MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0153.2 HNF1B letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 35025 E= 0 0.043626 0.029408 0.880485 0.046481 0.015297 0.072160 0.040547 0.871996 0.140396 0.084924 0.019063 0.755617 0.985303 0.000415 0.012716 0.001566 0.941534 0.035507 0.004274 0.018685 0.057757 0.024036 0.001961 0.916246 0.210844 0.299501 0.312147 0.177508 0.947173 0.002242 0.018428 0.032157 0.038722 0.012175 0.046507 0.902596 0.002533 0.021054 0.000032 0.976381 0.770532 0.019839 0.131699 0.077930 0.888809 0.042424 0.057065 0.011701 0.053668 0.513117 0.021737 0.411477 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0153.2 MOTIF MA0114.1 HNF4A letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 67 E= 0 0.417910 0.104478 0.402985 0.074627 0.029851 0.029851 0.835821 0.104478 0.179104 0.059701 0.522388 0.238806 0.074627 0.343284 0.298507 0.283582 0.044776 0.761194 0.059701 0.134328 0.880597 0.014925 0.044776 0.059701 0.791045 0.029851 0.149254 0.029851 0.835821 0.014925 0.119403 0.029851 0.059701 0.059701 0.865672 0.014925 0.089552 0.029851 0.492537 0.388060 0.044776 0.328358 0.164179 0.462687 0.059701 0.731343 0.074627 0.134328 0.626866 0.104478 0.149254 0.119403 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0114.1 MOTIF MA0114.2 HNF4A letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 16768 E= 0 0.164957 0.356095 0.236999 0.241949 0.103232 0.042939 0.054091 0.799738 0.049917 0.003042 0.942867 0.004175 0.362297 0.110091 0.499165 0.028447 0.657562 0.263896 0.019621 0.058922 0.006978 0.986104 0.003996 0.002922 0.001551 0.097209 0.000000 0.901240 0.010615 0.157264 0.021887 0.810234 0.000000 0.010317 0.024272 0.965410 0.051527 0.002087 0.938752 0.007634 0.314289 0.223342 0.318464 0.143905 0.364921 0.337130 0.099117 0.198831 0.068941 0.804568 0.020992 0.105499 0.111522 0.387524 0.024750 0.476205 0.123449 0.384661 0.178972 0.312917 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0114.2 MOTIF MA0114.4 HNF4A letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 46504 E= 0 0.216024 0.153449 0.299007 0.331520 0.210477 0.310403 0.199854 0.279266 0.031567 0.891171 0.026600 0.050662 0.931554 0.027030 0.022815 0.018601 0.864807 0.029460 0.077735 0.027998 0.930329 0.011698 0.040792 0.017181 0.015397 0.019697 0.936006 0.028901 0.019934 0.014945 0.046964 0.918158 0.059565 0.812919 0.039265 0.088250 0.029309 0.910481 0.013827 0.046383 0.788190 0.059823 0.063134 0.088853 0.291889 0.212089 0.279847 0.216175 0.328552 0.195037 0.251892 0.224518 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0114.4 MOTIF MA1494.1 HNF4A(var.2) letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 650 E= 0 0.326154 0.107692 0.500000 0.066154 0.452632 0.010526 0.526316 0.010526 0.004525 0.003017 0.981900 0.010558 0.002981 0.001490 0.025335 0.970194 0.111607 0.726562 0.045759 0.116071 0.010340 0.961595 0.005908 0.022157 0.989362 0.000000 0.010638 0.000000 0.990868 0.001522 0.003044 0.004566 0.992378 0.000000 0.007622 0.000000 0.000000 0.000000 0.998466 0.001534 0.004178 0.000000 0.906685 0.089136 0.000000 0.005891 0.035346 0.958763 0.002878 0.936691 0.010072 0.050360 0.699248 0.007519 0.279699 0.013534 0.267281 0.333333 0.155146 0.244240 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1494.1 MOTIF MA0484.1 HNF4G letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 9452 E= 0 0.371773 0.197207 0.212759 0.218261 0.344795 0.161976 0.405205 0.088024 0.496826 0.010791 0.403195 0.089187 0.116695 0.021265 0.791367 0.070673 0.205671 0.075434 0.349238 0.369657 0.159860 0.303639 0.241113 0.295387 0.000000 0.933876 0.023381 0.042742 0.988468 0.005819 0.005713 0.000000 0.834638 0.008675 0.156686 0.000000 0.895472 0.000000 0.099238 0.005290 0.010474 0.000635 0.962548 0.026344 0.034278 0.015129 0.383411 0.567182 0.023804 0.458950 0.117118 0.400127 0.016822 0.886267 0.008993 0.087918 0.717837 0.084003 0.058824 0.139336 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0484.1 MOTIF MA0484.2 HNF4G letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 18222 E= 0 0.210899 0.152892 0.305126 0.331083 0.200582 0.310614 0.209637 0.279168 0.023817 0.904840 0.022994 0.048348 0.933542 0.024641 0.025025 0.016793 0.861815 0.027824 0.086489 0.023872 0.930908 0.009439 0.042202 0.017451 0.011415 0.018055 0.944737 0.025793 0.015201 0.012457 0.046153 0.926188 0.061354 0.818626 0.038250 0.081769 0.030952 0.905224 0.012403 0.051421 0.771211 0.065306 0.071287 0.092196 0.274833 0.223521 0.292284 0.209362 0.318955 0.204039 0.255845 0.221161 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0484.2 MOTIF MA1495.1 HOXA1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 7406 E= 0 0.157575 0.302998 0.360113 0.179314 0.000000 0.172699 0.000000 0.827301 0.690021 0.194074 0.115904 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.119297 0.206265 0.674438 0.824538 0.000000 0.175462 0.000000 0.158677 0.379608 0.302093 0.159622 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1495.1 MOTIF MA0899.1 HOXA10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 8382 E= 0 0.276187 0.169769 0.357075 0.196970 0.174410 0.126367 0.602776 0.096447 0.017803 0.449965 0.006865 0.525367 0.563391 0.303576 0.068701 0.064332 0.853375 0.046329 0.073109 0.027187 0.041900 0.001256 0.000000 0.956844 0.694072 0.009782 0.014091 0.282054 0.944125 0.004055 0.008561 0.043258 0.891122 0.060393 0.013291 0.035194 0.595199 0.147859 0.110788 0.146154 0.359981 0.249254 0.146761 0.244004 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0899.1 MOTIF MA0650.1 HOXA13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 384 E= 0 0.161458 0.643229 0.184896 0.010417 0.002625 0.648294 0.020997 0.328084 0.669377 0.189702 0.024390 0.116531 0.888489 0.000000 0.000000 0.111511 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.894928 0.032609 0.018116 0.054348 0.939163 0.000000 0.000000 0.060837 0.988000 0.012000 0.000000 0.000000 0.641558 0.155844 0.114286 0.088312 0.421053 0.291498 0.093117 0.194332 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0650.1