MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF PF0118.1 GGCNRNWCTTYS letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 356 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.143258 0.123596 0.575843 0.157303 0.106742 0.000000 0.893258 0.000000 0.185393 0.162921 0.550562 0.101124 0.800562 0.000000 0.000000 0.199438 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.747191 0.000000 0.252809 0.000000 0.825843 0.174157 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0118.1 MOTIF PF0024.1 GGGAGGRR letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 11176 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.333214 0.000000 0.666786 0.000000 0.225931 0.000000 0.774069 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0024.1 MOTIF PF0006.1 GGGCGGR letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 18548 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.223690 0.000000 0.776310 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0006.1 MOTIF PF0086.1 GGGNNTTTCC letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 396 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.343434 0.207071 0.315657 0.133838 0.325758 0.252525 0.191919 0.229798 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0086.1 MOTIF PF0119.1 GGGNRMNNYCAT letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 320 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.193750 0.537500 0.153125 0.115625 0.165625 0.000000 0.834375 0.000000 0.275000 0.725000 0.000000 0.000000 0.193750 0.515625 0.168750 0.121875 0.121875 0.128125 0.637500 0.112500 0.000000 0.778125 0.000000 0.221875 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0119.1 MOTIF PF0056.1 GGGTGGRR letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 5364 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.249627 0.000000 0.750373 0.000000 0.220544 0.000000 0.779456 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0056.1 MOTIF PF0031.1 GGGYGTGNY letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 2812 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.556188 0.000000 0.443812 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.113798 0.115932 0.586060 0.184211 0.000000 0.718706 0.000000 0.281294 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0031.1 MOTIF MA0306.1 GIS1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0 0.410000 0.220000 0.120000 0.250000 0.000000 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.870000 0.000000 0.130000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.490000 0.040000 0.150000 0.320000 0.460000 0.110000 0.160000 0.270000 0.323232 0.191919 0.181818 0.303030 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0306.1 MOTIF PF0019.1 GKCGCNNNNNNNTGAYG letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 316 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.636076 0.363924 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.139241 0.208861 0.534810 0.117089 0.044304 0.351266 0.408228 0.196203 0.234177 0.265823 0.408228 0.091772 0.123418 0.351266 0.354430 0.170886 0.104430 0.284810 0.246835 0.363924 0.291139 0.044304 0.487342 0.177215 0.537975 0.101266 0.319620 0.041139 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.930380 0.000000 0.069620 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0019.1 MOTIF MA0734.1 GLI2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 2172 E= 0 0.160221 0.084715 0.661602 0.093462 0.072562 0.814626 0.065760 0.047052 0.010674 0.006671 0.958639 0.024016 0.882136 0.090853 0.017802 0.009208 0.004118 0.986273 0.004118 0.005491 0.000000 0.991718 0.005521 0.002761 0.972260 0.014208 0.004060 0.009472 0.003434 0.986951 0.006181 0.003434 0.493389 0.268615 0.162143 0.075852 0.158586 0.725758 0.046465 0.069192 0.275000 0.047951 0.088115 0.588934 0.300107 0.078676 0.511570 0.109648 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0734.1