MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1368.2 GT-4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 646 E= 0 0.323529 0.201238 0.170279 0.304954 0.119195 0.243034 0.137771 0.500000 0.171827 0.085139 0.057276 0.685759 0.798762 0.030960 0.068111 0.102167 0.961300 0.009288 0.006192 0.023220 0.015480 0.947368 0.013932 0.023220 0.012384 0.280186 0.003096 0.704334 0.883901 0.037152 0.043344 0.035604 0.030960 0.040248 0.051084 0.877709 0.134675 0.001548 0.854489 0.009288 0.030960 0.007740 0.956656 0.004644 0.013932 0.007740 0.004644 0.973684 0.097523 0.055728 0.017028 0.829721 0.613003 0.063467 0.097523 0.226006 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1368.2 MOTIF MA1207.1 GT-A3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 371 E= 0 0.390836 0.194070 0.258760 0.156334 0.417790 0.185984 0.264151 0.132075 0.029650 0.970350 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.884097 0.000000 0.115903 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.873315 0.126685 0.145553 0.107817 0.204852 0.541779 0.285714 0.221024 0.153639 0.339623 0.493261 0.040431 0.107817 0.358491 0.549865 0.177898 0.037736 0.234501 0.698113 0.010782 0.000000 0.291105 0.288410 0.172507 0.010782 0.528302 0.350404 0.008086 0.280323 0.361186 0.215633 0.113208 0.097035 0.574124 0.245283 0.113208 0.377358 0.264151 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1207.1 MOTIF PF0098.1 GTCNYYATGR letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 484 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.175620 0.057851 0.260331 0.506198 0.000000 0.894628 0.000000 0.105372 0.000000 0.745868 0.000000 0.254132 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.179752 0.000000 0.820248 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0098.1 MOTIF PF0020.1 GTGACGY letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 3432 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.417832 0.000000 0.582168 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0020.1 MOTIF PF0091.1 GTGGGTGK letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 944 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.655720 0.344280 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0091.1 MOTIF PF0043.1 GTTGNYNNRGNAAC letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 420 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.009524 0.745238 0.023810 0.221429 0.000000 0.792857 0.000000 0.207143 0.535714 0.180952 0.159524 0.123810 0.185714 0.111905 0.233333 0.469048 0.290476 0.000000 0.709524 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.297619 0.295238 0.126190 0.280952 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0043.1 MOTIF PF0089.1 GTTNYYNNGGTNA letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 364 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.214286 0.082418 0.516484 0.186813 0.000000 0.788462 0.000000 0.211538 0.000000 0.620879 0.000000 0.379121 0.521978 0.214286 0.140110 0.123626 0.274725 0.104396 0.159341 0.461538 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.447802 0.082418 0.263736 0.206044 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0089.1 MOTIF PF0037.1 GTTRYCATRR letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 652 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.222393 0.000000 0.777607 0.000000 0.000000 0.855828 0.000000 0.144172 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.257669 0.000000 0.742331 0.000000 0.173313 0.000000 0.826687 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/PF0037.1 MOTIF MA0309.1 GZF3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.180000 0.390000 0.020000 0.410000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.730000 0.090000 0.000000 0.180000 0.039604 0.376238 0.584158 0.000000 0.390000 0.180000 0.270000 0.160000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0309.1 MOTIF MA0062.2 Gabpa letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 989 E= 0 0.032356 0.776542 0.190091 0.001011 0.070779 0.924166 0.004044 0.001011 0.000000 0.000000 0.998991 0.001009 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.997986 0.001007 0.001007 0.000000 0.995972 0.002014 0.000000 0.002014 0.094758 0.032258 0.872984 0.000000 0.056509 0.263370 0.037336 0.642785 0.155556 0.138384 0.609091 0.096970 0.266667 0.264646 0.419192 0.049495 0.235354 0.360606 0.226263 0.177778 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0062.2