MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1493.1 HES6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 533 E= 0 0.022514 0.073171 0.823640 0.080675 0.031809 0.069583 0.872763 0.025845 0.034694 0.895918 0.038776 0.030612 0.956427 0.000000 0.019608 0.023965 0.004292 0.942060 0.019313 0.034335 0.021692 0.026030 0.952278 0.000000 0.000000 0.014737 0.061053 0.924211 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.066937 0.042596 0.000000 0.890467 0.179545 0.345455 0.000000 0.475000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1493.1 MOTIF MA0822.1 HES7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1864 E= 0 0.090129 0.423820 0.023069 0.462983 0.012565 0.009948 0.975916 0.001571 0.077859 0.014112 0.907056 0.000973 0.000535 0.997859 0.000000 0.001606 0.994664 0.001601 0.003735 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.002139 0.000535 0.996791 0.000535 0.001603 0.001603 0.000534 0.996259 0.001071 0.000536 0.998393 0.000000 0.004061 0.946193 0.002538 0.047208 0.000000 0.990436 0.004782 0.004782 0.507511 0.025215 0.393777 0.073498 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0822.1 MOTIF MA0894.1 HESX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 4071 E= 0 0.204127 0.184967 0.428150 0.182756 0.215917 0.351756 0.109801 0.322525 0.043559 0.000000 0.007920 0.948521 0.979788 0.000000 0.012753 0.007459 0.996086 0.001712 0.002202 0.000000 0.000000 0.000000 0.003670 0.996330 0.000000 0.003670 0.000000 0.996330 0.449727 0.009033 0.518184 0.023057 0.305822 0.189634 0.412921 0.091624 0.196709 0.393173 0.113212 0.296906 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0894.1 MOTIF MA0823.1 HEY1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 3338 E= 0 0.130917 0.227981 0.535650 0.105452 0.411324 0.196525 0.359197 0.032954 0.000298 0.994340 0.000894 0.004468 0.950456 0.008542 0.035023 0.005979 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.005364 0.994636 0.000000 0.000000 0.124019 0.002616 0.873365 0.009381 0.005570 0.978599 0.006450 0.099760 0.527861 0.113841 0.258538 0.142301 0.650689 0.111744 0.095267 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0823.1 MOTIF MA0649.1 HEY2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2107 E= 0 0.050783 0.046986 0.854295 0.047935 0.361667 0.169444 0.344444 0.124444 0.041481 0.888889 0.040988 0.028642 0.933610 0.000000 0.066390 0.000000 0.003874 0.996126 0.000000 0.000000 0.014218 0.037915 0.947867 0.000000 0.018405 0.061350 0.000000 0.920245 0.000000 0.018240 0.965665 0.016094 0.025278 0.529323 0.064712 0.380688 0.158333 0.482778 0.212222 0.146667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0649.1 MOTIF MA0191.1 HGTX letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.200000 0.100000 0.150000 0.550000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.050000 0.000000 0.300000 0.650000 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0191.1 MOTIF MA0183.1 HHEX letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 26 E= 0 0.269231 0.115385 0.076923 0.538462 0.000000 0.269231 0.000000 0.730769 0.000000 0.230769 0.269231 0.500000 0.807692 0.000000 0.076923 0.115385 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.115385 0.115385 0.769231 0.269231 0.000000 0.038462 0.692308 0.846154 0.000000 0.153846 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0183.1 MOTIF UN0309.1 HHEX letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1925 E= 0 0.260260 0.314286 0.177143 0.248312 0.379740 0.108571 0.092987 0.418701 0.343377 0.182338 0.331948 0.142338 0.775065 0.021818 0.082078 0.121039 0.081039 0.019740 0.868571 0.030649 0.025455 0.807792 0.013506 0.153247 0.969351 0.010909 0.004675 0.015065 0.956364 0.022857 0.009351 0.011429 0.957922 0.007273 0.006234 0.028571 0.004675 0.857662 0.011429 0.126234 0.958961 0.012468 0.011948 0.016623 0.248831 0.203636 0.265455 0.282078 0.315844 0.176104 0.199481 0.308571 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0309.1 MOTIF MA1390.1 HHO2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 600 E= 0 0.183333 0.058333 0.668333 0.090000 0.493333 0.080000 0.215000 0.211667 0.735000 0.011667 0.076667 0.176667 0.073333 0.146667 0.028333 0.751667 0.150000 0.638333 0.041667 0.170000 0.335000 0.213333 0.213333 0.238333 0.526667 0.151667 0.135000 0.186667 0.815000 0.016667 0.085000 0.083333 0.010000 0.005000 0.840000 0.145000 0.996667 0.003333 0.000000 0.000000 0.028333 0.006667 0.000000 0.965000 0.105000 0.085000 0.043333 0.766667 0.008333 0.991667 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1390.1 MOTIF MA1386.1 HHO3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0 0.437396 0.068447 0.467446 0.026711 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.974958 0.000000 0.001669 0.023372 0.998331 0.000000 0.000000 0.001669 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.383973 0.616027 0.000000 0.000000 0.010017 0.000000 0.015025 0.974958 0.133556 0.061770 0.078464 0.726210 0.153589 0.524207 0.156928 0.165275 0.275459 0.171953 0.242070 0.310518 0.365609 0.078464 0.257095 0.298831 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1386.1