329659 0.232465 0.183367 0.337675 0.169339 0.195391 0.297595 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0303.1 MOTIF MA0304.1 GCR1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 2649 E= 0 0.271423 0.011703 0.029068 0.687807 0.000000 0.057724 0.942276 0.000000 0.000000 0.008943 0.991057 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.876473 0.004063 0.000000 0.119464 0.003645 0.005265 0.942082 0.049008 0.221554 0.682292 0.000000 0.096154 0.000000 0.743649 0.005774 0.250577 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0304.1